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文檔簡介
1、蝗蟲是蝗總科Acridoidea昆蟲的統(tǒng)稱,蝗總科隸屬于昆蟲綱Insecta,直翅目Orthoptera,蝗亞目Caelifera。全世界記載蝗蟲12000余種,我國有1200余種?;认x不僅是重要的農牧業(yè)害蟲,有些種類也具有重要的經濟價值。許多學者基于不同的觀點從不同分類水平對蝗總科系統(tǒng)發(fā)育進行了探討,但其科級分類一直存在爭議。因此我們從分子水平上探討蝗總科的系統(tǒng)發(fā)育關系,以期為進一步完善蝗總科分類系統(tǒng)提供一些分子證據。
本研
2、究測定了10種蝗蟲的線粒體COⅠ、COⅡ和COⅢ基因全序列,利用MEGA5軟件對序列進行堿基組成和變異、密碼子和氨基酸使用頻率、堿基替換和替換飽和性分析。同時從GenBank下載蝗總科22種蝗蟲以及直翅目其它總科的5種外群的相關基因序列,使用MEGA和PAUP軟件分別構建基于以上三個基因聯(lián)合數據集的系統(tǒng)發(fā)育樹,對蝗總科科級階元的系統(tǒng)發(fā)育關系進行了分析。結論如下:
1、核酸序列堿基組成及變異:蝗總科昆蟲的COⅠ、COⅡ和COⅢ基
3、因序列中,COⅠ基因最為保守。3個基因保守性最高的是密碼子第2位,占全部保守位點的50%以上,變異率最高的是密碼子第3位。堿基組成具有明顯的A/T偏向性,A+T的平均含量為68.5%-70.6%,COⅠ基因的密碼子第3位點的A+T含量最高,達到86.2%。
2、堿基替換:COⅠ、COⅡ和COⅢ基因的堿基替換速率較高,3個基因全序列的轉換數與顛換數總體上基本相等,平均R值為1。部分位點轉換數大于顛換數,R大于1,也有的位點顛換數
4、大于轉換數,R小于1。但所有R值均遠大于提供系統(tǒng)發(fā)育信息的臨界值0.4。3個基因的轉換均有飽和的趨勢,而顛換均未達到飽和。
3、密碼子使用和氨基酸組成:COⅠ基因共使用503個密碼子,COⅡ基因共使用226個密碼子,COⅢ基因使用261個密碼子。通過比對37種直翅目昆蟲的COⅠ基因全序列,推斷COⅠ基因起始密碼子為ATGA、GTGA和ATGG等四聯(lián)起始密碼子。而COⅡ和COⅢ基因的起始密碼子為ATG,3基因的終止密碼子均以TA
5、A為主,也有TAG或單堿基T。3個基因在氨基酸組成上均有一定的偏向性,亮氨酸、異亮氨酸、絲氨酸等幾種氨基酸含量明顯偏高,而半胱氨酸、谷氨酸等含量明顯較低。
4、蝗總科系統(tǒng)發(fā)育分析:通過NJ法和MP法,重建了蝗總科8科32種蝗蟲的系統(tǒng)發(fā)育關系。結果顯示,外群最先從樹的根部分出,蝗總科為單系群,在蝗總科內只有斑翅蝗科、瘤錐蝗科、錐頭蝗科和癩蝗科為單系群,斑腿蝗科、槌角蝗科、網翅蝗科和劍角蝗科均非單系群。斑翅蝗科為最進化的類群;網翅
6、蝗科和槌角蝗科親緣關系較近,與劍角蝗科一起構成蝗總科中較進化的類群;斑腿蝗科昆蟲雖然沒有聚為一支,但較集中的分布在蝗總科單系群的中部;癩蝗科是較原始的類群;錐頭蝗科和瘤錐蝗科親緣關系較近,為蝗總科最原始的類群。對系統(tǒng)樹綜合分析,推斷蝗總科8科之間的系統(tǒng)發(fā)育關系如下:(錐頭蝗科+瘤錐蝗科)→癩蝗科→斑腿蝗科→(網翅蝗科+槌角蝗科)→劍角蝗科→斑翅蝗科。
5、本研究基于COⅠ、COⅡ和COⅢ基因序列的堿基替換分析、替換飽和性分析以
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