乳腺癌基因芯片數(shù)據(jù)分析及方法學(xué)研究.pdf_第1頁(yè)
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1、研究目的:在基因芯片數(shù)據(jù)分析中,探索一種合適的統(tǒng)計(jì)分析方法使其利用盡可能少的基因達(dá)到較好的預(yù)測(cè)效果。 研究意義:從術(shù)時(shí)基因表達(dá)的角度探討乳腺癌病人預(yù)后預(yù)測(cè)的問(wèn)題,為進(jìn)一步的綜合微觀的基因表達(dá)水平,宏觀的臨床表型和干預(yù)措施等的預(yù)后預(yù)測(cè)和動(dòng)態(tài)預(yù)后預(yù)測(cè)等進(jìn)一步的研究提供基礎(chǔ)。 研究?jī)?nèi)容:利用模擬數(shù)據(jù)客觀評(píng)價(jià)各差異表達(dá)基岡篩選方法的效果:利用模擬數(shù)據(jù)評(píng)價(jià)兩種分類預(yù)測(cè)方法在不同基岡相關(guān)性條件下的預(yù)測(cè)能力:并結(jié)合乳腺癌案例數(shù)據(jù)篩選可

2、用于預(yù)測(cè)乳腺癌病人預(yù)后的基因。 研究方法:首先設(shè)定差異表達(dá)基因和非差異表達(dá)基因的概率分布,產(chǎn)生模擬數(shù)據(jù),用各種篩選差異表達(dá)基因的方法進(jìn)行分析后計(jì)算相應(yīng)的評(píng)價(jià)指標(biāo),從陽(yáng)性基因數(shù)日、假陽(yáng)性基因數(shù)目和假陽(yáng)性率來(lái)對(duì)各方法進(jìn)行評(píng)價(jià)。利用混合線性模型產(chǎn)生預(yù)測(cè)研究用的表達(dá)水平相關(guān)的模擬基因表達(dá)數(shù)據(jù)。用PAM法和三步法分析,比較分析結(jié)果和設(shè)定值的差異,從約登指數(shù)、假陽(yáng)性率及建?;鶎鶖?shù)日來(lái)評(píng)價(jià)兩方法的優(yōu)缺點(diǎn)。最后利用三步法對(duì)案例數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選

3、出預(yù)測(cè)乳腺癌病人預(yù)后的預(yù)后基岡,并通過(guò)生物信息學(xué)對(duì)這些基岡進(jìn)行功能的查找和文獻(xiàn)支持。 主要結(jié)果:SAM的假陽(yáng)性率僅次于Bonferroni修正法、Sidak修正法、Bootstrap修正法和、Permutation修正法、StepdownBonferroni修正法、StepdownSidak修正法、StepdownBootstrap修正法和StepdownPermutation修正法這8種保守的方法,但其篩檢出的差異表達(dá)基因個(gè)數(shù)

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