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![葉甲科部分種類線粒體COⅡ基因分子系統(tǒng)學研究(鞘翅目:葉甲總科).pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-2/24/12/aa078eeb-8c82-4737-93dd-8f28c855e2cf/aa078eeb-8c82-4737-93dd-8f28c855e2cf1.gif)
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文檔簡介
1、葉甲科(Chrysomelidae)昆蟲屬于鞘翅目(Coleoptera)葉甲總科(Chrysomeloidea)。其主要特征為:成蟲一般體長1.0mm~17.0mm。體形為長圓、卵圓或長方形。體色多樣,有的具有較強金屬光澤或具條帶、花斑。本科中的許多種類是農林、蔬菜、牧草的重要害蟲,危害植物的葉、莖及根部。葉甲作為農牧業(yè)重要的害蟲一直受到生物學家們的重視。生物學工作者長期以來為了尋求葉甲防治方法,一直進行著有關葉甲生物學的基礎研究,包
2、括系統(tǒng)學研究。在分類系統(tǒng)上,最初是集中在形態(tài)學方面,隨著科學技術的發(fā)展,各種研究也日趨廣泛和深入。上世紀末,研究者開始進行一些亞顯微結構及分子方面的研究。近年來,昆蟲系統(tǒng)演化的熱點已轉入分子水平。線粒體基因組由于其特有的遺傳學特點,成為研究真核生物分子遺傳學、發(fā)育生物學和分子系統(tǒng)進化的一種重要的模式體系。線粒體細胞色素C氧化酶亞基Ⅱ基因由于其分布的普遍性、序列和結構的相對保守性而被廣泛應用于不同分類階元層次上的分子系統(tǒng)學研究。本研究采用
3、PCR產物直接測序法測定了葉甲科3個亞科11屬15種昆蟲COⅡ基因,并從NCBI下載了七種相關葉甲昆蟲的540bpCOⅡ基因片段,利用負泥蟲Criocerisduodecimpunctata的COⅡ基因序列作為外群序列。利用ClustalⅩ進行序列比對,MEGA3.1進行序列組成統(tǒng)計。并以NJ、MP和貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育推論法分別重建系統(tǒng)發(fā)生樹。得出結論如下: 1、對22種葉甲線粒體COⅡ基因序列進行分析,COⅡ基因序列A、T、C、G
4、平均含量分別為35%、38.3%、16.1%、10.6%,A+T含量為73.3%。堿基轉換替換呈現T←→C偏向性;顛換的發(fā)生主要以T←→A為主,且大都發(fā)生在密碼子第三位。按葉甲科22種昆蟲COⅡ基因540bp序列共編碼180個氨基酸,氨基酸組成中,22種昆蟲均不含半胱氨酸(Cys),由19種氨基酸組成,其中亮氨酸(Leu),亮異氨酸(Lle)含量最高,反映出COⅡ基因在氨基酸組成上由一定的偏向性。 2、葉甲線粒體COⅡ基因中核苷
5、酸的替代轉換與顛換值之比R為0.8;轉換和顛換與遺傳距離呈線性關系;說明轉換和顛換尚未達到飽和。R值表現了昆蟲線粒體DNA的典型的距離依賴性。說明兩者均顯示該數據組包含較強的系統(tǒng)發(fā)育信號。 3、基于COⅡ基因序列利用MEGA3.1、PHYLIP3.6a、MrBayesV3.0等軟件,采用鄰接法(NJ)、最大簡約法(MP)和貝葉斯推論法(Bayesianinference)進行系統(tǒng)發(fā)育樹的重建,各樹的一致性和統(tǒng)計學支持較好,同一屬
6、內的種間以很高的置信度優(yōu)先聚為一枝,亞科內的不同屬間基本表現為單系性,且枝間分歧小于枝內分歧。 4、跳甲亞科較螢葉甲亞科與葉甲亞科關系更為近緣。這一結論與前人在形態(tài)學、支序系統(tǒng)學、及細胞分類學的結論相矛盾。所有的系統(tǒng)樹均顯示圓肩葉甲屬與螢葉甲亞科有較近的親緣關系,這與傳統(tǒng)分類學結果相背離。筆者認為此屬的分類地位有待于進一步討論。 5、4種葉甲屬種類顯示出了較好的單系性。楊葉甲為該類群中進化速度最快的種類,其次為白楊葉甲,
7、再其次為柳二十斑葉甲,進化速率最慢、最原始的種類為柳十八斑葉甲。 6、基于蛋白質序列利用最大簡約法所建系統(tǒng)樹時,發(fā)現有些屬(守瓜屬、金葉甲屬)的氨基酸序列與核苷酸序列進化并不同步。 7、運用COⅡ基因的核苷酸序列對葉甲科昆蟲進行系統(tǒng)研究時,各屬種間的分類關系都比較明確,得到的樹的拓撲結構大都一致。因此,COⅡ基因在對葉甲科科下亞科以及種屬階元的分類與進化關系研究中,是一個有效的分子標記。 本研究對葉甲科15種昆蟲
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