1、種質(zhì)資源遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)的分析是進行復(fù)雜性狀關(guān)聯(lián)分析的前提條件。本文從140對SSR引物中篩選到16對多態(tài)性引物，對82份苜蓿(Medicago spp.)材料進行產(chǎn)量性狀差異的分析、遺傳多樣性與群體結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果如下:
　　1.在揚州地區(qū)，苜蓿一年刈割了3茬，生長天數(shù)分別為65天、40天、35天，所有參試材料都能夠正常的生長。苜蓿在整個生長過程中冬季不枯黃，但停止生長。不同苜蓿品種（系）的初花期相差1天至10天。
　　

2、2.苜蓿材料不同茬次的平均生長高度為第三茬＞第一茬＞第二茬，全年生長高度最高的是Creno，最矮的是CUF101。苜蓿種質(zhì)資源不同茬次的干草產(chǎn)量為第一茬＞第三茬＞第二茬。全年草產(chǎn)量最高的是多侖、最低的是草原2號。
　　3.對苜蓿種質(zhì)產(chǎn)量性狀的特點分析表明，參試苜蓿品種（系）的遺傳變異非常豐富。8個產(chǎn)量相關(guān)性狀有較為豐富的變異，變異系數(shù)為第三茬干草產(chǎn)量＞分枝數(shù)＞第一茬干草產(chǎn)量＞第二茬干草產(chǎn)量＞第三茬刈割高度＞第二茬刈割高度＞第一茬刈

3、割高度＞鮮干比。在82份苜蓿材料中變異系數(shù)最大的是多侖，為23.46，變異系數(shù)最小的是1075，為6.05。
　　4.篩選的16對SSR引物在82份苜蓿種質(zhì)材料中共檢測到190個等位變異，平均每對引物檢測到11.88個，平均多態(tài)性比率為83.05％，范圍從66.67-100％;平均基因多樣性為0.2577，從0.1477-0.3637;平均多態(tài)信息量變化范圍從0.0079-0.9432，平均為0.5501。
　　5.對82份

4、苜蓿材料的群體結(jié)構(gòu)進行分析，當K（類群數(shù)）=5時，似然值最大，因此將參試材料劃分五大類群。以Q值=0.5為劃分標準，由于82份苜蓿材料中的62份材料(占75.61％)在5個類群中的Q值大于或等于0.5，遺傳基礎(chǔ)比較單一，分到了某一個類群中;而其余的20份苜蓿材料（占24.39％）在每一類群中的Q值均小于0.5，遺傳結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜，分到了混合群體中。劃入特定類群中的62份材料，在各類群中占的比例分別為15.85％、8.54％、9.76％、2

5、6.27％、12.20％。苜蓿種質(zhì)資源主成分分析與Structure遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果相一致。不同類群的遺傳多樣性比較結(jié)果顯示，類群1遺傳多樣性水平最高，其次是類群2、類群3，類群4、類群5的遺傳多樣性水平相對較低。
　　6.不同類群的苜蓿種質(zhì)資源生長差異很大，類群1產(chǎn)量高、分枝數(shù)多;類群2株高較矮，產(chǎn)量較低;類群3生長高度最矮;類群4植株生長高度高，分枝數(shù)少，鮮干比大，產(chǎn)量最低;類群5分枝數(shù)較少，鮮干比較小。不同類群的秋眠級類群5