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![組蛋白甲基化位點結(jié)合結(jié)構(gòu)域的結(jié)構(gòu)與功能研究.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-2/24/12/9d963de2-0019-4182-b99f-2754c174c6ff/9d963de2-0019-4182-b99f-2754c174c6ff1.gif)
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文檔簡介
1、組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳調(diào)控的重要手段之一,一般發(fā)生在組蛋白柔性的N端尾巴上,包括甲基化、乙?;⒘姿峄头核鼗?。組蛋白的這些翻譯后修飾位點往往包含特定的生物學(xué)信息,被稱為“組蛋白密碼”?!敖M蛋白密碼”可以被一些含有特定結(jié)構(gòu)域的蛋白和蛋白復(fù)合物識別,啟動下游的生物學(xué)過程。過去幾十年來,人們通過生物化學(xué)及生物物理學(xué)等方法鑒定出許多可以特異性地結(jié)合組蛋白翻譯后修飾位點的結(jié)構(gòu)域。人們根據(jù)這些結(jié)構(gòu)域氨基酸序列的同源性以及與組蛋白翻譯后修飾
2、位點的結(jié)合方式,將它們分為Bromo結(jié)構(gòu)域、PHD結(jié)構(gòu)域、WD40repeat結(jié)構(gòu)域及Royal超家族結(jié)構(gòu)域等一些結(jié)構(gòu)域超家族。基于組蛋白翻譯后修飾的多樣性,這些結(jié)構(gòu)域涉及到細胞內(nèi)大部分生物學(xué)過程,而且目前發(fā)現(xiàn)許多疾病的發(fā)生與組蛋白翻譯后修飾位點結(jié)合結(jié)構(gòu)域的功能異常有關(guān)。相比較其他的翻譯后修飾方式,組蛋白的甲基化具有更為復(fù)雜的修飾模式和調(diào)控方式,其結(jié)合結(jié)構(gòu)域也相應(yīng)地更為多樣。本論文主要針對Royal超家族中特異性結(jié)合組蛋白甲基化賴氨酸的
3、結(jié)構(gòu)域展開一系列的結(jié)構(gòu)和功能的研究,論文分為三部分:
第一部分為釀酒酵母SAGA復(fù)合物Sgf29亞基的結(jié)構(gòu)與功能的研究。我們分別解析了Sgf29的C端tandemTudor結(jié)構(gòu)域的單體,及其與H3K4me2和H3K4me3多肽的復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)。Sgf29的tandemTudor結(jié)構(gòu)域的兩個Tudor結(jié)構(gòu)域均參與與H3K4me2/3的相互作用,兩個Tudor結(jié)構(gòu)域以“face-to-face”的方式排列,并各自含有一個帶負
4、電的結(jié)合口袋和芳香族口袋,分別與組蛋白H3A1和甲基化H3K4結(jié)合,這種新穎的結(jié)合方式使得Sgf29的tandemTudor結(jié)構(gòu)域具有更嚴格的底物選擇性。此外,我們的體內(nèi)和體外實驗指出Sgf29不直接影響SAGA復(fù)合物的乙酰轉(zhuǎn)移酶活性,而是通過其C端tandemTudor結(jié)構(gòu)域與甲基化H3K4的相互作用調(diào)控SAGA復(fù)合物在染色質(zhì)上的定位,從而影響組蛋白H3的乙酰化水平,進而調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄。
第二部分為人源異染色蛋白Cbx3
5、(HP1γ)的結(jié)構(gòu)和功能的研究。HP1蛋白N端Chromo結(jié)構(gòu)域一直以來被人們認為可以特異性識別甲基化組蛋白H3K9,調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄及DNA損傷修復(fù)等過程。我們分別解析了Cbx3Chromo結(jié)構(gòu)域與組蛋白H1K26me2多肽及其與組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶G9aK185me3多肽的復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu),測定了Cbx3Chromo結(jié)構(gòu)域與這兩種甲基化多肽的解離常數(shù),指出Cbx3可以通過結(jié)合甲基化的組蛋白和非組蛋白蛋白發(fā)揮調(diào)控基因表達的功能。
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