基于SSR的玉米、水稻紋枯病菌(Rhizoctonia solani AG1-IA)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析.pdf_第1頁(yè)
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1、立枯絲核菌(Rhizoctonia,solani)寄主范圍廣泛,可侵染危害250多種植物。R.solani是一個(gè)復(fù)合種,該種至少包括14個(gè)融合群,每個(gè)融合群又可分為不同的融合亞群。R。solaniAG1-IA屬于AG1融合群的IA亞群,該真菌可危害玉米、水稻和大豆等多種植物,在玉米和水稻形成典型的紋枯病癥狀,是玉米和水稻紋枯病的優(yōu)勢(shì)致病類(lèi)群。R.solaniAG1-IA群體結(jié)構(gòu)組成和變化對(duì)該類(lèi)病害的發(fā)生和流行起著非常重要的作用。本研究中

2、,我們利用SSR分子標(biāo)記,對(duì)我國(guó)8個(gè)省104株R.solaniAG1-IA玉米分離物和山東和廣東4個(gè)主要產(chǎn)稻區(qū)的61個(gè)R.solaniAG1-IA分離物的群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,旨在明確AG1-IA群體在不同地區(qū)間的遺傳多樣性組成及演化動(dòng)態(tài),希望為進(jìn)一步制定玉米和水稻紋枯病的綜合治理措施提供理論依據(jù)。
   1.紋枯病菌采集、分離及融合群確定
   從安徽、江蘇、陜西、河南、山東、河北、遼寧、吉林等8個(gè)省31個(gè)地區(qū),采集

3、具有典型紋枯病癥狀的標(biāo)本,經(jīng)分離培養(yǎng),通過(guò)菌絲融合測(cè)定、ITS序列測(cè)定等鑒定所屬的融合群,將104株鑒定為AG1-IA的玉米分離物用于本研究。從山東臨沂、東營(yíng)和濟(jì)陽(yáng)采集標(biāo)本,經(jīng)分離培養(yǎng),通過(guò)菌絲融合測(cè)定、ITS序列測(cè)定等鑒定所屬的融合群,將51株鑒定為AG1-IA的水稻分離物用于本研究,還有10株來(lái)自廣東的菌株。
   2.R.solaniAG1-IA玉米分離物的致病性分化
   對(duì)104株AG1-IA玉米分離物進(jìn)行離體

4、葉片致病力測(cè)定,采用DPS系統(tǒng)進(jìn)行UPGMA聚類(lèi)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)所有菌株被分為3個(gè)類(lèi)型。強(qiáng)致病力菌株有29株,包括LY1-3-1、YWK-195、和SZ002-19等,弱致病力菌株11株,64株表現(xiàn)為中等致病力。結(jié)果還發(fā)現(xiàn),各菌株的致病力與地理來(lái)源之間沒(méi)有明顯的相關(guān)性,各地的菌株均存在不同程度的致病力分化,在不同地區(qū)隨機(jī)分布。
   3.R.solaniAG1-IA玉米分離物遺傳多樣性分析
   利用10對(duì)引物對(duì)8個(gè)省份的

5、104株玉米紋枯病菌進(jìn)行SSR分析,共檢測(cè)到36條多態(tài)性條帶,每對(duì)引物可檢測(cè)到2~5條多態(tài)性條帶。采用UPMGA法進(jìn)行SSR聚類(lèi)分析發(fā)現(xiàn),104株AG1-IA菌株在0.57到1.00不同的遺傳相似系數(shù)范圍內(nèi),被分為不同的聚類(lèi)組,結(jié)果表明,R.solaniAG1-IA玉米分離物存在豐富的遺傳多樣性,SSR分組與菌株的地理來(lái)源沒(méi)有明顯的相關(guān)性。
   Nei's遺傳多樣性指數(shù)在江蘇和安徽為最高,分別為0.4544和0.4630,Sh

6、annon's指數(shù)在江蘇和安徽為最高,分別為0.8402和0.8001,表明來(lái)自江蘇和安徽的玉米紋枯病菌種群的遺傳結(jié)構(gòu)相對(duì)于其他地區(qū)較復(fù)雜。其中,來(lái)自安徽和河北的菌株遺傳距離最大,來(lái)自吉林和河南的遺傳距離最小。
   對(duì)群體的遺傳分化進(jìn)行分析,群體間和群體內(nèi)都存在著一定的遺傳分化,群體間的變異約占總變異的24.6%,群體內(nèi)變異約占總變異的75.4%,因此,遺傳變異主要發(fā)生在群體內(nèi)。
   4.R.solaniAG1-IA

7、水稻分離物遺傳多樣性分析
   利用10對(duì)SSR引物對(duì)山東3個(gè)水稻產(chǎn)區(qū)的51株AG1-IA水稻分離物和10株廣州分離物進(jìn)行SSR遺傳多樣性分析,共檢測(cè)到32條多態(tài)性條帶,每對(duì)引物能擴(kuò)增出2~5條多態(tài)性條帶。采用UPMGA法進(jìn)行SSR聚類(lèi)分析結(jié)果表明,61個(gè)分離物在0.50到1.00遺傳相似系數(shù)范圍內(nèi),被分為不同聚類(lèi)組。來(lái)自不同地區(qū)的水稻紋枯病菌,多以地理來(lái)源聚為一類(lèi),表明SSR分組與菌株的地理來(lái)源有一定的相關(guān)性。
  

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