1、隨著生物技術(shù)的發(fā)展，人們對(duì)sRNA(small RNA)的研究逐漸深入，在植物、動(dòng)物和微生物中報(bào)道的sRNA越來(lái)越多，并且建立了sRNA數(shù)據(jù)庫(kù)，為sRNA的生物信息分析提供了大量資料。生物信息學(xué)分析成為預(yù)測(cè)sRNA的重要手段并被廣泛采用，較為成熟的sRNA預(yù)測(cè)方法是QRNA法和deepBase法。結(jié)合Northern雜交和生物芯片等實(shí)驗(yàn)手段，可以進(jìn)一步驗(yàn)證預(yù)測(cè)sRNA的真實(shí)性。
　　 本文通過(guò)QRNA預(yù)測(cè)方法，對(duì)華癸中慢生根瘤菌

2、7653R基因組中的非編碼區(qū)進(jìn)行了預(yù)測(cè)，篩選獲得9個(gè)候選sRNA，分別是SraG RNA、CsrB RNA、SraC RNA、MicF RNA、RsmYRNA、HgcC RNA、RtTRNA、ISO61 RNA、Qrr RNA。在查閱文獻(xiàn)基礎(chǔ)上對(duì)9個(gè)sRNA的可能功能、上下游結(jié)構(gòu)基因的信息和作用方式進(jìn)行了歸納和整理。為了進(jìn)一步獲得實(shí)驗(yàn)證據(jù)闡明9個(gè)預(yù)測(cè)的sRNA的真實(shí)性，我們通過(guò)RT-PCR證實(shí)了9個(gè)sRNA在自生培養(yǎng)的7653R總RNA

3、中存在相應(yīng)的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物，并利用Northern雜交和熒光定量RT-PCR初步查明其參與調(diào)控的生理過(guò)程。結(jié)果顯示:經(jīng)共生、厭氧培養(yǎng)和H2O2、4M NaCl、酸堿、溫度等不同脅迫條件處理時(shí)，9個(gè)sRNA在7653R中均受不同脅迫條件的誘導(dǎo)表達(dá)，且在不同脅迫條件下表達(dá)量不同，特別是根瘤中表達(dá)量最高的是SraG RNA、HgcC RNA和RtT RNA;37℃處理時(shí)表達(dá)量最高的是CsrBRNA;10℃處理時(shí)表達(dá)量最高的是SraC RNA和ISO