大鼠肝再生相關(guān)lncRNA對大鼠肝細(xì)胞株BRL-3A增殖的作用研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、近些年來,研究證明lncRNA能夠調(diào)控多種生理和病理進(jìn)程,包括對大鼠肝再生的調(diào)控。但是lncRNA對肝再生的調(diào)控機(jī)制還不清楚。為了了解lncRNA是如何調(diào)控肝再生,本研究采用高通量測序、RT-PCR檢測大鼠2/3肝切除誘導(dǎo)的肝再生3個時間點肝細(xì)胞中表達(dá)有意義的lncRNA。結(jié)果表明在大鼠肝再生3個時間點肝細(xì)胞中表達(dá)變化有意義的lncRNA有770條,其中差異表達(dá)的lncRNA有28條。分析在肝再生中有意義表達(dá)的lncRNA的具體表達(dá)情況

2、,發(fā)現(xiàn)有254條表達(dá)發(fā)生上調(diào),464條表達(dá)下調(diào),52條表達(dá)上/下調(diào)。差異表達(dá)的28條lncRNA中13條表達(dá)上調(diào),12條表達(dá)下調(diào),3條表達(dá)上/下調(diào)。為了解這些差異表達(dá)的lncRNA對肝再生的調(diào)節(jié)作用,采用生物信息學(xué)方法預(yù)測其靶基因,結(jié)果表明lncRNA的共表達(dá)(TRANS作用)基因中表達(dá)差異的465條。lncRNA的調(diào)控(CIS作用)基因差異表達(dá)的10條。為進(jìn)一步篩選出待研究的lncRNA及其在肝再生中的作用,用DESeq,結(jié)合GO和K

3、EGG信息分析基因功能發(fā)現(xiàn)基因在細(xì)胞中具有多種作用。用Ingenuity中的Ingenuity Pathway Analysis(IPA)檢測大鼠肝再生不同時間點差異表達(dá)的基因相應(yīng)的蛋白質(zhì)在細(xì)胞中作用,結(jié)果顯示相關(guān)基因在細(xì)胞生長、增殖、分化、細(xì)胞通訊、信號傳導(dǎo)、分子運輸、細(xì)胞增殖、作為信號分子等方面具有一定的調(diào)控作用。IPA分析信號通路發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)lncRNA的靶基因主要參與的信號通路有ILK通路、ERK/MAPK通路、SAPK/JNK

4、 Signaling通路等。
  本文從差異表達(dá)lncRNA中篩選其中的兩個并研究其對肝細(xì)胞增殖的調(diào)控作用。高通量測序結(jié)果表明lncRNA TCONS_00027980和TCONS_00042303在肝再生不同時間點表達(dá)水平顯著變化,RT-PCR檢測不同時間點再生肝組織中兩種lncRNA的RNA表達(dá)水平,實驗結(jié)果表明高通量測序結(jié)果是可信的。本文首先用干涉技術(shù)降低lncRNA在大鼠BRL-3A細(xì)胞中的表達(dá)水平,MTT法檢測BRL-3

5、A細(xì)胞的活性,流式細(xì)胞術(shù)檢測BRL-3A增殖情況的變化,RT-PCR和Western-blot用來檢測與增殖相關(guān)基因的表達(dá)情況。檢測結(jié)果表明MTT法檢測表明實驗組比對照組細(xì)胞活性增加(P<0.05);流式細(xì)胞術(shù)實驗檢測顯示與對照組相比,實驗組的S+G2/M期細(xì)胞數(shù)在一定程度上增加了(P<0.05);而real-time PCR(RT-PCR)檢測mRNA表達(dá)水平,結(jié)果表明實驗組與對照組相比,細(xì)胞增殖相關(guān)基因MYC、CCNA2、CCND1

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