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![鳙國內(nèi)土著群體和美歐移居群體mtDNA遺傳差異與SSR標(biāo)記分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/9/bdc10988-43b4-4078-bf91-b53955edb747/bdc10988-43b4-4078-bf91-b53955edb7471.gif)
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文檔簡介
1、一、國內(nèi)外鳙不同群體線粒體DNA遺傳差異分析
鳙是中國重要淡水魚類之一,自上世紀(jì)60年代以來,已被移植到至少70多個國家和地區(qū),并在當(dāng)?shù)卦S多河流中建立各自的生態(tài)系統(tǒng)。移植后鳙群體遺傳多樣性和遺傳變異的情況還未見報道。本研究中,鳙的樣本采來自三個國家的5條河流,即中國的長江、珠江、黑龍江,匈牙利的多瑙河及美國的密西西比河,通過測序,得到了線粒體16S rRNA基因和D-loop區(qū)的合并序列(約1345bp),共獲得23個變異
2、位點。五大河流群體之間遺傳多樣性和遺傳分化分析的結(jié)果表明,在檢測到的29個單倍型中,有9個為共享單倍型;核苷酸多樣性在0.0014至0.0043之間,單倍型多樣性在0.6879至0.9333之間。分子方差分析(AMOVA)表明,群體遺傳變異主要來自群體內(nèi)(76.79%)。貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育分析表明,長江群體所有的單倍型至少與一個其它群體共享,但沒有一個單倍型在5條河流的鳙群體中共享,推測長江群體的鳙可能是原始群體。群體兩兩之間FST值比較表
3、明,除了長江和黑龍江群體間遺傳分化不顯著(P>0.05)外,其他群體間的遺傳分化極其顯著。美國密西西比河群體和匈牙利多瑙河群體有一個獨特的共享單倍型,推測這兩個群體之間有一定相關(guān)性。從單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖發(fā)現(xiàn),其中單倍型H07擁有最多分支,除了美國群體外,單倍型H07與其他4條河流的鳙魚群體共享,推測這個單倍型可能是最原始單倍型。
二、國內(nèi)外鳙的不同群體的微衛(wèi)星分析
使用15對實驗室自主開發(fā)的微衛(wèi)星引物和網(wǎng)上下載
4、的鳙的微衛(wèi)星引物,研究了國內(nèi)外鳙的遺傳變異和遺傳多樣性。其結(jié)果顯示,(1)5群體中,長江群體的觀察雜合度(0.5389)、期望雜合度(0.5502)、觀察等位基因(4.4000)、有效等位基因(2.7737)、多態(tài)信息位含量(0.5001)都最高。(2)5群體中,只有長江群體多態(tài)信息含量為高度多態(tài),其它4個群體的多態(tài)性信息含量為中度多態(tài)。(3)群體間遺傳分化兩兩比較顯示,除了長江(石首)群體與黑龍江群體間的遺傳分化不顯著外(p==0.0
5、72),其他群體間的遺傳分化都顯著(P<0.01)。(4)遺傳距離顯示,長江群體與黑龍江群體的遺傳距離最近,黑龍江與美國密西西比河群體的遺傳距離最遠(yuǎn)。N-J和UPGMA聚類圖中,長江群體與黑龍江群體先聚為一支,珠江群體和美國密西西比河群體聚為一支。(5)分子方差分析(AMOVA)表明,鳙的不同群體的遺傳變異主要來自群體內(nèi)。
三、線粒體測序和微衛(wèi)星分析的異同點
通過線粒體DNA序列測序和微衛(wèi)星分析相結(jié)合,研究了
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