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![環(huán)形RNA hsa_circ_001988在結直腸癌中的表達及臨床意義.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/10/8/4056f45f-f503-4d6e-a39f-fdc5330a9114/4056f45f-f503-4d6e-a39f-fdc5330a91141.gif)
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文檔簡介
1、世界范圍內(nèi),結直腸癌(CRC)是癌癥相關疾病死亡的主要原因之一,是胃腸道常見的惡性腫瘤。2012年全世界約有140萬結直腸癌新發(fā)病例,居惡性腫瘤第3位,給人們的健康構成了極大的威脅。但結直腸癌現(xiàn)有診斷指標的診斷效能有限,所以尋找新的腫瘤標記物,同時探索潛在生物治療靶點有助于結直腸癌的診治。
隨著二代測序技術和生物信息學的發(fā)展,環(huán)形RNA重新走入人們的視野,它是一類新型的非線性RNA,由前體RNA兩側的5'末端和3'末端反向剪切
2、而成,構成閉合的環(huán)形。雖然環(huán)形RNA已經(jīng)報道數(shù)十年,但是過去一度認為是拼接的副產(chǎn)物,并未引起科學家的興趣?,F(xiàn)在越來越多的研究發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNA廣泛地存在于真核細胞中,參與細胞的多種生物學功能,同時環(huán)形RNA參與了多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展,其生物學作用也日益受到人們重視?;诖耍覀儗Νh(huán)形RNA在結直腸癌中的作用進行了初步探索。
目的:
1、通過二代測序和生物信息學的方法預測結直腸癌患者腫瘤組織與癌旁正常組織中差異性表達的環(huán)形R
3、NA,對部分差異明顯的環(huán)形RNA進行PCR實驗驗證。
2、對驗證的環(huán)形RNA進行實時熒光定量PCR檢測,比較腫瘤組織和癌旁組織中表達量是否存在差異。
3、結合患者的各種臨床信息進行單因素方差分析,探索目的環(huán)形RNA是否與臨床因素有關。
4、根據(jù)實時熒光定量PCR的數(shù)據(jù),對目的環(huán)形RNA構建ROC曲線,探索差異性表達的環(huán)形RNA是否具有成為潛在診斷指標的可能。
方法:
1、選取2對樣本(癌
4、和癌旁)進行二代測序分析,應用生物信息學的方法比對預測出在癌組織和癌旁正常組織中差異性表達的環(huán)形RNA。設計引物通過PCR進行驗證,應用實時熒光定量PCR的方法測定癌和癌旁組織的相對表達量。
2、將癌和癌旁的數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析,同時結合各種臨床信息,找出目的環(huán)形RNA可能相關的臨床因素。
結果:
1、通過二代測序以及數(shù)據(jù)分析篩出多條差異表達的環(huán)形RNA,其中甄選出環(huán)形RNA_hsa_circ_001988進行
5、實驗驗證,證明環(huán)形RNA hsa_circ_001988的存在。
2、通過實時熒光定量PCR,發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNA hsa_circ_001988在癌和癌旁組織中表達是有差異的:癌組織中的表達量低于癌旁組織。
3、對納入的31例患者的臨床信息進行統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNAhsa_circ_001988的表達量與腫瘤病理分化程度以及神經(jīng)侵犯相關。
4、構建ROC曲線(AUC=0.788,95%CI=0.68-0.90,
6、P<0.001)發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNAhsa_circ_001988在結直腸癌中具有一定的診斷價值。
結論:
1、證實了環(huán)形RNA hsa_circ_001988的存在。環(huán)形RNA hsa_circ_001988在結直腸癌和癌旁組織中表達是有差異的,在本研究中癌組織中的表達量低于癌旁組織。
2、環(huán)形RNA hsa_circ_001988可能參與腫瘤細胞的分化以及神經(jīng)侵犯的生物學行為。
3、環(huán)形RNA hs
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