中國葉螨DNA條形碼的研究及其系統(tǒng)發(fā)育分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、葉螨屬于蛛形綱Arachnida、蜱螨亞綱Acari、真螨目Acariformes、葉螨科Tetranychidae,是一種危害果蔬和溫室植物的世界范圍的重要經(jīng)濟(jì)害蟲.葉螨科物種鑒定的困難在于有限的形態(tài)學(xué)特征,而且物種之間的這些特征具有高度的相似性,這種情況在葉螨屬內(nèi)尤為普遍。另外,只有很少一部分分類學(xué)家專于葉螨的形態(tài)學(xué)鑒定,而且數(shù)量日趨減少?;贒NA序列對葉螨科物種的鑒定,相對于傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定而言具有特殊的意義。它的優(yōu)點是迅速、簡

2、單、可靠。DNA條形碼技術(shù)是利用分子標(biāo)記的序列差異將物種鑒定到種水平的一種方法。本研究通過形態(tài)學(xué)關(guān)鍵特征對葉螨科九個物種進(jìn)行了鑒定,并對其線粒體COI,核糖體ITS1, ITS2及28S序列進(jìn)行測定和研究。旨在探索COI、ITS1、ITS2和28S序列作為DNA條形碼是否可以對葉螨科九個物種準(zhǔn)確鑒定和進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生分析。另外,我們大量檢測了種內(nèi)種間的序列差異,用于分析葉螨的種內(nèi)種間關(guān)系。
   DNA條形碼技術(shù)是一種利用線粒體CO

3、I5’端的序列差異將物種鑒定到種水平的方法,線粒體COI基因由于種間較高的多態(tài)性,在物種鑒定方面顯示了獨特的優(yōu)勢。測定線粒體COI部分序列來闡述葉螨科4個屬9個物種的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。研究結(jié)果證實了形態(tài)學(xué)上定義的4個屬葉螨屬Tetranychus,全爪螨屬Panonychus,雙葉螨屬Amphitetranychus和巖螨屬Petrobia分別形成一個單系,然而在葉螨屬內(nèi)截形葉螨Tetranychus truncatus,朱砂葉螨Tetra

4、nychus cinnabarinus和二斑葉螨Tetranychusurticae的系統(tǒng)發(fā)生地位并沒有被很好地解決??傮w上屬間差異大于種間差異,種間差異大于種內(nèi)差異,但朱砂地理種群間的遺傳距離最大的為0.1018,數(shù)據(jù)統(tǒng)計顯示河南和云南朱砂種群與其它5個地理種群間差異較大,表明朱砂種群可能存在隱含種。
   之前的研究表明利用核糖體序列間的差異可以對物種進(jìn)行鑒定,甚至是相近物種、復(fù)雜物種和地理種群的鑒定。我們選擇了rDNA的I

5、TS1,ITS2區(qū)段作為分子標(biāo)記,對中國葉螨科4個屬9個種23個種群進(jìn)行研究,從而探索核糖體ITS的序列是否適合于葉螨科物種的分子鑒定?;贗TS1的序列差異屬間大于種間,種間大于種內(nèi)。種間差異全部大于2%,而酢漿草巖螨的5個地理種群的序列完全一致,二斑葉螨的5個地理種群的平均遺傳距離為0.018,但數(shù)據(jù)統(tǒng)計顯示河南和云南種群與其它5個地理種群間差異較大。對ITS2序列測定研究表明各物種除了蘋果全爪螨P.ulmi和柑橘全爪螨P.citr

6、i處于同一進(jìn)化枝上,其它物種都以較高的置信度形成一個單系。但是二斑葉螨,截形葉螨及土耳其斯坦葉螨的兩兩核苷酸差異小于2%,而朱砂葉螨的不同地理種群的核苷酸差異大于2%?;诤颂求wITS1和ITS2分析表明:盡管葉螨屬內(nèi)朱砂葉螨和二斑葉螨的系統(tǒng)發(fā)生地位沒有很好地解決,但形態(tài)學(xué)上定義的四個屬和大部分種被很好地區(qū)分開來。
   通過研究核糖體28S-rRNA的D1-D2部分序列來闡述葉螨科4個屬9個物種的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。研究結(jié)果證實了形

7、態(tài)學(xué)上定義的四個屬葉螨屬,全爪螨屬,雙葉螨屬和巖螨屬分別形成一個單系,然而在葉螨屬內(nèi)及全爪螨屬內(nèi)各物種的系統(tǒng)發(fā)生地位并沒有被很好地解決?;诤颂求w28S-rRNA序列無法將葉螨鑒定到種水平,但對于屬水平上的鑒定卻提供了重要的參考。
   本研究旨在探索是否可以利用線粒體COI及核糖體ITS1,ITS2,28S作為分子條形碼用于鑒定中國葉螨科4個屬的9個常見物種,分析它們的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系,從而給葉螨科DNA條形碼的研究提供一定的理論

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