![](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/10/8/1c5ba880-2de1-4d0c-b3b8-23c3e678b37d/1c5ba880-2de1-4d0c-b3b8-23c3e678b37dpic.jpg)
![乳腺癌血清microRNA表達(dá)譜差異分析及其功能驗證.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/10/8/1c5ba880-2de1-4d0c-b3b8-23c3e678b37d/1c5ba880-2de1-4d0c-b3b8-23c3e678b37d1.gif)
版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡介
1、目的:
以臨床確診的乳腺癌患者和正常體檢人員為對象,研究兩者血清中miRNAs的表達(dá)譜差異,通過篩選驗證,獲得乳腺癌血清特異性目的miRNAs,加快血清miRNA作為biomarker向臨床轉(zhuǎn)化的應(yīng)用進(jìn)程,為乳腺癌的診斷治療提供了新的潛在生物學(xué)標(biāo)志物,同時對miRNA在乳腺癌中的功能進(jìn)行初步研究,為miRNA乳腺癌發(fā)生發(fā)展中作用機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。
方法:
選取10例確診的乳腺癌病人和10例正常人樣本,利用高
2、通量測序?qū)?0對乳腺癌病理組織、旁組織、血清和正常人血清進(jìn)行miRNA測序,并利用TargetScan、Clip-seq等數(shù)據(jù)庫篩選出在乳腺癌中特異表達(dá)的miRNAs;利用實(shí)時熒光定量RT-PCR對篩選結(jié)果進(jìn)行大樣本血清驗證,利用SPSS統(tǒng)計分析,篩選出差異性表達(dá)的目的miRNAs,設(shè)計合成miRNA抑制劑,轉(zhuǎn)染至乳腺癌細(xì)胞MB-435、MB-468,利用CCK8檢測乳腺癌細(xì)胞株轉(zhuǎn)染miRNA inhibitor后的活力,利用Targe
3、tScan、miRanda預(yù)測具有功能表達(dá)的miRNA靶基因,為功能研究奠定基礎(chǔ)。
結(jié)果:
1.分析乳腺癌病理組織、旁組織和正常人血清的miRNA高通量測序測序結(jié)果,通過對不同樣本的Clean data的比較,分析其共有Reads以及特有的Reads,以log2(FoldChange)>=1、P-value<0.01為差異表達(dá)的篩選標(biāo)準(zhǔn),在986條差異表達(dá)中篩選出28個差異性表達(dá)的miRNAs,包括hsa-miR-1
4、44-3p、hsa-miR-140-3p、hsa-let-7i-5p、hsa-miR-323-5p、hsa-miR-110a-5p、hsa-miR-29a-3p、hsa-miR-326-5p、hsa-miR-106b-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-195a-5p、hsa-miR-19b-3p、hsa-miR-101-3p、hsa-miR-374-5p、hsa-miR-26a、hsa-mi
5、R-23-5p、hsa-miR-19b、hsa-miR-143、hsa-miR-30a、hsa-miR-126、hsa-miR-125b、hsa-miR-10a、hsa-miR-10b、hsa-miR-99a、hsa-miR-451a、hsa-miR-320a、hsa-miR-223-3p。
2.以差異表達(dá)量大于2倍以上,RT-PCR中CT值小于30作為標(biāo)準(zhǔn),共篩選出4條特異目的miRNAs,即hsa-miR-374a-5p、
6、hsa-miR-223-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-320a進(jìn)行血清學(xué)表達(dá)驗證分析。
3.在113例乳腺癌患者以及104例健康對照組血清中對目標(biāo)miRNAs表達(dá)進(jìn)行定量分析,結(jié)果表明miRNAs在血清中穩(wěn)定表達(dá),乳腺癌組與對照組相比,hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-223-3p、hsa-miR-423-5p及hsa-miR-320a相對表達(dá)量上調(diào),乳腺癌患者血清中4個目標(biāo)miRNAs的表
7、達(dá)情況與前期乳腺癌組織中的表達(dá)情況一致,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),目的miRNAs的表達(dá)與臨床病理特征存在一定相關(guān)性。
4.我們選取測序結(jié)果中和驗證的目的miRNAs,利用CCK8檢測轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞活力情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn),miR-223-3p inhibitor在MDA-MB-468中抑制miR-223-3p的表達(dá),從而抑制MDA-MB-468的活力;同時,miR-423-5p inhibitor在MDA-MB-468和M
8、DA-MB-453中同時抑制這兩種細(xì)胞活力表達(dá),提示miR-223-3p、miR-423-5p對乳腺癌細(xì)胞活性存在調(diào)控作用,具有抑制抑癌基因的功能;另利用TargetScan、miRanda兩個數(shù)據(jù)庫對miR-223-3p、miR-423-5p的靶基因進(jìn)行預(yù)測,為下一步乳腺癌特異miRNA的功能研究奠定基礎(chǔ)。
結(jié)論:
本課題選取乳腺癌組織、癌旁組織以及乳腺癌血清和正常人血清為研究對象,利用新一代高通量測序篩選出差異表
9、達(dá)的miRNAs,初步建立了乳腺癌特異性的miRNAs差異表達(dá)譜。在對測序結(jié)果中表達(dá)上調(diào)的miR-374a-5p、miR-223-3p、miR-423-5p、miR-320a血清學(xué)驗證發(fā)現(xiàn),其在血清和組織中的表達(dá)趨勢一致,并與臨床病理存在著關(guān)聯(lián),有可能作為乳腺癌診斷的潛在標(biāo)志物;在利用CCK-8檢測4個上調(diào)的miRNAs的功能中發(fā)現(xiàn),miR-223-3p、miR-423-5p在乳腺癌細(xì)胞中具有功能表達(dá),可能發(fā)揮著抑制抑癌基因的作用,影響
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 應(yīng)用microRNA微陣列技術(shù)研究乳腺癌microRNA的差異表達(dá)譜.pdf
- 乳腺癌血清差異表達(dá)microRNA篩選和臨床應(yīng)用研究.pdf
- 乳腺癌基因組表達(dá)譜中miRNA的血清學(xué)差異性表達(dá)分析.pdf
- 原代乳腺癌干細(xì)胞富集及基因表達(dá)譜和MicroRNAs差異表達(dá)分析.pdf
- KLK5在乳腺癌中的表達(dá)及其靶向microRNA的預(yù)測和驗證.pdf
- MicroRNA在乳腺癌血清中的異常表達(dá)及mir-205功能的初步研究.pdf
- 乳頭溢液及血液中乳腺癌相關(guān)MicroRNA篩選驗證及其功能預(yù)測的研究.pdf
- 賁門腺癌microRNA表達(dá)譜的篩查與驗證.pdf
- 乳腺癌不同分子亞型差異表達(dá)microRNAs的綜合分析及microRNA-9-5p功能研究.pdf
- 血清microRNA作為乳腺癌診斷標(biāo)志物的研究.pdf
- TBX3在乳腺癌患者血清中的表達(dá)差異及其臨床意義.pdf
- 乳腺癌患者血清中ADM的表達(dá)及其意義.pdf
- 乳腺癌異常鞘糖脂的表達(dá)及其功能的研究.pdf
- 血清饑餓條件下microRNA表達(dá)譜的變化及其功能研究.pdf
- 基于芯片技術(shù)分析乳腺癌甲基化表達(dá)譜及其與基因表達(dá)關(guān)系的研究.pdf
- 乳腺癌術(shù)后骨轉(zhuǎn)移患者血清差異蛋白的MALDI質(zhì)譜分析.pdf
- 乳腺癌病人組織和血液中microRNA的表達(dá):一種潛在的乳腺癌篩選標(biāo)記.pdf
- 人乳腺癌細(xì)胞株miRNAs的差異表達(dá)譜及hsa-miR-340對乳腺癌細(xì)胞侵襲力的影響.pdf
- 乳腺腫瘤差異表達(dá)譜的初步分析.pdf
- 胰腺導(dǎo)管腺癌lncRNAs差異表達(dá)譜的篩選及功能分析.pdf
評論
0/150
提交評論