一步一步教你使用ncbi數據庫資源_第1頁
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文檔簡介

1、一步一步教你使用NCBI數據庫資源隨著ncbi數據庫各種資源的涌現,NCBI已經成為科研工作者必不可少的資料查找,數據分析的工具。那么NCBI數據如何使用,新手入門一步一步教你認識和使用NCBI數據庫。一綜合數據庫NCBI數據庫集美國國立生物技術信息中心(NationalCenterfBiotechnologyInfmation),即我們所熟知的NCBI是由美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)于1988年創(chuàng)辦。創(chuàng)辦NCBI的初衷是為了給分子生物

2、學家提供一個信息儲存和處理的系統(tǒng)。除了建有GenBank核酸序列數據庫(該數據庫的數據資源來自全球幾大DNA數據庫,其中包括日本DNA數據庫DDBJ、歐洲分子生物學實驗室數據庫EMBL以及其它幾個知名科研機構)之外,NCBI還可以提供眾多功能強大的數據檢索與分析工具。目前,NCBI提供的資源有Entrez、EntrezProgrammingUtilities、MyNCBI、PubMed、PubMedCentral、EntrezGene、

3、NCBITaxonomyBrowser、BLAST、BLASTLink(BLink)、ElectronicPCR等共計36種功能,而且都可以在NCBI的主1.2新增primerBLAST分析工具2008年,NCBI新增了設計、分析PCR引物的工具——PrimerBLAST。PrimerBLAST的引物設計功能是基于NCBI現有的Primer3程序發(fā)展而來的,Primer3程序可以為一段DNA模板序列設計PCR引物。PrimerBLAST

4、在設計出引物之后還在某些相應數據庫中進行BLAST搜索,因此可以得到特異性引物,擴增出目的片段。用戶在給出DNA模板的同時還可以限定正向引物或反向引物,這樣,NCBI就只會給出另一條引物。如果用戶給出了模板DNA和兩條引物序列,PrimerBLAST就只會運行BLAST程序,幫助用戶對引物進行分析。用戶也可以只給出兩條引物而不給出模板序列,這時PrimerBLAST會通過BLAST程序分析出與這對引物最匹配的模板序列。PrimerBLA

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