基于蛋白質組學研究口腔癌預測淋巴結轉移新型標記物的探索.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:探討預測口腔癌淋巴結轉移的新型分子標記物。
  方法:選取8例口腔鱗狀細胞癌新鮮組織標本,分為淋巴結轉移陽性組(M組)4例和陰性組(N組)4例,分組混合,形成1對標本;采用雙向凝膠電泳技術(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)分離兩組的差異蛋白點,基質輔助激光解吸電離串聯(lián)飛行時間質譜(MALDI-TOF-TOF MS)鑒定差異蛋白,并對質譜鑒定出的蛋白質進行生物信息學分析。

2、>  結果:采用雙向凝膠電泳技術分離兩組的差異蛋白點,共獲得39個差異蛋白點,其中包含27個上調蛋白位點和12個下調蛋白位點,進行MADLDI-TOF-TOF MS鑒定,通過差異比率、蛋白質通路以及互作蛋白質等綜合分析,篩選出9個顯著差異表達蛋白質,其中上調蛋白質6個,下調蛋白質3個。
  結論:①運用2-DE結合MALDI-TOF-TOF MS對淋巴結轉移陽性組和陰性組進行差異分析。得到了39個差異蛋白點,其中包含27個上調蛋白

3、位點和12個下調蛋白位點,通過綜合分析,篩選出9個顯著差異表達蛋白,其中上調蛋白質6個,下調蛋白質3個;②通過Swiss-prot蛋白庫的注釋信息對得到鑒定的9種淋巴結轉移相關蛋白質進行生物學分析,提示這些蛋白質分布于多種通路參與細胞增殖、分化、凋亡、轉錄、粘附、血管形成、以及蛋白質翻譯、合成、加工、修飾等功能;③口腔癌的淋巴結轉移是一個多因素、多步驟、多種細胞功能異常所導致的復雜病理過程,這些差異蛋白質可以在蛋白質通路以及互作蛋白質關

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