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文檔簡介
1、奧鍬甲屬(Odontolabis Hope)隸屬于鞘翅目(Coleoptera)鍬甲科(Lucanidae)奧鍬甲族(Odontolabini)。該屬目前已知約50種(包含亞種),均分布于東洋界。該屬鍬甲不僅具有外部形態(tài)差異顯著的雌雄二型、雄性多型,且存在不同的色斑型,特別是雄性上顎特征常截然不同。這些因性二型、雄性顎型變化及不同色斑型所導致的同種內的表型差異,給基于經典形態(tài)的物種鑒定和分類帶來諸多困擾。且屬內不同種間的雌性外部形態(tài)、雌
2、雄外生殖器的解剖特征也很相似,進一步加劇了該屬分類研究的混亂局面,多個疑難種團的物種界定有待解決。目前還缺少利用分子系統(tǒng)學研究相關的方法和技術來探索該屬的分類學問題。
本研究選取了三個線粒體基因(COI、16S rDNA和Cytb)以及兩個核基因(Wingless、CAD)為目的基因,通過多基因聯(lián)合標記,利用RAxML云端網站或者raxmlGUI1.5b1本地軟件、MrBayes等軟件,采用最大似然法、貝葉斯法等方法重建了東洋
3、界奧鍬甲屬18個代表種的系統(tǒng)發(fā)育關系;同時也對中華奧鍬甲種團不同地理種群的62個個體(Odontolabis sinensis complex包括鞘翅窄圓紅斑的中華奧鍬甲O.sinensis、鞘翅寬三角形黃斑的華美奧鍬甲O.fallaciosa及鞘翅具有二者間過渡斑型的個體)進行了系統(tǒng)發(fā)育關系分析;并利用ABGD、GMYC以及PTP方法對中華奧鍬甲種團進行了物種界定分析。為了解該屬線粒體基因的進化,本研究也對該屬代表種的線粒體全基因組進
4、行高通量測序及分析。主要研究結果如下:
(1)共獲得基因序列480條,其中:COI序列112條、16S rDNA序列79條、Cytb序列68條、Wingless序列118條、CAD序列103條。
(2)奧鍬甲屬的系統(tǒng)發(fā)育重建顯示:奧鍬甲屬Odontolabis和新鍬甲屬Neolucanus呈姐妹群關系,支持了前期的相關研究結論;二者是奧鍬甲族的重要成員;奧鍬甲屬是一個單系,其代表種的拓撲結構反映了它們的遺傳分化與其地
5、理分布的關系密切,即分布于東南亞各個島嶼的部分代表種形成了獨立的“島嶼支系”,而跨“大陸-島嶼”間斷分布的部分代表種則聚成了一支。少數樣本未能獲得有效的16S rDNA、CAD基因序列,進行系統(tǒng)發(fā)育分析時它們的拓撲結構位置都表現(xiàn)不理想。這可能是由于這兩個基因序列都較長、缺失了較多遺傳信息所致。
(3)中華奧鍬甲種團的系統(tǒng)發(fā)育關系及物種界定:系統(tǒng)發(fā)育分析表明在種團內部分成了三支:華東南的一支(含O.sinensis、O.fall
6、aciosa及二者間過渡斑型個體,含來自安徽、廣西、廣東、貴州雷公山、浙江、湖南、四川、福建的個體);而西藏的種群(鑒定為O.fallaciosa tf1)聚為一支;滇西南的種群(鑒定為O.fallaciosa tf2)也始終聚為一支。通過ABGD、GMYC以及PTP方法進行物種界定,均與系統(tǒng)發(fā)育分析具有一致性,沒有過分現(xiàn)象。華東南的一支界定為同一個種,其地理種群間的遺傳距離是0.001~0.027,也進一步支持了這些鞘翅色斑不同的個體
7、均為一個種,即它們都是O.sinensis的不同色斑型。而西藏、滇西南的種群因樣本量較少,初步考慮與分布在印度的O.cuvera關系密切。
(4)通過高通量測序技術,首次獲得了華美奧鍬甲O.fallaciosa的線粒體全基因組序列,并向GenBank提交了數據。其線粒體全基因組的結構組成和密碼子使用情況均符合典型昆蟲的線粒體結構特點,其是一個封閉的雙鏈圓環(huán)結構,由13個蛋白質編碼基因(cox1-3,ND1-6,ATP6、ATP
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