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![白令海北部浮游細菌及表層沉積物細菌的系統(tǒng)發(fā)育多樣性分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-2/24/12/b766fed6-c7c5-4284-a06f-f15e70b06a90/b766fed6-c7c5-4284-a06f-f15e70b06a901.gif)
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文檔簡介
1、本研究結合變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術、克隆文庫技術和限制酶切片段長度多態(tài)性(RFLP)等分子生物學手段,首次對白令海北部底、表層水體以及表層沉積物中的細菌群落結構進行比較與分析,并利用Bandscan及多樣性指數對該區(qū)域浮游細菌及表層沉積物細菌的生物多樣性進行評估,取得了以下主要結果: 1.通過PCR-DGGE分析,發(fā)現白令海北部底、表層海水中的細菌生物多樣性水平總體較高,而且底層水體中細菌多樣性指數及豐度明顯高于表層水體
2、;St. Lawrence島北部7個站位的表層和底層水樣,其豐度和多樣性指數平均值低于南部區(qū)域;采樣深度大于100m的3個站位的底層水樣,其多樣性指數隨著深度的增加出現遞增現象。獲得的36條DGGE條帶,其序列除了有2條屬于環(huán)境樣品中的未知菌群以外,涵蓋了以Proteobacteria和Actinobacteria為主的6個門。其中,gamma-Proteobacteria和alpha-Proteobacterium分別以25.0%和2
3、2.2%占據優(yōu)勢地位。另外還包括:Actinobacteria(16.70%),Cyanobacteria(11.1%),delta-Proteobacteria(5.6%),beta-Proteobacteria(2.8%),Firmicutes(5.6%),Bacteroidetes(2.8%)和Verrucomicrobia(2.8%)。其中83.3%的序列與GenBank數據庫中未培養(yǎng)微生物的相似性很高,說明白令海北部底、表層海
4、水中,蘊藏著豐富的未培養(yǎng)微生物資源。 2.對該海域19個站位沉積物樣品的PCR-DGGE分析表明,白令海北部表層沉積物中的細菌多樣性指數、均勻度指數以及豐度的平均值,均明顯高于底、表層水樣的結果。在深度大于100m的幾個站位中,.DBSA站位的多樣性指數及均勻度指數均為最大,而DBSE和DBS1站位的豐度值則在沉積物的19個站位中處于最高。獲得的37條DGGE條帶,有56.8%屬于Proteobacteria,其中delta-P
5、roteobacteria(32.4%)與gamma-Proteobacteria(18.9%)占據優(yōu)勢地位。此外還有:Bacteroidetes(13.5%),Actinobacteria(8.1%),Acidobacteria(8.10%)和Cyanobacteria(2.7%)。另有10.8%的序列屬于環(huán)境樣品中的未知菌群。 3.構建了NEC5、DBSE和DBS1三個站位表層沉積物細菌的16S rDNA文庫,發(fā)現其涵蓋了包
6、括Proteobacteria和Acidobacteria等在內的10-13個門。具體包括:alpha-,beta-,gamma-,delta-和epsilon-Proteobacteria,Acidobacteria,Bacteroidetes,Actinobacteria,Planctomycetes,Nitrospirae,Verrucomicrobia,Chloroflexi,Firmicutes,Chlorobi bacter
7、ium.Gemmatimonadetes,Cyanobacterium,Fibrobacteres和Spirochaetes等。在表層沉積物中最豐富的微生物類群為Proteobacteria,約占所有克隆子的一半。其中delta-Proteobacteria在3個站位中均為優(yōu)勢類群,其次是gamma-Proteobacteria和Acidobacteria。所測序列與GeneBank中已知細菌序列的相似性在84.1-99.8%,其中41
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