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文檔簡介
1、海冰在全球生態(tài)系統(tǒng)中占有重要的地位,其面積在冬季能達到全球面積的13%。氮循環(huán)是生物圈物質能量循環(huán)的重要組成,其中微生物參與的氨氧化過程是硝化作用中的限速步驟。目前,涉及海冰氨氧化菌的研究較少,本研究以南極普里茲灣海冰樣品作為實驗材料,以16SrRNA和amoA(AmmoniamonooxygenasesubunitA)基因為分子標記,對不同層次的海冰進行氨氧化菌的多樣性以及豐度進行分析。
通過構建細菌16SrRNA基因文
2、庫,海冰細菌主要歸屬于γ-變形細菌(Proteobacteria)亞綱,α-變形細菌亞綱以及CFB菌群(Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroidedivision),其中大部分16SrRNA基因序列與分離培養(yǎng)自海洋環(huán)境、南北極海冰菌株的16SrRNA基因序列相似性較高(90-99%)。冰下海水中細菌多樣性較豐富,在海冰底部樣品中未檢測到CFB菌群,細菌組成在不同層次中呈現(xiàn)些微的差異性。在海冰以及冰下海水樣品中
3、,全部β-AOB屬于NitrosospiraCluster1。通過分析細菌amoA基因文庫,海冰以及冰下海水樣品中的amoA基因序列全部為Nitrosospira,大多數(shù)序列與來源于極地環(huán)境的Nitrosospira的amoA基因序列親緣關系最近。
僅在海冰底部檢測到古菌16SrRNA基因序列,與來源于北極海水、海冰中古菌16SrRNA基因序列相似性最高,屬于泉古菌海洋類群1(MarineGroupⅠCrenarchaeo
4、ta);冰下海水中,古菌16SrRNA基因序列主要歸屬于泉古菌MarineGroupⅠ和廣古菌(Euryarchaeote)MarineGroupⅡ、Ⅲ。上層以及中層海冰樣品沒有檢測到古菌amoA基因序列,底層海冰amoA基因序列全部屬于泉古菌的clustersB,多數(shù)序列與來源于鄂霍次克海沉積物樣品中的序列相似性最高。冰下海水a(chǎn)moA基因序列全為泉古菌。
采用QPCR技術對細菌、古菌16SrRNA和amoA基因拷貝數(shù)進行
5、分析,海冰細菌16SrRNA基因拷貝數(shù)在2.9×106-3.8×107/μgDNA之間,海冰中層最高;細菌amoA基因拷貝數(shù)在1.3×104-5×104/μgDNA之間,海冰底部最高。古菌16SrRNA基因拷貝數(shù)在5×103-2.4×104/μgDNA之問,中層古菌豐度最高;古菌amoA基因拷貝數(shù)在1.8×103-1.7×105/μgDNA之間,中層海冰要比上、底層高出兩個數(shù)量級。海冰中古菌amoA基因豐度高于細菌的,推測AOA在海冰氨
6、氧化過程中所起的作用要高于AOB。古菌amoA基因與泉古菌16SrRNA基因數(shù)量之比在0-7.1之間,暗示可能僅部分泉古菌中含有amoA基因。
對海冰以及海水中的細菌、古菌進行FISH計數(shù),結果表明海冰中細菌數(shù)量在0.92×105-1.22×106cells/cm3之間,其中海冰底層中細菌數(shù)量較上、中層高,占細胞總數(shù)一半以上;海水中,細菌數(shù)量為0.40-1.78×10Scells/cm3。海冰中古菌數(shù)量在0~5.33×10
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