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![基于封閉式卡盒的現(xiàn)場傳染病病原體檢測系統(tǒng)的研制與應(yīng)用.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/10/8/7e1bbf01-3c64-48a6-9835-0823519d4633/7e1bbf01-3c64-48a6-9835-0823519d46331.gif)
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文檔簡介
1、近年來,由于環(huán)境變化、自然災(zāi)害、物種多樣性變化等因素,導致各種病毒引起的傳染性疾病不斷爆發(fā)并重復(fù)性出現(xiàn),如SARS病毒、H1N1、H7N9禽流感病毒、中東呼吸綜合征冠狀病毒以及這兩年來談之色變的埃博拉病毒,寨卡病毒等。而且隨著全球化進程的加快以及傳染病病原體傳播途徑的多變性,使得這些傳染病的爆發(fā)不再是局部地域出現(xiàn),更是在全球范圍內(nèi)迅速流行,給人類健康和社會帶來極大的危害。因此,對傳染性疾病的防控、診斷和治療已成為全球公共衛(wèi)生領(lǐng)域的熱點和
2、重點。
然而傳統(tǒng)的傳染性病原體檢測方法大都只適用于實驗室部署環(huán)境,具有檢測過程分散、繁瑣、實驗操作復(fù)雜、對環(huán)境敏感等缺點,并且對實驗員的實驗技能要求較高。這些弊端都大大限制了傳統(tǒng)檢測技術(shù)在現(xiàn)場傳染病檢測中的應(yīng)用。傳染病病原體現(xiàn)場快速檢測要求具有操作簡單、成本低、便攜和易于實現(xiàn)自動化等特點,因此,急需尋找一種新的技術(shù)平臺以滿足傳染病的現(xiàn)場檢測需求。
本論文首先利用3D打印技術(shù),設(shè)計并制作了封閉式的檢測卡盒,在此基礎(chǔ)上研
3、發(fā)了全自動的便攜式核酸檢測系統(tǒng),并對儀器進行了各項性能測試及實際現(xiàn)場傳染病的檢測,成功地完成了現(xiàn)場傳染病從樣本輸入到結(jié)果輸出的自動化檢測過程。具體內(nèi)容包括:
1.基于3D打印技術(shù)的封閉式檢測卡盒的設(shè)計與制造
首先根據(jù)病原體核酸檢測的實驗流程明確了封閉式卡盒的設(shè)計需求,提出了基于柔性滑片的封閉式卡盒結(jié)構(gòu)及其內(nèi)部各功能模塊。整個設(shè)計與制造過程采用了高精度的3D打印技術(shù)及醫(yī)用級PC-ABS材料,共經(jīng)歷5個批次的快速迭代試制
4、過程,設(shè)計和優(yōu)化了卡盒7個特殊零件的結(jié)構(gòu),組裝完成的卡盒尺寸為140 mm×90 mm×30 mm。其內(nèi)部集成移液模塊、樣本處理及檢測區(qū)域,樣本處理范圍為20~1000μL,可同時進行1~6項實時熒光PCR檢測。液體操作范圍為2~200μL,實測在10μL和100μL處的移液相對誤差分別為1.71%和0.76%,重復(fù)性CV值分別為2.3%和0.77%,均優(yōu)于國標規(guī)定。同時,對卡盒內(nèi)的磁珠法核酸提取及PCR配制過程進行了優(yōu)化。最后,實驗證
5、明了上游核酸提取試劑的揮發(fā)對于下游PCR檢測并未造成抑制影響,說明了在封閉式卡盒內(nèi)進行一體化核酸檢測是可行的。
2.基于封閉式卡盒的現(xiàn)場病原體檢測系統(tǒng)的研發(fā)
以封閉式卡盒為基礎(chǔ),研發(fā)了與之配套的自動化驅(qū)動系統(tǒng),其內(nèi)部由移液控制、磁分離加熱、熱循環(huán)、熒光采集及輔助電路等功能模塊組成。其中,移液控制模塊的最大操作量程為260μL,精度為0.118μL,內(nèi)含濾芯以防止交叉污染;磁分離加熱模塊采用傾斜式滑動結(jié)構(gòu),可程序化控制
6、磁富集的位置,且溫控精度為±0.5℃,可在2 min內(nèi)升至目標溫度;熱循環(huán)模塊可提供3通道的PCR反應(yīng)條件,其升降溫速度分別為4.6℃/s及4.0℃/s,控制精度為±0.3℃;熒光采集模塊提供雙色熒光通道(FAM/SYBR Green和Texas Red波長的范圍的),采用單色LED作為激發(fā)光源,波動性小于1μW,單次熒光信號的采集在2.5s內(nèi)完成。儀器整體尺寸為270 mm×275 mm×250 mm,重量為6.5 kg?,F(xiàn)場操作時僅
7、需將帶樣本的卡盒放入儀器中,并配置實驗參數(shù),則可自動完成整個檢測流程。
3.現(xiàn)場病原體檢測系統(tǒng)的性能測試
首先使用百日咳病毒質(zhì)粒DNA進行了核酸提取效率的對比實驗,系統(tǒng)和手工提取的效率分別為95.49%和84.33%;使用HBV質(zhì)粒DNA測試獲得了104copies/mL的提取限,說明系統(tǒng)的樣本處理能力在效率和靈敏度方面均可滿足下游PCR檢測的需求。同時,分別使用E.coli及HBV病毒的真實臨床樣本進行了核酸提取對
8、比實驗,結(jié)果顯示采用本系統(tǒng)操作在產(chǎn)量上比手工操作分別高出6.6 ng/μL和0.93 ng/μL。通過平行實驗測得本系統(tǒng)的實時熒光PCR檢測孔間差異為0.023(CV值),檢測限為104 copies/mL。最后,使用本系統(tǒng)連續(xù)運行20次陰性和陽性樣本的間隔實驗,測試結(jié)果與預(yù)期一致,表明系統(tǒng)沒有發(fā)生批間交叉污染的現(xiàn)象。
4.現(xiàn)場傳染病檢測實驗
在江蘇省疾病防控中心進行了腺病毒的檢測實驗,并采用羅氏LightCycle
9、r2.0熒光定量PCR儀進行實驗對照,獲得未知樣本的Ct值分別為31.15和31.68,陽參的Ct值分別為27.52和28.01,從擴增曲線形態(tài)和Ct值的比較說明兩系統(tǒng)的檢測結(jié)果較為一致。最后,使用本卡盒系統(tǒng)對沙門氏菌及志賀氏菌進行聯(lián)合檢測,并設(shè)置卡盒內(nèi)采用懸滴加樣的方式進行PCR體系的配置,同時采用ABISteponePlus實時熒光定量PCR系統(tǒng)進行實驗對照。兩系統(tǒng)的擴增曲線形態(tài)一致,兩路熒光檢測(FAM and Texas Red
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