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![水稻Rho GTP酶激活蛋白編碼基因OsRhoGAP1的特征分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/9/7ca6b724-ca4f-4080-b6d8-0f938994ca68/7ca6b724-ca4f-4080-b6d8-0f938994ca681.gif)
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文檔簡介
1、水稻OsRhoGAP1和OsRhoGAP2是通過酵母雙雜交篩選到的與水稻Rop蛋白OsRacD相互作用蛋白的編碼基因。前期研究提示,OsRacD可能參與水稻育性調(diào)控。為了研究OsRhoGAP1基因在水稻生長發(fā)育過程中的作用,本研究分析比較了兩種OsRhoGAPs基因的序列特征以及在水稻不同發(fā)育階段的表達特性,進一步分析了OsRhoGAP1的表達與外源植物激素的關系,預測和分析了該基因的啟動子序列,構建了OsRhoGAP1的植物過表達載體
2、,并轉化水稻,篩選陽性轉基因植株,為深入研究OsRhoGAP1的功能及調(diào)控機制奠定基礎。
采用生物信息學方法對OsRhoGAP1和OsRhoGAP2進行了序列特征分析和比較。水稻基因組序列數(shù)據(jù)庫的檢索顯示,OsRhoGAP1和OsRhoGAP2分別定位于12號和2號染色體上,兩個基因具有相似的基因結構,都包含5個外顯子和4個內(nèi)含子。OsRhoGAP1的cDNA編碼區(qū)全長1353bp,編碼450個氨基酸和1個終止密碼,OsRho
3、GAP2的cDNA編碼區(qū)全長1320bp的編碼框,編碼439個氨基酸和1個終止密碼。兩個基因編碼蛋白都具有植物RhoGAP/RopGAP蛋白保守的序列特征,即含有RhoGAP和CRIB兩個保守結構域,但在N端和C端序列的差異較大。系統(tǒng)進化分析顯示,OsRhoGAP1與水稻OsRacGAP3相似性最高,OsRhoGAP2與玉米ZmRacGAP2相似性最高。
采用實時定量PCR技術分析了OsRhoGAP1和OsRhoGAP2在水稻
4、不同發(fā)育階段的組織表達特性,結果顯示,這兩個基因在水稻不同發(fā)育階段均顯示廣泛表達的特征,并且二者的組織表達特性具有一致性,主要在細胞分裂旺盛的幼葉、幼根、幼穗,以及成熟根中高表達,提示它們可能參與了水稻相關生長、發(fā)育、分化等過程。然而,OsRhoGAP1和OsRhoGAP2在特定發(fā)育階段的表達量存在差異,提示它們可能各自具有獨特的功能。
數(shù)據(jù)庫檢索和預測提示,OsRhoGAP1啟動區(qū)含有光、植物激素、非生物脅迫應答的元件。為確
5、定激素對該基因表達的影響,采用實時定量PCR技術分析了6種植物激素對OsRhoGAP1表達的影響,結果顯示,ABA、SA、MeJA使OsRhoGAP1的表達先上調(diào)至3~4.1倍后出現(xiàn)下調(diào),GA使之出現(xiàn)大幅度上調(diào),最大幅度為6.4倍,而IAA和6-BA則使之迅速下調(diào)至0.2~0.3倍。說明該基因的表達受到多種植物激素信號的調(diào)控,尤其以GA、IAA和6-BA對該基因表達的影響最為顯著。
為了通過轉基因技術鑒定OsRhoGAP1基因
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