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文檔簡(jiǎn)介
1、基于當(dāng)前不斷加劇的環(huán)境壓力,對(duì)退化土地進(jìn)行合理開發(fā)及高效利用的重要性已日益凸顯。針對(duì)退化土地的恢復(fù)及利用,不僅依靠種植高抗逆性植物,更有必要了解其適應(yīng)性機(jī)理,不斷發(fā)掘基因資源并加以利用才能夠有效緩解日益嚴(yán)重的土地資源危機(jī)。本實(shí)驗(yàn)以荒漠植物羅布麻(Apocynum venetumL)為材料,采用反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)、末端黏??焖贁U(kuò)增(Rapid-amplification of cDNA ends)等方法從羅布麻中擴(kuò)增出查爾酮合成
2、酶(CHS)編碼基因的cDNA序列,開展羅布麻不同構(gòu)件查爾酮合成酶基因表達(dá)量半定量分析,并綜合現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)資源通過(guò)生物信息學(xué)手段對(duì)查爾酮合成酶基因進(jìn)行分子進(jìn)化研究,得到以下結(jié)論:
1.AvCHS的克隆。查爾酮合成酶是羅布麻所含類黃酮類物質(zhì)合成前體及與抗性相關(guān)次生代謝產(chǎn)物合成關(guān)鍵酶,克隆得到的羅布麻查爾酮合成酶基因被定名為AvCHS,AvCHS的cDNA全長(zhǎng)為1476bp,包含一個(gè)完整的開放閱讀框(Open reading fra
3、me),長(zhǎng)度為1170bp,推測(cè)其編碼的氨基酸序列全長(zhǎng)為389個(gè)氨基酸殘基。
2.AvCHS同源性分析。AvCHS與漆樹科鹽膚木及薔薇科植物歐洲李CHS基因序列一致性較高,現(xiàn)已克隆得到的大部分CHS基因核苷酸序列均與AvCHS具有78%以上一致性。CHS基因在高等植物之間具備很高的保守性。
3.羅布麻不同構(gòu)件AvCHS表達(dá)半定量分析。通過(guò)RT-PCR,以18S rDNA PCR產(chǎn)物作為內(nèi)標(biāo),對(duì)羅布麻植株根、莖、葉和花
4、不同構(gòu)件AvCHS基因表達(dá)量進(jìn)行半定量分析。測(cè)定結(jié)果表明:羅布麻植株中,花構(gòu)件AvCHS基因表達(dá)量最高,根、葉構(gòu)件次之。因而,羅布麻的強(qiáng)生態(tài)適應(yīng)性及其經(jīng)濟(jì)價(jià)值與AvCHS基因表達(dá)量均有直接關(guān)系。
4.AvCHS分子進(jìn)化。在完成AvCHS完整序列測(cè)定基礎(chǔ)上,比對(duì)相關(guān)植物CHS基因序列,通過(guò)矩陣距離法構(gòu)建CHS基因系統(tǒng)進(jìn)化樹。對(duì)核苷酸、氨基酸系統(tǒng)進(jìn)化樹的生物信息學(xué)分析表明:AvCHS屬于CHS超基因家族,與參試CHS序列的相似性系
5、數(shù)最高達(dá)到92%; CHS超基因家族在其進(jìn)化過(guò)程中分化為2個(gè)亞家族,2大亞家族之間遺傳距離為0.048,AvCHS屬于第Ⅰ大亞家族。參與比較的所有CHS基因,其編碼的氨基酸具備較高的同源性。AvCHS所屬Ⅰ大類可依據(jù)遺傳距離定義出十余個(gè)不同植物蛋白分異類群??梢酝茢郈HS蛋白其總體結(jié)構(gòu)較為保守,少部分在環(huán)境因子影響下呈現(xiàn)出細(xì)微的結(jié)構(gòu)、功能差異。
研究結(jié)果明確了羅布麻查爾酮合成酶基因結(jié)構(gòu),對(duì)其在CHS基因家族中的歸屬進(jìn)行了劃分。
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