黃色粘球菌DZ2中溫度應(yīng)答ECF-σ因子的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、胞質(zhì)外功能σ因子(ECF-σ)是一類簡單而多變的可替代σ因子,參與細胞對環(huán)境信號的感知和應(yīng)答,是原核生物普遍使用的一種基本的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)與轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制。以復(fù)雜多細胞群體行為及次級代謝產(chǎn)物產(chǎn)生能力而聞名的粘細菌(Myxobacteria)是一類廣泛分布的環(huán)境微生物,可以耐受包括營養(yǎng)、溫度、pH、滲透壓、氧化等在內(nèi)廣泛的環(huán)境刺激而生長發(fā)育,但是對其生態(tài)適應(yīng)機制卻研究甚少。
  前期石美琳碩士以黃色粘球菌(Myxococcus xanthu

2、s)DK1622基因組為參考序列,在M.xanthus DZ2菌株中構(gòu)建了所有未見報道的35個ECF-σ因子和14個anti-σ因子的基因敲除突變株,分析了它們在各種非生物環(huán)境信號下的生長發(fā)育表型。在此基礎(chǔ)上本論文開展了如下研究:
  一、以其篩選出的專一性溫度信號應(yīng)答ECF-σ因子MXAN_3959和MXAN_7214以及一個全局性信號應(yīng)答(對所研究的環(huán)境信號均產(chǎn)生應(yīng)答)ECF-σ因子MXAN_4147為靶標(biāo),研究它們各自的信號

3、傳導(dǎo)途徑。首先通過基因回補菌株構(gòu)建及表型分析,證實突變表型確實是由各基因的缺失所導(dǎo)致的。利用RT-qPCR技術(shù)檢測了特定環(huán)境信號下各基因表達量的變化,結(jié)果顯示除了全局性信號應(yīng)答ECF-σ因子MXAN4147的表達量在Na+脅迫條件下的表達量下降外,其他基因在相應(yīng)條件下均有不同幅度的上升,這與它們各自突變體的生長表型是一致的。
  鑒于在沒有環(huán)境刺激時,絕大多數(shù)ECF-σ因子與其同源的anti-σ因子結(jié)合而失活,我們又通過共轉(zhuǎn)錄實驗

4、、細菌雙雜交系統(tǒng)分析了上述ECF-σ因子可能的anti-σ因子,結(jié)果表明,MXAN_3960、 MXAN_7215和MXAN_4148可能分別為MXAN_3959、MXAN_7214和MXAN_4147對應(yīng)的anti-σ因子。為預(yù)測它們可能參與調(diào)控的靶基因,我們在確定了它們各自所在的operon后,利用5'RACE技術(shù)檢測了各自的轉(zhuǎn)錄起始位點,獲得了MXAN_3959、MXAN_7214的啟動子序列,并以其為探針,預(yù)測了它們可能參與調(diào)控

5、的靶基因。以上結(jié)果初步闡明了M.xanthus DZ2中MXAN_3959和MXAN_7214參與高溫應(yīng)答的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。另外,本文還對上述ECF-σ因子進行了異源表達和純化,正在通過體內(nèi)、外實驗嘗試鑒定各自調(diào)控的靶基因。以上結(jié)果不僅為闡明粘球菌中ECF-σ因子參與的溫度應(yīng)答調(diào)控機制奠定了基礎(chǔ),也為相關(guān)研究提供了技術(shù)積累。
  二、利用已有的突變株,篩選參與M.xanthus DZ2生物因素應(yīng)答的ECF-σ因子,重點分析了各突變株

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