嗜水氣單胞菌噬菌體的生物學特性及基因組學研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、嗜水氣單胞菌(Aeromonashydrophila)是一種重要的人畜共患病病原,其致病菌株能引起動物暴發(fā)性出血病和人類腸胃炎等疾病,對水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)以及動物和人類的健康構(gòu)成威脅。但現(xiàn)今隨著抗生素的大量使用,許多菌株出現(xiàn)了多重耐藥性,這給該病的防控帶來一定的挑戰(zhàn)。噬菌體作為一種細菌病毒,具有高效裂解細菌的特性。因此研究嗜水氣單胞菌噬菌體對控制此類細菌感染具有重要的意義。
  本試驗從地下水和污染河流水樣中分離出兩株嗜水氣單胞菌噬菌體,

2、分別命名為CC2和9-1,并從形態(tài)學、生理和分子水平對其特性進行研究。結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩株噬菌體均具有六邊形長頭部爭收縮性尾部,屬于肌尾病毒科。CC2能裂解25株嗜水氣單胞菌中的6株,在控制嗜水氣單胞菌的感染上具有一定的應用價值。9-1的宿主范圍遍布至少4種氣單胞菌。一步生長曲線表明CC2潛伏期為20min,生長期140min,平均感染度為303PFU/cell;噬菌體9-1的潛伏期為25min,生長期105min,平均感染度為177PFU/c

3、ell。兩株噬菌體對高溫和低pH均較為敏感。
  為了全面了解噬菌體CC2的遺傳背景,利用甘油梯度離心純化噬菌體CC2并提取其基因組DNA,采用454高通量測序法完成基因組測序。測序結(jié)果表明噬菌體CC2基因組長231,743bp,堿基組成為:A=30.05%[69645];G=17.82%[41297];C=21.00%[48668];T=31.13%[72133];A+T=61.18%,G+C=38.82%。采用Glimmer3

4、.0和Prodigal軟件預測出噬菌體CC2的基因組可能存在427個開放閱讀框(Openreadingframe,ORF)。通過BLASTP和RPSBLAST工具在各大核酸和蛋白數(shù)據(jù)庫中的檢索,發(fā)現(xiàn)108個ORFs的基因產(chǎn)物具有預測的功能。這些ORFs分布于CC2基因組的3個相應模塊中:DNA代謝與復制模塊、DNA組裝與結(jié)構(gòu)形成模塊和細胞裂解模塊。全基因組序列比對表明,噬菌體CC2和殺鮭氣單胞菌噬菌體65具有較高的同源性,為64%,而與

5、嗜水氣單胞菌噬菌體Aeh1的同源性只有12%。使用MEGA4.1構(gòu)建三個保守蛋白的系統(tǒng)發(fā)生樹,結(jié)果表明噬菌體CC2的末端酶、尾管蛋白和DNA聚合酶與氣單胞菌噬菌體蛋白親緣關(guān)系最近。
  為了研究噬菌體CC2溶菌酶LysC的溶菌效果,在基因組測序的基礎上,通過建立大腸桿菌原核表達系統(tǒng)的方法獲得純化的且具有溶菌活性的嗜水氣單胞菌噬菌體溶菌酶LysC。具體方法為:設計針對lysC基因的引物,利用噬菌體CC2原液進行PCR擴增,獲得編碼L

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