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文檔簡介
1、背景:
骨肉瘤是對兒童和青少年的健康危害極大的惡性骨腫瘤。但是,骨肉瘤的發(fā)病率低,腫瘤異質(zhì)性較高,因此,近二十年來,研究者在提高骨肉瘤治療的效果和改善骨肉瘤患者的預(yù)后上取得的進展甚微。核糖體蛋白L34(ribosomal protein L34,RPL34)被認(rèn)為除了參與核糖體生物合成外,還具有多種核糖體外功能。早期研究發(fā)現(xiàn)RPL34參與了原核生物的細胞增殖調(diào)控,近年來研究發(fā)現(xiàn)RPL34在部分惡性腫瘤的增殖中扮演了重要角色,但
2、在人骨肉瘤中的功能尚未明確,并且RPL34介導(dǎo)惡性腫瘤細胞增殖調(diào)控的分子機制仍不清楚。
目的:
明確RPL34在人骨肉瘤組織及骨肉瘤細胞株中的表達情況,以及對人骨肉瘤細胞增殖和骨肉瘤患者預(yù)后的影響;初步探討RPL34介導(dǎo)人骨肉瘤細胞增殖調(diào)控的分子機制;通過本研究為骨肉瘤的靶向治療提供新的思路。
方法:
1、采用Real time-PCR檢測11例骨肉瘤患者的癌和癌旁組織樣本中RPL34 mRNA的
3、表達水平。
2、采用免疫組織化學(xué)方法檢測95例骨肉瘤患者的癌組織和60例正常骨組織中RPL34蛋白的表達水平。
3、計算上述95例骨肉瘤組織樣本免疫組織化學(xué)染色得分的均值,并把95例樣本劃分為RPL34高表達組和低表達組;采用Kaplan-Meier法估計RPL34高表達組和低表達組患者的生存率,采用log-rank檢驗比較兩組患者的生存曲線是否有差別。
4、采用Real time-PCR檢測人成骨細胞hF
4、OB1.19及骨肉瘤細胞株(U2OS、MG-63、HOS和Saos-2)中RPL34 mRNA的表達水平。
5、設(shè)計和篩選針對RPL34基因的RNA干擾靶點,構(gòu)建RNA干擾慢病毒并轉(zhuǎn)染人骨肉瘤細胞Saos-2,采用Real time-PCR和Western blot驗證RPL34 RNA干擾靶點的敲減效率。
6、采用Cellomics細胞計數(shù)檢測、MTT檢測、細胞周期檢測、AnnexinV-APC凋亡檢測及克隆形成實
5、驗等來評估RPL34敲減對Saos-2細胞生物學(xué)行為的影響。
7、分別基于UCSC數(shù)據(jù)庫和STING數(shù)據(jù)庫進行RPL34基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子篩查和蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,然后對整合關(guān)系網(wǎng)絡(luò)中的基因進行GO和KEGG通路富集分析,獲得調(diào)控RPL34基因表達的轉(zhuǎn)錄因子和介導(dǎo)RPL34調(diào)控人骨肉瘤細胞增殖的下游相互作用蛋白。
結(jié)果:
1、11例骨肉瘤患者的癌和癌旁組織樣本中:7例(7/11,63.64%)患者的骨肉
6、瘤組織中RPL34的表達顯著高于癌旁組織;3例(3/11,27.27%)患者的骨肉瘤組織和癌旁組織中RPL34的表達無差異;1例(1/11,9.09%)患者的骨肉瘤組織中RPL34表達低于癌旁組織。
2、免疫組織化學(xué)檢測表明:75例(78.95%,75/95)骨肉瘤患者的癌組織染色為強陽性,20例(21.05%,20/95)患者的癌組織染色為弱陽性,而60例正常骨組織染色均為弱陽性;骨肉瘤組織中RPL34蛋白的表達水平明顯高于
7、正常骨組織。
3、對上述95例骨肉瘤患者的生存分析顯示:RPL34蛋白高表達患者的3年生存率為35.42%(17/48),RPL34蛋白低表達患者的3年生存率為61.70%(29/47),RPL34蛋白高表達患者的預(yù)后明顯較差。
4、RPL34 mRNA在4株骨肉瘤細胞(U2OS、MG-63、HOS和Saos-2)中的表達均高于人成骨細胞hFOB1.19。
5、RPL34表達敲減使Saos-2細胞的增殖速率
8、受到顯著抑制,細胞的集落形成數(shù)目減少,并且誘導(dǎo)了Saos-2細胞凋亡和G2/M期阻滯。
6、生物信息學(xué)分析獲得了參與RPL34基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的11個因子,即MYC及MYC相關(guān)因子X(MYC associated factor X,MAX)、CEBPB、E2F6、GABP、NFKB、NRSF、SPI1、TAF1、TBP、YY1,以及RPL34下游與其相互作用的100個蛋白;進一步的GO和KEGG通路富集分析提示:RPL34基因的轉(zhuǎn)
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