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![快速確定丙氨酸-α-多肽構(gòu)象穩(wěn)定性的新方法.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/7/23/cb304315-2c11-432e-ac94-e714176b15db/cb304315-2c11-432e-ac94-e714176b15db1.gif)
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文檔簡介
1、本文采用密度泛函理論B3LYP方法,對丙氨酸-α-二肽、三肽、四肽和五肽分子進行了計算。定義了丙氨酸多肽中的特殊氫原子,對構(gòu)象中與特殊氫原子有關(guān)的主要非鍵相互作用進行分析,確定了其相應參數(shù)及丙氨酸-α-多肽的庫侖模型,探討了電荷、平均電荷在庫侖模型中的作用。用本文方法快速判斷多肽構(gòu)象的相對穩(wěn)定性,得到了滿意的結(jié)果。具體包括: 1)以丙氨酸-α-二肽、三肽、四肽分子的152個穩(wěn)定構(gòu)象為研究對象,定義了丙氨酸-α-多肽中的特殊氫原子
2、,對構(gòu)象中與特殊氫原子有關(guān)的主要非鍵相互作用進行分析,確定了其相應參數(shù),使用此參數(shù)和多肽分子構(gòu)象的分子坐標或分子結(jié)構(gòu)圖,確定構(gòu)象的相對能量,與密度泛函理論B3LYP方法得到的相對能量比較,得到了滿意的結(jié)果。 2)選擇丙氨酸-α-多肽的庫侖模型,確定其相應參數(shù)K。利用庫侖模型、參數(shù)K和密度泛函理論B3LYP/6-31G*方法優(yōu)化計算的電荷,確定構(gòu)象的相對能量,與密度泛函理論B3LYP方法得到的相對能量比較,得到了滿意的結(jié)果。計算四
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