利用基因芯片篩選乳腺癌相關(guān)差異表達(dá)基因.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、背景:目前乳腺癌已經(jīng)在世界范圍內(nèi)成為嚴(yán)重威脅女性健康的重大惡性疾病之一。上世紀(jì)80年代以來,在全球范圍內(nèi)乳腺癌分發(fā)病率都呈現(xiàn)出非常明顯的上升趨勢,每年以2%~3%的速度遞增,而這一現(xiàn)象在發(fā)展中國家尤為突出。有數(shù)據(jù)顯示,2000~2005年,中國乳腺癌發(fā)病人數(shù)增長38.5%,死亡人數(shù)增長37.1%。目前乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程尚不完全明了,從而在一定程度上對乳腺癌的早期診斷、相關(guān)治療帶來很大的困惑。任何腫瘤的發(fā)生發(fā)展都包含了十分復(fù)雜的生物學(xué)過程

2、。對個體而言,所有機(jī)體細(xì)胞攜帶相同的遺傳模板,那么各種細(xì)胞型,包括癌細(xì)胞在內(nèi),是如何獲得不同的表型的呢?科學(xué)家最終發(fā)現(xiàn),各種類型細(xì)胞對基因組的選擇性表達(dá)決定了細(xì)胞的不同表型,同時提示我們基因表達(dá)的異常改變是正常細(xì)胞向惡性腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)變的基礎(chǔ)。任何腫瘤都起源于正常組織,腫瘤細(xì)胞是由失去了聚集能力和構(gòu)成正常組織能力的細(xì)胞構(gòu)成的。RNA,是連接DNA與蛋白的橋梁。通過分析RNA水平的差異,能夠為我們下一步在分子水平研究相關(guān)基因/蛋白在疾病發(fā)生發(fā)

3、展過程中的作用提供理論依據(jù),也是尋找疾病相關(guān)基因/蛋白的一種理想方法。因此通過基因表達(dá)譜芯片比較乳腺癌及正常乳腺組織的差異表達(dá)基因,并據(jù)此進(jìn)行相關(guān)生物學(xué)過稱與乳腺癌發(fā)生發(fā)展之間的關(guān)系,將對明確乳腺癌的生物學(xué)過程提供一定的研究基礎(chǔ)。
   目的:本次研究旨在探索乳腺癌組織與自身正常乳腺組織、乳腺良性疾病之間的差異表達(dá)基因,為今后進(jìn)一步研究相關(guān)基因與乳腺癌的關(guān)系,相關(guān)基因或其表達(dá)產(chǎn)物在乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程中的作用打下基礎(chǔ)。
  

4、 方法:本研究采用全人類基因組芯片,檢測7對乳腺癌及其正常乳腺組織、7例乳腺良性疾病的差異表達(dá)基因,通過real-time PCR對芯片試驗結(jié)果進(jìn)行驗證,并根據(jù)GeneOntology(GO)分類體系初步對得出的差異表達(dá)基因進(jìn)行功能分類。
   結(jié)果:
   1.差異表達(dá)基因:乳腺癌組織同癌旁正常乳腺組織相比,共得出344個差異表達(dá)基因。在這一組基因中,上表達(dá)的有273個,下表達(dá)的有71個(與細(xì)胞增殖有關(guān)的基因有27個

5、,其中上表達(dá)的有21個,下表達(dá)的有6個;與細(xì)胞粘附有關(guān)的基因有15個,其中上表達(dá)的有5個,下表達(dá)的有10個;與細(xì)胞凋亡有關(guān)的基因有23個,其中上表達(dá)的有20個,下表達(dá)的有3個)。乳腺癌組織與乳腺良性疾病的差異表達(dá)基因有235個,上表達(dá)的有140個,下表達(dá)的有95個(與細(xì)胞增殖有關(guān)的基因有10個,其中上表達(dá)的有8個,下表達(dá)的有2個;與細(xì)胞粘附有關(guān)的基因有12個,其中上表達(dá)的有7個,下表達(dá)的有5個;與細(xì)胞凋亡有關(guān)的基因有11個,其中上表達(dá)的

6、有10個,下表達(dá)的有1個)。
   2.乳腺癌和正常乳腺組織的聚類分析:采用cluster3.0軟件對所得實驗數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析,可以發(fā)現(xiàn)三種乳腺組織不能完全分開。單純分析7對乳腺癌和癌旁正常乳腺組織,聚類分析圖顯示二者也不能夠完整的分開。
   結(jié)論:乳腺癌組織與正常乳腺組織間在基因的表達(dá)層面存在明顯差異。篩選得到的基因涉及細(xì)胞增殖、細(xì)胞粘附、細(xì)胞凋亡等腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要生物學(xué)過程,可能與乳腺癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),但仍需

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