數(shù)據(jù)分布擬合的EM算法及其在生物計算中的應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)是人們長期對數(shù)據(jù)庫技術(shù)進行研究和開發(fā)的結(jié)果,生物信息或基因數(shù)據(jù)挖掘更使人類受益匪淺。數(shù)據(jù)分布的擬合問題是數(shù)據(jù)發(fā)掘理論與應用中的一個典型問題。這就是為了更確切地了解一批觀測數(shù)據(jù)的統(tǒng)計特性,我們必須確定它們的分布函數(shù),用已知的概率分布去作擬合。本文的主要內(nèi)容就是討論在較一般的昆合分布條件下,用EM算法,在最小熵原理的優(yōu)化準則下的數(shù)據(jù)擬合問題。 傳統(tǒng)的EM算法是我們早已熟知的算法,本文是在其基礎上提出了新的優(yōu)化準則,從而使

2、其更方便的應用于數(shù)據(jù)分布擬合問題。這就是用一般指數(shù)混合分布,對觀測數(shù)據(jù)進行擬合,使它們的Kullback-Leibler熵為最小。本文在給出了擬合計算中的EM算法后,也證明了該擬合計算的收斂性定理。 在生物計算中存在大量數(shù)據(jù)擬合問題,本文以蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)分析為例,利用PDB數(shù)據(jù)庫對蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)中的幾種重要參數(shù)進行分布擬合,得到了明顯的效果,并由此可以得到蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)特性。這使得本文提出的基于最小熵原理的EM算法有著更實際的意

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