胡蘿卜MADS-box基因克隆與表達(dá)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、MADS-box基因是一類廣泛存在于植物中序列特異的同源異型基因,它是由保守程度不同的MADS-box、I、K和C結(jié)構(gòu)共同組成的。MADS-box基因大部分都參與花發(fā)育的調(diào)控,并且在根、葉、胚珠及果實(shí)的發(fā)育中起著廣泛的作用。本實(shí)驗(yàn)通過對胡蘿卜MADS-box基因的克隆,并使用半定量PCR和熒光定量PCR對其克隆基因表達(dá)模式的研究,進(jìn)一步豐富了人們對胡蘿卜中MADS-box基因的認(rèn)識,為進(jìn)一步探究胡蘿卜花發(fā)育的有關(guān)機(jī)制,以及基因工程育種的

2、近一步研究提供了一定的理論基礎(chǔ)。實(shí)驗(yàn)得到的研究結(jié)果如下:
   1)胡蘿卜MADs-box基因的克隆和序列分析
   以胡蘿卜花芽為原材料,提取總RNA,運(yùn)用3’RACE原理克隆出三個MADS-box基因,并用5’RACE擴(kuò)增了其中兩個基因的5’端,從而得到了全長。通過序列的比對和進(jìn)化樹分析表明,他們分別與煙草的NAP1-2、金魚草的DEFH49和擬南芥AGL6同源性很高,分別屬于APETALA1即A類基因、SEP-li

3、ke亞家族即E類基因,從而將三個基因分別命名為DcAP1、DcSEP1、DcAGL6:
   (1)DcAP1的序列分析:DcAP13’端全長897bp,3’端非編碼區(qū)為216bp,poly(A)尾長17個腺苷酸,編碼區(qū)680bp,對應(yīng)編碼的226氨基酸。編碼的蛋白質(zhì)含有57個氨基酸編碼的MADS區(qū)、30個氨基酸編碼的I區(qū)、73個氨基酸編碼的K區(qū)。與金魚草的AmAP1、大豆的GAP1、杧果的MtAP1、煙草的NAP1-2基因的同

4、源性分別為62.56%、63.56%、65.31%、64.49%。
   (2)DcSEP1的序列分析:DcSEP1的cDNA全長1084bp,3’端非編碼區(qū)為233bp,poly(A)尾長17個腺苷酸,編碼區(qū)753bp,對應(yīng)編碼251個氨基酸。編碼的蛋白質(zhì)含有59個氨基酸編碼的MADS區(qū)、34個氨基酸編碼的I區(qū)、65個氨基酸編碼的K區(qū)。與擬南芥的SEPALLATA3、與杧果的SEPALLATA1-like、葡萄的SEPALLA

5、TA1、矮牽牛的MADS-box基因的同源性分別為60.23%、56.52%、70.24%、74.31%。
   (3)DcAGL6的序列分析:DcAGL6cDNA的全長為1060bp,3’端非編碼區(qū)為270bp,poly([A)尾長20個腺苷酸,編碼區(qū)747bp,對應(yīng)編碼249個氨基酸。編碼的蛋白質(zhì)含有57個氨基酸編碼的MADS區(qū)、32個氨基酸編碼的I區(qū)、77個氨基酸編碼的K區(qū)。與擬南芥的AGL6、大麻槿的HcMADS、風(fēng)信子

6、的HoMADS、矮牽牛的pMADS4基因的同源性分別為58.98%、64.03%、59.36%、61.24%。
   2)胡蘿卜MADS-box基因的表達(dá)分析
   為了能夠進(jìn)一步研究MADS-box在胡蘿卜花器官的表達(dá)特異性,分別取胡蘿卜的根、莖、葉、萼片、心皮、雄蕊作為材料,提取總RNA,根據(jù)得到的序列設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行RT-PCR和Realtime實(shí)時(shí)熒光定量PCR。
   檢測結(jié)果顯示:DcAP1在根、莖、葉

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