節(jié)節(jié)麥抗旱性種質(zhì)資源篩選及其轉(zhuǎn)錄組分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、節(jié)節(jié)麥(Aegilops tauschii,2n=2x=14,DD)是普通小麥D基因組的供體種,多生長在沙漠邊緣,荒地,丘陵等極其惡劣的環(huán)境,天然抗逆性極強(qiáng)。本研究通過對節(jié)節(jié)麥的抗旱性鑒定,得到耐旱性最強(qiáng)的X J002和耐旱性最弱的XJ098,苗期將它們進(jìn)行20% PEG(聚乙二醇)模擬干旱處理,同對照組(正常生長)的葉片組織總RNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。系統(tǒng)闡明節(jié)節(jié)麥干旱脅迫下可能涉及的途徑,分析干旱脅迫前后的差異表達(dá)基因,找出XJ002和

2、XJ098在基因表達(dá)調(diào)控上的差異,確定可能參與干旱脅迫調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵候選基因。本研究旨在揭示節(jié)節(jié)麥的耐旱機(jī)理,并為小麥抗旱育種提供基因資源,主要工作包括以下幾方面。
  1.利用20% PEG-6000高滲溶液,對155份新疆和河南地區(qū)的節(jié)節(jié)麥進(jìn)行芽期干旱模擬試驗,依據(jù)胚芽鞘長度指標(biāo),大批量篩選獲得了不同抗旱表型節(jié)節(jié)麥材料。選取兩個地區(qū)胚芽鞘處理長度相對較長,中等和較短的六份材料,二次干旱復(fù)水法統(tǒng)計干旱存活率,以存活率高低作為衡量

3、抗旱性強(qiáng)弱的標(biāo)準(zhǔn),鑒定得到抗旱性最強(qiáng)的XJ002(干旱存活率:92.5%)和抗旱性最弱的XJ098(干旱存活率:56.5%)。
  2.為了從表型及生理生化指標(biāo)方面比較XJ002和XJ098的抗旱性差異,測定了XJ002和XJ098正常生長狀態(tài)下的根長,以及PEG脅迫不同時間下的生理生化指標(biāo),包括ABA(脫落酸)含量、Pro(脯氨酸)含量、WSS(可溶性糖)含量、MDA(丙二醛)含量、POD(過氧化物酶)和PPO(多酚氧化酶)的酶

4、活力、葉片滲透介質(zhì)相對電導(dǎo)率的測定。其中ABA合成的積累差異較明顯,且各項指標(biāo)均反映出XJ002的抗旱性優(yōu)于XJ098。
  3.為了找到ABA含量差異的原因,同源克隆節(jié)節(jié)麥的NCED基因,NCED是ABA合成途徑的關(guān)鍵酶??寺〉玫焦?jié)節(jié)麥NCED1基因的1848 bp CDS序列,無內(nèi)含子,具有NCED蛋白的典型結(jié)構(gòu)域,但XJ002和XJ098的NCED1基因序列完全一致,說明其抗旱性差異與該基因序列無關(guān)。RT-PCR結(jié)果顯示,隨

5、著PEG模擬干旱脅迫程度的增大,節(jié)節(jié)麥NCED1基因的表達(dá)量呈先上調(diào)后下調(diào)的趨勢,表明NCED1基因可能參與旱脅迫響應(yīng)的調(diào)控。
  4.將苗期的XJ002和J098用20% PEG處理8h(此時在表型上XJ098葉片開始出現(xiàn)萎蔫,XJ002無明顯變化),此時分別將它們和對照組(正常生長)的葉片組織總RNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,總共四組樣本,每組三個生物學(xué)重復(fù)。測序獲得59.74 G數(shù)據(jù)量,reads數(shù)295.79 M,Q30(堿基錯誤率

6、為1‰)達(dá)到80%以上,各樣品reads與參考基因組比對效率在70%以上,發(fā)掘新基因3854個,并優(yōu)化了基因組結(jié)構(gòu),統(tǒng)計了SNP位點,確定了節(jié)節(jié)麥以外顯子跳躍為主的六種可變剪切模式。同時,F(xiàn)old change方法篩選分析了樣本組間差異表達(dá)基因,確定了107個可能參與干旱脅迫響應(yīng)的關(guān)鍵候選基因,并對所有差異表達(dá)基因完成了模式聚類、功能注釋以及富集性分析。轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示,NCED1基因的表達(dá)量受干旱脅迫的誘導(dǎo)高水平表達(dá),但在旱脅迫后,

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