碭山酥梨果實(shí)PPO酶學(xué)特性、PPO克隆及生物信息學(xué)分析.pdf_第1頁(yè)
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1、碭山酥梨(Pyrus bretschneideri cv.)是我國(guó)栽培面積最大和對(duì)外出口的主要梨品種。近幾年,由于自然環(huán)境、品種退化、田間管理粗放等原因,梨果實(shí)石細(xì)胞含量增多,導(dǎo)致果實(shí)肉質(zhì)變粗,口感多渣,嚴(yán)重影響了碭山酥梨果實(shí)的食用品質(zhì)和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。果實(shí)中石細(xì)胞是一種厚壁組織細(xì)胞,由次生壁在初生壁上沉積而形成,與木質(zhì)素的合成、轉(zhuǎn)運(yùn)及沉積密切相關(guān)。因此,對(duì)碭山酥梨果實(shí)中,石細(xì)胞發(fā)育、木質(zhì)素合成及影響因素的研究就具有重要的意義。木質(zhì)素合成重要

2、酶多酚氧化酶(PPO)可以通過(guò)木質(zhì)素單體聚合等多種途徑影響木質(zhì)素的合成。
   本實(shí)驗(yàn)以碭山酥梨果實(shí)為材料,研究了木質(zhì)素合成重要酶PPO變化規(guī)律,并探討PPO酶學(xué)特性,明確梨果實(shí)生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中,PPO活性與木質(zhì)素、石細(xì)胞含量之間的關(guān)系。同時(shí),克隆PPOcDNA,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析和結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),為從生理生化和分子生物學(xué)水平了解石細(xì)胞發(fā)育機(jī)理,調(diào)節(jié)石細(xì)胞含量奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:
   1、碭山酥梨果實(shí)發(fā)育過(guò)程中,PP

3、O活性在花后27天和47天出現(xiàn)高峰,早于木質(zhì)素含量高峰(花后47天、61天)和石細(xì)胞含量高峰(花后51天)。PPO活性變化與石細(xì)胞、木質(zhì)素含量變化趨勢(shì)基本相同,均表現(xiàn)為先升高后下降的趨勢(shì)。作為PPO的一類(lèi)酶,漆酶在果實(shí)發(fā)育發(fā)育初期含量最高,之后迅速下降,花后39天短暫回升后又迅速降低并維持較低水平。相關(guān)性分析表明,PPO活性變化與石細(xì)胞、木質(zhì)素含量極顯著相關(guān),但未發(fā)現(xiàn)漆酶活性與石細(xì)胞、木質(zhì)素含量間有顯著的相關(guān)性。
   2、碭山

4、酥梨果實(shí)PPO的最適溫度為40℃左右,且高溫對(duì)PPO活性抑制作用比低溫更明顯;不同pH條件下,PPO活性變化表現(xiàn)為雙峰曲線,高峰期分別出現(xiàn)在pH7.0和pH5.0,且pH7.0條件下PPO活性為513.86U·g-1,顯著高于pH5.0條件下PPO活性229.43U·g-1。以鄰苯二酚為底物,梨果實(shí)PPO反應(yīng)最適底物濃度是0.16mol·L-1;酶促褐變反應(yīng)動(dòng)力學(xué)符合米氏方程,動(dòng)力學(xué)參數(shù)Vmax為54.5455U·g-1,Km為0.13

5、64mol·L-1。
   3、蔗糖、山梨醇、EDTA、檸檬酸、抗壞血酸對(duì)PPO活性均有一定的抑制作用,同濃度情況下抑制效果為:抗壞血酸>檸檬酸>EDTA>山梨醇>蔗糖。當(dāng)抑制劑濃度為0.02 mol·L-1時(shí),檸檬酸、抗壞血酸對(duì)PPO抑制作用最大,PPO相對(duì)活力分別為11.22%和5.24%,濃度高于0.5mol·L-1時(shí),無(wú)未檢測(cè)到PPO活性。當(dāng)抑制劑濃度從0.02mol·L-1提高到0.5mol·L-1時(shí),EDTA對(duì)PPO

6、抑制作用最明顯,PPO殘留活性下降了71.45%。低濃度的蔗糖和山梨醇對(duì)PPO活性抑制作用不大,當(dāng)濃度達(dá)到1.0mol·L-1時(shí),PPO殘留活性分別為41.60%和31.20%。
   4、利用RTPCR技術(shù)克隆得到碭山酥梨果實(shí)PPOcDNA保守片段558bp,該序列已登錄GenBank,登陸號(hào)為HQ329065。利用RACE反應(yīng)得到3’片段和5’片段,分別為1326bp和689bp,拼接得到PPOcDNA全長(zhǎng)為1992bp,開(kāi)

7、放讀碼框ORF含有1782個(gè)堿基,編碼583個(gè)氨基酸,Genbank登錄號(hào)為JF809859。
   5、對(duì)PPO編碼的氨基酸組成、結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行生物信息學(xué)分析和預(yù)測(cè)。利用ProtParam tool軟件推測(cè)氨基酸理論分子量為65.78KD,理論等電點(diǎn)為8.4,偏堿性。
   利用ScanProsite在線工具分析氨基酸序列含有兩個(gè)結(jié)構(gòu)功能域,與PPO兩個(gè)保守的銅離子結(jié)合區(qū)域吻合,具有酪氨酸酶家族的特征。利用DNAman

8、軟件分析和同源性比對(duì),氨基酸序列與同屬薔薇科植物 PPO同源性較高,其中與砂梨PPO相同氨基酸最多,達(dá)到99%。利用SignalP3.0 Server未發(fā)現(xiàn)可能的信號(hào)肽切割位點(diǎn),利用在線ChloroP工具預(yù)測(cè)碭山酥梨PPO編碼氨基酸含有一條長(zhǎng)度47bp的葉綠體轉(zhuǎn)運(yùn)肽(CTP),與PredictProtein在線工具預(yù)測(cè)PPO亞細(xì)胞定位于葉綠體的結(jié)論一致。
   利用PredictProtein和SWISSMODEL在線工具預(yù)測(cè)P

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