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![小麥揉混特性和溶劑保持力的全基因組關(guān)聯(lián)分析.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/9/bf568b78-9ff1-4a2e-bdd2-b170d64280dc/bf568b78-9ff1-4a2e-bdd2-b170d64280dc1.gif)
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文檔簡(jiǎn)介
1、小麥(Triticum aestivum L.)是世界上主要糧食作物之一。隨著生活水平的提高,人們對(duì)用來(lái)制作主食的面粉的品質(zhì)要求越來(lái)越高。因此,研究小麥主要品質(zhì)特性,挖掘控制品質(zhì)的遺傳基因,明確基因與性狀之間的關(guān)系是獲得優(yōu)質(zhì)小麥品種的前提。
本研究選取205份中國(guó)冬麥區(qū)20世紀(jì)80年代以來(lái)的推廣品種或骨干親本構(gòu)建自然群體,并以該群體作為實(shí)驗(yàn)材料,利用小麥90K SNP基因芯片技術(shù)構(gòu)建完成的復(fù)合遺傳圖譜,對(duì)小麥揉混特性和溶劑保持
2、力進(jìn)行相關(guān)性分析和全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association study,GWAS)。研究結(jié)果如下:
1.表型分析:對(duì)揉混特性的表型變異分析表明,除峰值時(shí)間和峰值寬度,其他揉混特性參數(shù)在兩環(huán)境中表現(xiàn)出明顯差異。各性狀的變異系數(shù)表現(xiàn)不同,其中曲線(xiàn)尾寬、8分鐘帶寬,峰值時(shí)間揉混左斜率和右斜率的變異系數(shù)均超過(guò)20%,其他揉混參數(shù)的變異系數(shù)在9.7%-20%之間。說(shuō)明本研究群體在揉混特性上具有比較豐富的遺傳變異,
3、利用現(xiàn)有種質(zhì)資源對(duì)冬小麥的品質(zhì)性狀改良具有較大潛力。對(duì)溶劑保持力的表型變異分析表明,四種溶劑保持力(蔗糖SRC,碳酸鈉SRC,乳酸SRC,水SRC)在兩環(huán)境中表現(xiàn)出明顯差異。各性狀的變異系數(shù)表現(xiàn)不同,其中乳酸SRC和水SRC(E1)的變異系數(shù)均超過(guò)10%,其他性狀的變異系數(shù)范圍是7.9-9.11%,說(shuō)明溶劑保持力的遺傳改良潛力一般。
2.揉混特性的關(guān)聯(lián)分析:通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析,在p<0.001水平(顯著水平),兩個(gè)環(huán)境下共檢
4、測(cè)到415個(gè)與小麥揉混特性關(guān)聯(lián)的標(biāo)記/性狀關(guān)聯(lián)( marker- trait association,MTA)位點(diǎn),分布在小麥20條染色體上,單個(gè)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)表型變異貢獻(xiàn)率(R2)范圍為5.19–16.3%。本研究在1B和1D染色體上檢測(cè)到多個(gè)控制揉混特性的重要位點(diǎn)。其中位于1B染色體上的位點(diǎn) BS00022851_51、 Excalibur_c40993_1129和RFL_Contig2826_548是同時(shí)控制兩個(gè)揉混參數(shù)的多效性基因位點(diǎn)
5、,且三者距離相近。在1D染色體上檢測(cè)到的顯著多效性關(guān)聯(lián)位點(diǎn)高達(dá)30個(gè),其中位點(diǎn)D_GA8KES401EYUM8_190同時(shí)控制峰值時(shí)間和曲線(xiàn)尾寬,且在兩環(huán)境中穩(wěn)定表達(dá),對(duì)峰值時(shí)間的表型貢獻(xiàn)率為15.9%;位點(diǎn)GENE-0511_161同時(shí)控制峰值時(shí)間、8分鐘帶高和曲線(xiàn)尾高三個(gè)性狀,對(duì)峰值時(shí)間的表型變異貢獻(xiàn)率高達(dá)16.3%,是主效位點(diǎn);位點(diǎn)GENE-0511_484和 Kukri_c6051_640同時(shí)控制峰值時(shí)間、曲線(xiàn)尾高和8分鐘帶高三
6、個(gè)揉混參數(shù),對(duì)峰值時(shí)間的貢獻(xiàn)率高達(dá)15.92%,是在兩環(huán)境中穩(wěn)定表達(dá)的主效位點(diǎn);位點(diǎn)BS00021702_51同時(shí)控制峰值時(shí)間、8分鐘帶高、8分鐘帶寬和曲線(xiàn)尾高四個(gè)性狀,表型變異貢獻(xiàn)率高達(dá)16.3%,是在兩個(gè)環(huán)境中穩(wěn)定表達(dá)的主效位點(diǎn)。
3.溶劑保持力的關(guān)聯(lián)分析:通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析,在p<0.001水平(顯著水平),兩個(gè)環(huán)境下共檢測(cè)到313個(gè)與溶劑保持力特性相關(guān)的關(guān)聯(lián)位點(diǎn),分布在小麥19條染色體上。位于6A染色體上控制蔗糖SR
7、C的位點(diǎn)GENE-3780_131是在E2環(huán)境下檢測(cè)到的主效位點(diǎn),表型貢獻(xiàn)率高達(dá)20.0%;位于1D染色體上的主效位點(diǎn)BS00021851_51,對(duì)乳酸SRC表型變異貢獻(xiàn)率為12.4%;位點(diǎn)IAAV1634是控制水SRC的顯著和相對(duì)穩(wěn)定(至少在兩個(gè)環(huán)境中檢測(cè)到)位點(diǎn),貢獻(xiàn)率為5.98-7.87%。在E1環(huán)境中檢測(cè)到的位點(diǎn)RFL_Contig29_1062和BS00094342_51的表型變異貢獻(xiàn)率分別為10.11%和10.85%,均大于
8、10%,是主效位點(diǎn)。與水SRC關(guān)聯(lián)的大多數(shù)位點(diǎn)只在E1環(huán)境中檢測(cè)到,且貢獻(xiàn)率普遍較低。檢測(cè)到7個(gè)控制碳酸鈉SRC的主效位點(diǎn),位于7A染色體上的位點(diǎn)IACX72和wsnp_Ex_c15988_24402251具有最高表型變異貢獻(xiàn)率,為11.1%;位點(diǎn)BS00000010_51在E2環(huán)境中檢測(cè)到,其他位點(diǎn)都在E1環(huán)境中檢測(cè)到。檢測(cè)到27個(gè)控制蔗糖SRC的主效位點(diǎn),表型變異貢獻(xiàn)率大于10%,分布在1B、2B、5A和7A染色體上。
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9、.多效性關(guān)聯(lián)位點(diǎn)分析:本研究在控制小麥揉混特性與溶劑保持力的關(guān)聯(lián)位點(diǎn)中發(fā)現(xiàn)了9個(gè)SNP標(biāo)記同時(shí)與小麥揉混特性和溶劑保持力相關(guān)聯(lián)。其中同時(shí)控制8分鐘帶寬和蔗糖 SRC的標(biāo)記最多,均為位于5A染色體上的相對(duì)穩(wěn)定位點(diǎn)。位點(diǎn)GENE-3780_131同時(shí)與8分鐘帶高、8分鐘帶寬、曲線(xiàn)尾高、蔗糖SRC四個(gè)性狀關(guān)聯(lián),最高貢獻(xiàn)率達(dá)20.11%,是重要的主效位點(diǎn);位點(diǎn)BS00022524_51同時(shí)與8分鐘帶寬、乳酸SRC、水SRC三個(gè)性狀關(guān)聯(lián),但貢獻(xiàn)率
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