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文檔簡介
1、我國是世界栽培杏的原生起源中心之一,其擁有的杏種質(zhì)資源十分豐富,全世界杏品種有3000余個,其中我國杏有9個種,13個變種,約2000個品種和類型。為了更好地保存、評價和利用這些種質(zhì)資源,我們在多年來杏資源收集、評價的基礎(chǔ)上,利用18個形態(tài)學和農(nóng)藝學性狀數(shù)據(jù)對收集到的1501份杏品種進行了取樣策略研究,并結(jié)合SSR分子標記技術(shù)對杏種質(zhì)資源的遺傳多樣性進行了分析,構(gòu)建了杏的核,心種質(zhì),并對核心種質(zhì)的有效性進行了檢測,研究結(jié)果如下:
2、 1.杏品種初級核心種質(zhì)取樣策略研究表明,最佳總體取樣比例為100%,以按栽培區(qū)分組結(jié)合對數(shù)比例取樣為構(gòu)建杏初級核心種質(zhì)的最佳取樣方案。利用此取樣策略從1501份杏品種中提取150份作為初級核心種質(zhì),對其代表性進行檢測表明所構(gòu)建的初級核心種質(zhì)能夠很好地代表杏種質(zhì)資源的遺傳多樣性。
2.以鮮食杏品種‘大巴達’為試材,研究了杏SSR-PCR反應(yīng)體系的主要因子對擴增結(jié)果的影響,并進行了體系驗證。優(yōu)化后的反應(yīng)體系為:總體積2
3、0μL,1xPCRbuffer、2.0mM/LMg2+、0.25mM/LdNTP、0.20μM/LPrimer、3ng/μL模板DNA和0.05U/μLTaq酶。瓊脂糖電泳檢測的DNA多態(tài)性不如變性聚丙稀酞胺凝膠豐富。利用32個杏品種驗證此反應(yīng)體系,6%的變性聚丙稀酰胺凝膠電泳檢測,結(jié)果顯示:擴增產(chǎn)物在184-267bp之間,不同品種間DNA譜帶多態(tài)性豐富,且反應(yīng)體系的穩(wěn)定性和可重復性好。
3.針對SSR引物的獲得比較困難
4、,杏本身開發(fā)的SSR引物數(shù)量有限,本文以5個杏品種的基因組DNA為模板,進行PCR擴增,對來自薔薇科植物的106對引物進行初步篩選,采用1%瓊脂糖凝膠檢測結(jié)果,從中篩選出全部有擴增產(chǎn)物的引物47對,接下來應(yīng)用6個杏品種對初選的47對引物進行復篩,PCR擴增后,采用6%變性聚丙烯酰胺凝膠檢測,最后得到條帶清晰、多態(tài)性好的引物22對,擴增片段分別為6-10條不等,多態(tài)性百分率為50%-88%。
4.以杏的初級核心種質(zhì)為研究材料
5、,利用SSR分子標記技術(shù)對杏初級核心種質(zhì)的遺傳多樣性進行分析。結(jié)果表明:利用篩選出的22對多態(tài)性高、特異性好的SSR引物,檢測到196個等位基因,平均每個位點的等位基因數(shù)為8.9;各栽培區(qū)的遺傳多樣性大小順序為:華北溫帶杏區(qū)>東北寒帶杏區(qū)>西北干旱帶杏區(qū)>西南高原杏區(qū)>廣泛分布品種>熱帶-亞熱帶杏區(qū)。聚類分析表明:150份供試材料在相似系數(shù)為0.27處分為6類,各栽培區(qū)品種沒有明顯的分開,存在交叉現(xiàn)象。
5.為構(gòu)建杏核心種
6、質(zhì),通過對150份杏初級核心種質(zhì)的形態(tài)農(nóng)藝性狀(MOR)數(shù)據(jù)和SSR等位基因數(shù)據(jù)的分析,研究了四種取樣方法下各取樣比例的多樣性指數(shù)、保留比例及各頻率段的等位基因的丟失比例,確定了核心種質(zhì)構(gòu)建的最佳取樣方案,并利用數(shù)量性狀對構(gòu)建的核心種質(zhì)的代表性進行分析。結(jié)果表明,聚類取樣的方法優(yōu)于隨機取樣,在80%的取樣比例下SSR+MOR聚類取樣效果最好,利用此方法構(gòu)建的核心種質(zhì)共包括120份材料,保留了初級核心種質(zhì)100%的SSR等位基因和原始種質(zhì)
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