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![四種自然疫源病原體可視化LAMP檢測(cè)技術(shù)建立與現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)箱組研制.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/11/8/e7f55198-f599-4920-8e69-bc0d36a82bc3/e7f55198-f599-4920-8e69-bc0d36a82bc31.gif)
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文檔簡(jiǎn)介
1、高致病性豬鏈球菌病、炭疽病、高致病性禽流感、腎綜合征出血熱等自然疫源性疾病病死率高,又多通過(guò)野外環(huán)境中的媒介節(jié)肢動(dòng)物、嚙齒動(dòng)物、禽類(lèi)傳播,嚴(yán)重威脅畜牧業(yè)生產(chǎn)、經(jīng)營(yíng)甚至接觸的人群,以及野外訓(xùn)練官兵、作戰(zhàn)部隊(duì)的健康和生命安全。這些重要的自然疫源性疾病,平時(shí)亦可引發(fā)突發(fā)公共衛(wèi)生事件,引起普遍恐慌。另外值得注意的是,部分國(guó)家或地區(qū)已經(jīng)將自然疫源性疾病病原列入生物戰(zhàn)計(jì)劃當(dāng)中,作為生物戰(zhàn)/生物恐怖病原。上述疫病的早期臨床表現(xiàn)常常難以鑒別,最終病因確
2、認(rèn)有賴(lài)病原檢測(cè),盡快篩查并明確診斷對(duì)控制疫情至關(guān)重要。
易于現(xiàn)場(chǎng)使用的膠體金免疫層析技術(shù),存在難以克服的敏感性問(wèn)題;核酸檢測(cè)方法目前主要為PCR或?qū)崟r(shí)熒光定量PCR,但昂貴精密的PCR儀難以在現(xiàn)場(chǎng)展開(kāi),成為其被廣泛使用的障礙。病原應(yīng)急檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展趨勢(shì)是能早期在疫源地快速檢測(cè)出病原特異性的致病基因和毒力基因,敏感性好;無(wú)需對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳或雜交后的復(fù)雜清洗步驟,操作簡(jiǎn)單,易于規(guī)范;成本適宜或低廉。環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增(LAMP)及
3、逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增(RT-LAMP)技術(shù)恰恰具有上述特點(diǎn),在應(yīng)用于自然疫源性疾病病原檢測(cè)方面有著明顯的優(yōu)勢(shì)。
本研究針對(duì)多種重要和新發(fā)自然疫源性疾病病原體,研究快速篩查檢測(cè)的LAMP/RT-LAMP方法及配套便攜裝備。綜合應(yīng)用可視化LAMP/RT-LAMP全封閉檢測(cè)技術(shù),研究對(duì)自然疫源性疾病病原進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)快速篩查的方法和檢測(cè)試劑(引物、反應(yīng)體系),可檢測(cè)高致病性豬鏈球菌2型、炭疽桿菌(可鑒定強(qiáng)毒株、弱毒株)、H7N9禽流感病毒
4、、腎綜合征出血熱病毒(可區(qū)分漢城型、漢灘型)等自然疫源性疾病病原,具有快速、敏感的特點(diǎn)。在建立病原LAMP檢測(cè)方法的同時(shí),還設(shè)計(jì)制作一套便攜式恒溫檢測(cè)箱組(基于小型恒溫金屬浴的可視化LAMP檢測(cè)箱),采用車(chē)載逆變電源和鋰電池供電,可立足自身保障,在疫情現(xiàn)場(chǎng)或野外進(jìn)行篩查檢測(cè)。
具體研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下:
一、Cps2j-LAMP和Salk-LAMP檢測(cè)方法的建立及其在快速鑒定高致病性S.suis2中的應(yīng)用
豬
5、鏈球菌2型是豬鏈球菌病最主要的病原,也是一些發(fā)展中國(guó)家急性細(xì)菌性腦膜炎的主要病原,其中引發(fā)鏈球菌中毒性休克綜合癥(死亡率達(dá)80%以上)的高致病性強(qiáng)毒株含有獨(dú)特的“89K毒力島”,可作為判定豬鏈球菌2型毒力強(qiáng)弱的重要指標(biāo)。本研究建立了快速檢測(cè)高致病性豬鏈球菌2型及其89K毒力島的LAMP檢測(cè)方法,最快只需擴(kuò)增18 min即可出檢測(cè)結(jié)果,靈敏度可達(dá)7.16拷貝每反應(yīng)。還應(yīng)用完全相同的一套核酸梯度稀釋模板(豬鏈球菌05ZYH33株),針對(duì)建立
6、的同一細(xì)菌不同靶基因的兩套LAMP反應(yīng)體系,對(duì)目前LAMP技術(shù)的五種常見(jiàn)終點(diǎn)可視化檢測(cè)方法進(jìn)行了測(cè)試比較。
二、炭疽桿菌雙重可視化LAMP檢測(cè)方法的建立及其在強(qiáng)弱毒株判定中的應(yīng)用
選擇炭疽桿菌編碼保護(hù)性抗原的PA基因(在pX01毒力質(zhì)粒上),以及與莢膜合成相關(guān)的capA基因(在pX02毒力質(zhì)粒上)作為檢測(cè)靶基因,建立了一種能實(shí)現(xiàn)不開(kāi)蓋,無(wú)需濁度儀即能實(shí)現(xiàn)肉眼可視化檢測(cè),又同時(shí)能區(qū)分強(qiáng)毒株、弱毒株或無(wú)毒株(即可初步判定
7、毒力)的雙重LAMP檢測(cè)方法,檢出限均為50拷貝每反應(yīng)。除雙重LAMP法檢測(cè)炭疽桿菌外,本研究還制備一種用于炭疽桿菌核酸檢測(cè)的通用陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,可兼容目前的絕大部分炭疽桿菌核酸檢測(cè)方法,具有全面性、普遍適用性和可比性;組裝了LAMP法檢測(cè)炭疽桿菌的凍干粉試劑盒,可常溫儲(chǔ)存,有可能應(yīng)用于應(yīng)對(duì)突發(fā)傳染病疫情和現(xiàn)場(chǎng)反生物恐怖襲擊預(yù)警等。
三、高致病性H7N9禽流感RT-LAMP檢測(cè)方法建立與臨床應(yīng)用
建立了快速檢測(cè)H7N
8、9禽流感病毒的RT-LAMP檢測(cè)方法,只需12 min至23 min內(nèi)即可出擴(kuò)增檢測(cè)結(jié)果。其中檢測(cè)血凝素(HA)基因的RT-LAMP(H7-RT-LAMP)的敏感性與WHO推薦的實(shí)時(shí)熒光定量PCR(H7-rRT-PCR)的敏感性相同;而檢測(cè)神經(jīng)氨酸酶(NA)基因的N9-RT-LAMP比WHO推薦的N9-rRT-PCR方法靈敏100倍。本研究應(yīng)用135例臨床標(biāo)本(包括患者和禽類(lèi)標(biāo)本)對(duì)建立的H7N9禽流感病毒的RT-LAMP檢測(cè)方法進(jìn)行了
9、測(cè)試比較:對(duì)已確診病例的檢測(cè)均為陽(yáng)性;對(duì)疫情爆發(fā)期間某活禽市場(chǎng)禽類(lèi)標(biāo)本的檢測(cè),陽(yáng)性率為20.87%(24/115)。在H7基因核酸檢測(cè)陽(yáng)性的樣品中,N9-RT-LAMP對(duì)N9基因的檢出率顯著高于對(duì)應(yīng)的N9-rRT-PCR。這種對(duì)于N9基因片段的高辨別力,可能有助于更好的將H7N9病毒從H7N1、H7N2、H7N3、H7N7等其它H7亞型病毒中區(qū)分出來(lái)。
四、腎綜合征出血熱病毒RT-LAMP檢測(cè)方法的建立與臨床測(cè)試
腎
10、綜合征出血熱病例集中在山區(qū)和丘陵地帶,中國(guó)是全球疫情最為嚴(yán)重的國(guó)家。本研究建立了腎綜合征出血熱病毒的RT-LAMP檢測(cè)方法,并能區(qū)分目前在中國(guó)的主要流行株漢灘型病毒、漢城型病毒,具有操作簡(jiǎn)便、快速、特異、敏感的特點(diǎn),結(jié)合終點(diǎn)檢測(cè)的羥基萘酚藍(lán)(HNB)法,可以直接通過(guò)顏色變化肉眼判斷結(jié)果,實(shí)驗(yàn)過(guò)程無(wú)需開(kāi)蓋,減少污染風(fēng)險(xiǎn),有可能作為目前腎綜合征出血熱病毒血清學(xué)檢測(cè)方法的有益補(bǔ)充。
五、病原核酸恒溫現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)箱的研制
為解決
11、野外、現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)的瓶頸問(wèn)題(無(wú)市電、無(wú)冷鏈、無(wú)工作臺(tái)面),組裝了基于恒溫?cái)U(kuò)增和凍干技術(shù),包含能常溫儲(chǔ)備的凍干粉可視化檢測(cè)試劑、小型儀器及必需耗材(加樣器、吸頭、常溫下核酸抽提的磁珠試劑等),能夠在現(xiàn)場(chǎng)完成LAMP(或病毒類(lèi)的逆轉(zhuǎn)錄LAMP)恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)全過(guò)程的便攜式試劑箱組。設(shè)計(jì)為除市電外,還可使用鋰電池,或車(chē)載逆變電源模塊供電(通用于普通汽車(chē)),便于野外機(jī)動(dòng)使用。
研究結(jié)果表明,對(duì)于高致病性豬鏈球菌病、炭疽病、H7N9禽流感、
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