刺參遺傳多樣性的微衛(wèi)星及RAPD分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究以煙臺、蓬萊、威海、大連4個地理種群及養(yǎng)殖和自然群體的仿刺參(又稱刺參)為研究對象,采用RAPD和SSR兩種分子標記對四個群體的遺傳結構進行了研究。分析了刺參養(yǎng)殖群體和自然群體之間的遺傳變異,以及四群體之間的遺傳分化。主要結果如下: 1.用經過篩選的9個微衛(wèi)星座位對刺參養(yǎng)殖群體和自然群體進行擴增,每個座位檢測到的等位基因數為4~12個。自然和養(yǎng)殖群體中,有效等位基因平均數分別為6.5556和5.8889,期望雜合度的平均值

2、分別為0.7641和0.6941,觀測雜合度的平均值分別為0.6416和0.5635。根據群體中各座位等位基因頻率計算出兩群體間的遺傳相似度為0.7970、遺傳距離為0.2269。對兩群體進行Hardy-Weinberg平衡檢驗發(fā)現,自然群體在位點Psj1828、Psj2022、Psj2642,養(yǎng)殖群體在位點Psj2022、Psj2031、Psj2409、Psj2642、Psj2889都出現了雜合子缺失現象,特別是養(yǎng)殖群體在位點Psj2

3、022,其Hardy-weinberg遺傳偏離指數達0.5164。結果表明,與自然群體相比,刺參養(yǎng)殖群體存在雜合度降低,遺傳多樣性下降的現象,這可能與人工養(yǎng)殖過程中,群體較小,引起近交機會增加有關。應制定相應的漁業(yè)生產和管理措施加以保護,以使刺參養(yǎng)殖持續(xù)健康發(fā)展。 2.運用微衛(wèi)星DNA技術對刺參煙臺群體、威海群體、大連群體的3個野生群進行了遺傳分析。對9個基因位點進行了PCR擴增,共獲得了59個等位基因。評估了9對微衛(wèi)星引物的多

4、態(tài)信息含量(PIC),范圍在0.5129-0.8794之間。結果表明:3個野生群體的平均雜合度觀測值分別為0.6416、0.6595、0.5824,平均雜合度期望值分別為0.7641、O.7161、0.7364;在Hardy-Weinberg平衡條件下,進行了P檢驗,發(fā)現3個群體均有位點發(fā)生了顯著偏離;對3個群體進行了配對Fst值計算,發(fā)現3個群體之間遺傳分化較弱。從變異貢獻率來看,95.68%的變異來自個體之間,4.32%的變異來自群

5、體之間。經過UPGMA聚類,發(fā)現威海群體和大連群體之間親緣關系較近,煙臺群體與前兩群體親緣關系較遠。 3.采用RAPD技術對煙臺(YT),蓬萊(PL),威海(WH),大連(DL)沿海天然以及養(yǎng)殖刺參的遺傳多樣性進行了研究。實驗用20條隨機引物用于四群體的遺傳多樣性分析。結果表明:四群體多態(tài)位點比例和平均遺傳雜合度分別為65.71%、57.57%、62.96%、65.51%和0.5833、0.5091、0.5546、0.5318

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