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![渤海魚類寄生異尖屬線蟲的分子鑒定和群體遺傳結構分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/9/d1f32451-9c42-4dbe-971c-08dadd06e651/d1f32451-9c42-4dbe-971c-08dadd06e6511.gif)
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文檔簡介
1、利用rDNA ITS區(qū)的PCR-RFLP(DNA擴增片段長度多態(tài)性)結合序列分析,首次對我國渤海6種魚體內寄生的612條異尖屬線蟲幼蟲進行分類鑒定。內切酶HinfⅠ的酶切電泳圖包括兩種酶切條帶,分別對應于派氏異尖線蟲(603條)和Abollo等(2003)所發(fā)現的重組基因型(9條)。選擇3個派氏異尖線蟲和全部的重組基因型樣品進行ITS-1和ITS-2序列分析,結果表明酶切結果顯示為派氏異尖線蟲的樣品與Genbank上已登錄的派氏異尖線蟲
2、的ITS-1和ITS-2區(qū)的序列完全相同,再次證明其為派氏異尖線蟲,而9條重組基因型在ITS-1區(qū)出現了2種序列,一種在280bp和296bp處各存在一個C/T雙重疊峰(重組基因型Ⅰ,Rec1),該序列與Abollo等(2003)的結果相一致;另一種只在296bp處存在一個C/T雙重疊峰(重組基因型Ⅱ,Rec2),該重組基因型為首次報道。兩種重組基因型mtDNA SSU基因的序列分析顯示Rec1的SSU序列與派氏異尖線蟲的完全一致,而R
3、ec2的SSU序列與派氏異尖線蟲僅有1個堿基差異,推測本研究所發(fā)現的兩種重組基因型有可能是派氏異尖線蟲種內變異的結果。
首次采用變性梯度凝膠電泳(DGGE)結合序列分析方法對我國渤海魚類寄生派氏異尖線蟲(603條線蟲)mtDNA cox1和nad1基因的部分序列進行群體遺傳結構研究,結果顯示mtDNA cox1基因經DGGE產生了10種不同的帶型,定義了10種單倍型(Haplotype1-10,Hap1-10),10種單倍
4、型cox1基因序列之間存在10個多態(tài)性位點,nad1序列之間存在9個多態(tài)性位點,單倍型Hap3、Hap8和Hap10 nad1基因的序列完全一致。根據魚類宿主劃分派氏異尖線蟲種群,分為6個種群,分別是鮐魚種群(Pn),馬鮫種群(Sc),鳙魚種群(Ar),梅童棘頭魚種群(Co),吉氏黃鯽種群(Se)和鲬魚種群(Pl)。分子方差分析(AMOVA)表明派氏異尖線蟲種群內存在很高的遺傳變異,占總變異的99.89%,種群間的遺傳變異很小,僅占總變
5、異的0.11%,說明渤海魚類寄生派氏異尖線蟲的遺傳分化主要發(fā)生在種群內,種群間無明顯分化。梅童棘頭魚種群與其余5個種群的遺傳分化系數(Fst)在0.00836-0.04482之間,說明梅童棘頭魚種群與其余5個種群之間存在較弱的遺傳分化;其余5個群體之間的Fst為負值,說明這5個種群無遺傳分化。梅童棘頭魚種群和鳙魚種群或馬鮫種群之間遺傳分化系數Fst值的P檢驗均出現顯著差異(P<0.05),說明梅童棘頭魚種群與鳙魚種群或馬鮫種群之間的分化
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