1、該文介紹了放線菌和嗜酸放線菌的分類學研究進展,研究了中國酸性土壤中稀有放線菌的生物多樣性,并采用以分子分類、系統(tǒng)發(fā)育學分析、化學分類、形態(tài)特征和生理生化特性相結合的多相分類方法對3株土壤新分離菌株進行了分類學研究.實驗中,從江西、云南、北京采集的10份酸性土樣,采用分散和差速離心法和常規(guī)分離方法分離出嗜酸放線菌252株.研究表明,其中90%以上為鏈霉菌.通過形態(tài)觀察、pH梯度生長實驗和細胞壁化學組分分析篩選出稀有放線菌代表菌株20株,對

2、它們做了ARDRA分析和16S rDNA序列分析.ARDRA分析表明,它們呈11種不同的圖譜類型,其中9株的圖譜相同,另外4株的圖譜與之差異不大,而其余7株的圖譜與之差異很大且各不相同.16S rDNA序列分析表明,20株稀有放線菌中的18株分別屬于6個已知屬,其中13株屬于諾卡氏菌屬(Nocardia),它們在系統(tǒng)發(fā)育樹上處于多個進化分枝;各有1株分別屬于壤球菌屬(Agrococcus)、節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)、北里孢菌

3、屬(Kitasatospora)、考克斯菌屬(Kocuria)和嗜酸鏈霉菌屬(Streptacidiphilus);其余2株是迄今尚未定名的一個新科("Ellin5034 group")中的成員.實驗結果顯示,酸性土壤中的嗜酸稀有放線菌具有較豐富的種屬多樣性,其中諾卡氏菌屬(Nocardia)是一優(yōu)勢菌群.20株稀有放線菌的16S rDNA序列分析表明,分離菌株117、43401和12202與其相關種之間具有相對低的序列相似性,被選擇以

4、進行進一步的多相分類研究.在以16SrDNA序列為基礎的系統(tǒng)發(fā)育樹上,菌株117和43401在諾卡氏菌屬的輻射分枝范圍內形成單獨的兩個兩枝.其中,菌株117的16S rDNA序列與Nocardia pseudobrasiliensis ATCC 51512<'T>最相近(序列相似性98.2%);菌株43401的16S rDNA序列與Nocardia nova JCM 6044<'T>最相近(序列相似性98.7%).在以16S rDNA序

5、列為基礎的系統(tǒng)發(fā)育樹上,菌株12202和一個迄今尚未定名、尚未生效發(fā)表的新科("Ellin5034 group")的5個成員形成緊密相關的單獨分枝,菌株12202的16S rDNA序列與該新科成員的序列相似性最高達99.4%.DNA同源性分析結果也表明,菌株117和43401都是諾卡氏菌屬中的新種,建議分別定名為密云諾卡氏菌(Nocardia miyunensis sp.nov.)和江西諾卡氏(Nocardia jiangxiensis