黃河三角洲表層沉積物古菌分布特征.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:研究黃河三角洲近海岸區(qū)域古菌的多樣性及分布。
  方法:以PCR技術(shù)為基礎(chǔ)構(gòu)建古菌16S rDNA基因文庫(kù),在小尺度上選擇6個(gè)不同站位的沉積物樣品進(jìn)行研究。
  結(jié)果:1.經(jīng)研究處理后共獲得了568個(gè)克隆,擴(kuò)增所得的16S rRNA基因經(jīng)過(guò)限制性雙酶切分析及應(yīng)用軟件DOTUR進(jìn)行97% cut off后共得到73個(gè)有效操作分類單元(Operational Taxonomic Unit,OUTs)。2.所有陽(yáng)性克隆經(jīng)雙酶

2、切后進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)網(wǎng)上進(jìn)行序列比對(duì)通過(guò)傳統(tǒng)統(tǒng)計(jì)學(xué)方法及所獲基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。3.對(duì)實(shí)驗(yàn)獲得的16S rDNA分析發(fā)現(xiàn),本次研究的古菌均來(lái)自泉生古菌(Crenarchaeota)和廣生古菌(Euryarchaeota)兩大類。其中,Marine Crenarchaeotic Group I(MG- I)(88.8%)占據(jù)了主要地位,接下來(lái)依次為Miscellaneous Crenarchaeotic Group(MCG);DSAG(De

3、ep-Sea Archaeal Group)也稱為MBG-B;MBG-D,也稱MG-III(Marine Group III)以及、TMEG(Terrestrial Miscellaneous Eurarchaeotal Goup)。
  結(jié)論:結(jié)果反映,MG-I與 MCG這兩個(gè)古菌類群的克隆數(shù)占16SrDNA總克隆數(shù)的96%,兩者均是海洋中最為常見的古菌類群,這也符合近海環(huán)境較為穩(wěn)定的特點(diǎn)。近海沉積物中古菌群落結(jié)構(gòu)在水平范圍并沒(méi)

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