乳腺癌血清microRNA表達(dá)譜差異分析及其功能驗證.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:
  以臨床確診的乳腺癌患者和正常體檢人員為對象,研究兩者血清中miRNAs的表達(dá)譜差異,通過篩選驗證,獲得乳腺癌血清特異性目的miRNAs,加快血清miRNA作為biomarker向臨床轉(zhuǎn)化的應(yīng)用進(jìn)程,為乳腺癌的診斷治療提供了新的潛在生物學(xué)標(biāo)志物,同時對miRNA在乳腺癌中的功能進(jìn)行初步研究,為miRNA乳腺癌發(fā)生發(fā)展中作用機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。
  方法:
  選取10例確診的乳腺癌病人和10例正常人樣本,利用高

2、通量測序?qū)?0對乳腺癌病理組織、旁組織、血清和正常人血清進(jìn)行miRNA測序,并利用TargetScan、Clip-seq等數(shù)據(jù)庫篩選出在乳腺癌中特異表達(dá)的miRNAs;利用實(shí)時熒光定量RT-PCR對篩選結(jié)果進(jìn)行大樣本血清驗證,利用SPSS統(tǒng)計分析,篩選出差異性表達(dá)的目的miRNAs,設(shè)計合成miRNA抑制劑,轉(zhuǎn)染至乳腺癌細(xì)胞MB-435、MB-468,利用CCK8檢測乳腺癌細(xì)胞株轉(zhuǎn)染miRNA inhibitor后的活力,利用Targe

3、tScan、miRanda預(yù)測具有功能表達(dá)的miRNA靶基因,為功能研究奠定基礎(chǔ)。
  結(jié)果:
  1.分析乳腺癌病理組織、旁組織和正常人血清的miRNA高通量測序測序結(jié)果,通過對不同樣本的Clean data的比較,分析其共有Reads以及特有的Reads,以log2(FoldChange)>=1、P-value<0.01為差異表達(dá)的篩選標(biāo)準(zhǔn),在986條差異表達(dá)中篩選出28個差異性表達(dá)的miRNAs,包括hsa-miR-1

4、44-3p、hsa-miR-140-3p、hsa-let-7i-5p、hsa-miR-323-5p、hsa-miR-110a-5p、hsa-miR-29a-3p、hsa-miR-326-5p、hsa-miR-106b-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-195a-5p、hsa-miR-19b-3p、hsa-miR-101-3p、hsa-miR-374-5p、hsa-miR-26a、hsa-mi

5、R-23-5p、hsa-miR-19b、hsa-miR-143、hsa-miR-30a、hsa-miR-126、hsa-miR-125b、hsa-miR-10a、hsa-miR-10b、hsa-miR-99a、hsa-miR-451a、hsa-miR-320a、hsa-miR-223-3p。
  2.以差異表達(dá)量大于2倍以上,RT-PCR中CT值小于30作為標(biāo)準(zhǔn),共篩選出4條特異目的miRNAs,即hsa-miR-374a-5p、

6、hsa-miR-223-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-320a進(jìn)行血清學(xué)表達(dá)驗證分析。
  3.在113例乳腺癌患者以及104例健康對照組血清中對目標(biāo)miRNAs表達(dá)進(jìn)行定量分析,結(jié)果表明miRNAs在血清中穩(wěn)定表達(dá),乳腺癌組與對照組相比,hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-223-3p、hsa-miR-423-5p及hsa-miR-320a相對表達(dá)量上調(diào),乳腺癌患者血清中4個目標(biāo)miRNAs的表

7、達(dá)情況與前期乳腺癌組織中的表達(dá)情況一致,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),目的miRNAs的表達(dá)與臨床病理特征存在一定相關(guān)性。
  4.我們選取測序結(jié)果中和驗證的目的miRNAs,利用CCK8檢測轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞活力情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn),miR-223-3p inhibitor在MDA-MB-468中抑制miR-223-3p的表達(dá),從而抑制MDA-MB-468的活力;同時,miR-423-5p inhibitor在MDA-MB-468和M

8、DA-MB-453中同時抑制這兩種細(xì)胞活力表達(dá),提示miR-223-3p、miR-423-5p對乳腺癌細(xì)胞活性存在調(diào)控作用,具有抑制抑癌基因的功能;另利用TargetScan、miRanda兩個數(shù)據(jù)庫對miR-223-3p、miR-423-5p的靶基因進(jìn)行預(yù)測,為下一步乳腺癌特異miRNA的功能研究奠定基礎(chǔ)。
  結(jié)論:
  本課題選取乳腺癌組織、癌旁組織以及乳腺癌血清和正常人血清為研究對象,利用新一代高通量測序篩選出差異表

9、達(dá)的miRNAs,初步建立了乳腺癌特異性的miRNAs差異表達(dá)譜。在對測序結(jié)果中表達(dá)上調(diào)的miR-374a-5p、miR-223-3p、miR-423-5p、miR-320a血清學(xué)驗證發(fā)現(xiàn),其在血清和組織中的表達(dá)趨勢一致,并與臨床病理存在著關(guān)聯(lián),有可能作為乳腺癌診斷的潛在標(biāo)志物;在利用CCK-8檢測4個上調(diào)的miRNAs的功能中發(fā)現(xiàn),miR-223-3p、miR-423-5p在乳腺癌細(xì)胞中具有功能表達(dá),可能發(fā)揮著抑制抑癌基因的作用,影響

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