1、黑斑原鮡（Glyptosternum maculatum Regan）隸屬于鲇形目（Siluriformes）、鮡科（Sisoridae）、原鮡屬（Glyptosternum），主要分布在雅魯藏布江干流及其支流，是唯一一種分布到雅魯藏布江中上游的鮡科魚類。黑斑原鮡在雅魯藏布江的兩支流，尼洋河、拉薩河和謝通門江段三地均存在著產(chǎn)卵場，漁獲個體大小差異明顯，確定他們是否為三個相對獨立的種群，還是一個種群，對于資源保護(hù)和合理利用都具有重要價值。

2、本文利用AFLP和SSR兩種分子標(biāo)記方法，研究雅魯藏布江兩支流，尼洋河、拉薩河和謝通門江段黑斑原鮡地理群體的遺傳多樣性，重要結(jié)果如下：
　　 1．AFLP與SSR兩種標(biāo)記揭示了黑斑原鮡物種的遺傳多樣性水平
　　 （1）選用81對AFLP引物組合對3個地理群體共96個樣本進(jìn)行了遺傳多樣性研究，選出的5對多態(tài)性引物組合共擴增出332條清晰可辨、可重復(fù)的條帶，平均每對引物組合擴增出66.4條帶；332條擴增出的條帶中有51條帶

3、是多態(tài)的，多態(tài)條帶范圍在8（E-AAC/T-AAG，E-AAG/T-AAT和E-AAT/T-AGA）和17條（E-AAC/T-AAT）之間，平均為10.2條。3個地理群體的遺傳距離（D）分布范圍在0.0015-0.0042之間。
　　 （2）選用28對SSR引物對3個黑斑原鮡地理群體共96個樣本進(jìn)行了遺傳多樣性研究，選出的6對SSR多態(tài)性引物共擴出20個等位基因，平均每個位點為3.2個等位基因，多態(tài)信息含量為0.0394-0.4

4、159，平均0.2837，屬中度多態(tài)，可作為黑斑原鮡遺傳標(biāo)記分析有效的微衛(wèi)星引物。3個地理群體的遺傳距離（D）分布范圍在0.0022-0.0778之間。
　　 2．AFLP標(biāo)記和SSR標(biāo)記的比較
　　 AFLP標(biāo)記共產(chǎn)生332條清晰可辨、可重復(fù)的條帶，其中51條帶是多態(tài)的；SSR標(biāo)記共擴出20個等位基因。這兩種分子標(biāo)記的研究結(jié)果比較一致：均揭示了黑斑原鮡群體遺傳多樣性水平比較低，并且拉薩河群體遺傳多樣性最低；3個地理群體

5、間無遺傳差異。AFLP和SSR都是評價黑斑原鮡遺傳多樣性有效的分子標(biāo)記。
　　 3．黑斑原鮡微衛(wèi)星序列的開發(fā)
　　 在本研究所用的生物素標(biāo)記的（CA）15探針構(gòu)建的富集文庫克隆中，720個（70％）為初步定為含有微衛(wèi)星序列（含有兩到三條帶）的陽性克隆中，從中隨機挑取145個克隆去測序，其中139個（89.2％）含有重復(fù)次數(shù)大于或等于7的克隆，序列比對后發(fā)現(xiàn)124個克隆為非同源性堿基序列；重復(fù)次數(shù)范圍為8-165次，平均為

6、52次。對124個微衛(wèi)星序列進(jìn)行劃分：其中perfect為80個（64.5％）；imperfect為40個（32.3％）；compound perfect為14個（3.2％），部分序列已經(jīng)在Genbank中進(jìn)行了注冊。
　　 4．黑斑原鮡微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選
　　 共設(shè)計了33對微衛(wèi)星引物，經(jīng)過PCR擴增，其中有29對對黑斑原鮡有擴增產(chǎn)物，從中篩選出具有多態(tài)性產(chǎn)物的25對引物。在黑斑原鮡一個群體36個樣本的25個微衛(wèi)星位點上

7、，等位基因的數(shù)目從2到10不等，平均每個位點為4.6個等位基因；觀測雜合度（Ho）范圍從0到1，平均為0.5481；多態(tài)信息含量（PIC）范圍為0.2846-0.8173，平均值為0.5793，表明這些標(biāo)記均適合黑斑原鮡進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析。
　　 5．黑斑原鮡微衛(wèi)星標(biāo)記通用性的檢測
　　 設(shè)計的33對微衛(wèi)星引物擴增黃斑褶鮡（與黑斑原鮡同科不同屬）一個群體的18尾樣品，其中有14對成功擴增，全部顯示多態(tài)，并且都能進(jìn)行多態(tài)分