1、紫貂（Marteszibellina），屬于哺乳綱（Mammalia），食肉目（Carnivora），鼬科（Mustelidae），貂屬（Martes）。世界范圍內記錄到的紫貂共為18個亞種，我國境內共分布有4個亞種，分別為：新疆北部地區(qū)的阿爾泰亞種（M.z.averini）；內蒙古和黑龍江省大興安嶺地區(qū)的大興安嶺亞種（M.z.princeps）；黑龍江省小興安嶺地區(qū)的小興安嶺亞種（M.z.linkouensis）以及長白山地區(qū)的長白山

2、亞種（M.z.hamgyenensis）。而貂皮作為“東北三寶”之一，在國際珍貴毛皮貿易市場中更是具有舉足輕重的地位。近年來，我國紫貂的分布和數(shù)量因為人為活動造成的棲息地喪失、嚴重的破碎化，以及食物短缺、過度捕獵等原因急劇減少，這一極寒地區(qū)旗艦物種的種群恢復和棲息地保護問題亟待解決。
　　微生物是地球上最為豐富的生命形式，人類也因此適應了這樣的富含微生物的生活環(huán)境。微生物群落在人體內的最大聚集區(qū)位于胃腸道（gastrointesi

3、nal tract，GI），這一群落在宿主體內起發(fā)揮著多種重要功能，包括生長發(fā)育、免疫學、生理學和營養(yǎng)學等功能，腸道微生物可能對我們的健康和疾病都有影響。微生物通常被發(fā)現(xiàn)在宿主的不同部位都有繁殖，包括皮膚、口腔、泌尿生殖道和胃腸道等部位，并與其宿主和平共存，被描述為所謂的―正常的微生物群落或者―微生物群落，而其集合基因組—腸道微生物，則是宏基因組的主要組成部分。
　　哺乳動物腸道菌群的組成成分與很多環(huán)境和地理因素相關，而且腸道菌群

4、在諸如生長發(fā)育、繁殖和疾病等多方面起著非常重要的作用。
　　利用新一代測序技術對紫貂的16S rRNA基因的測序數(shù)據(jù)尚未見報道。為探究冬季紫貂腸道菌群的基本組成和結構以及對野外紫貂和捕獲后飼養(yǎng)紫貂的腸道菌群進行比較分析，本研究對來自內蒙古汗馬國家級自然保護區(qū)的3份紫貂糞便樣品，和捕獲自大興安嶺漠河地區(qū)并在貂廠中飼養(yǎng)3個月的紫貂糞便樣品進行總DNA提取，并對16S rRNA基因中V3-V4區(qū)進行擴增，并通過Illumina Mise

5、q平臺測序，共獲得84116條讀長。野外紫貂腸道中前三個優(yōu)勢菌門分別為Firmicutes(31.1％)，Bacteroidetes(26.0％)和Proteobacteria(21.5％)，飼養(yǎng)紫貂的優(yōu)勢菌門分別為Firmicutes(55.6％)，Proteobacteria(29.1％)和Actinobacteria(6.0％)。在門水平上，野外紫貂在Bacteroidetes和Actinobacteria兩門相對豐富度大于飼養(yǎng)紫