1、蝦夷扇貝(Mizuhopecten(Patinopecten)yessoensis)屬軟體動物門(Mollusa)，半鰓綱(Lamellibranchia)，翼形亞綱(Pterimorphia)，珍珠貝目(Pterioida)，扇貝科(Pectinidae)，蝦夷扇貝屬(Mizuhopecten)。20世紀80年代初，遼寧海洋水產(chǎn)科學研究院從日本青森縣陸奧灣引入中國，目前成為我國北方沿海重要的養(yǎng)殖品種。
　　 本研究構(gòu)建了蝦夷扇

2、貝外套膜全長cDNA文庫。對該文庫中隨機選取的960個克隆進行5’端測序，獲得了923條有效EST序列。通過生物信息學的方法對這些序列進行拼接后得到567條unigene，包含105個序列重疊群(contig)和462條singletons，計算序列的平均長度為774 bp。
　　 利用BLASTX和BLASTN對數(shù)據(jù)庫中的序列進行比對分析，發(fā)現(xiàn)存在明顯相似性的序列有267條，占總數(shù)的47.1％。將所有EST序列按其序列相似性功

3、能進行分類(COG分類)后，157條unigene獲得了基因注釋，約占序列總數(shù)的27.7％。在已知的功能序列中，發(fā)現(xiàn)部分與機體防御相關(guān)的基因，如大防御素、G型溶菌酶、熱休克蛋白70、肽聚糖識別蛋白、Tisll蛋白、氧化酶與抗氧化酶類等。
　　 利用SSRIT軟件對蝦夷扇貝外套膜cDNA文庫的EST數(shù)據(jù)進行微衛(wèi)星查找，發(fā)現(xiàn)62條含有微衛(wèi)星的EST序列，占EST總數(shù)的10.9％。兩堿基重復類型的微衛(wèi)星序列最多，共50條，占文庫中微衛(wèi)

4、星序列總數(shù)的80.6％，其中以(at)n重復最多(16條)。根據(jù)這些序列，設(shè)計了20對針對微衛(wèi)星的特異性引物。
　　 蝦夷扇貝mtDNA非編碼區(qū)2(NcR2)具有很高的序列變異性，利用這一特征，采用PCR產(chǎn)物直接測序法對大連獐子島(ZZD)、大連旅順口(LSK)、日本青森縣(QSX)及俄羅斯海森崴(HSW)4個群體的共40個蝦夷扇貝的線粒體NcR2序列進行分析。測序得到14種單元型序列，其中ZZD群體中的單元型類型最多，群體的遺