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文檔簡介
1、核酸適體(aptamer)是指從人工構(gòu)建的隨機單鏈序列中篩選出的能與蛋白質(zhì)、其他小分子物質(zhì)、有機離子等等各種配體特異結(jié)合的寡核苷酸片段。它是經(jīng)體外指數(shù)富集配體系統(tǒng)進化技術(systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)篩選出來的一系列單鏈寡核苷酸分子,一般由20~80個堿基組成,對可結(jié)合的配體有嚴格的識別能力和高度的親和力。
目前篩選核酸適體
2、的SELEX技術是分子進化工程技術的一種。核酸分子的一級結(jié)構(gòu)上存在著大量不同順序的寡核苷酸的排列組合。我們可以利用人工化學合成技術把設計好的一定長度的不同排列組合的寡核苷酸都合成出來,構(gòu)建成一個包含了這一長度寡核苷酸分子所有可能的突變的寡核苷酸文庫,這樣就可以在實驗條件中模擬大自然的進化,有目的地施加選擇壓力,篩選出符合特定要求的寡核苷酸分子。
采用SELEX方法篩選適體的關鍵問題是將與靶標結(jié)合的ssDNA與未結(jié)合的游離s
3、sDNA分離。本研究的主要探討適體篩選過程中的篩選方法和分離問題。全文分為3部分分別探討了3種篩選適體的方法和相關的分離方法:
一、膠體金為分離介質(zhì)的SELEX技術篩選適體:以豬瘟病毒單克隆抗體和促絨毛膜性腺激素(HCG)單克隆抗體為靶標進行適體的篩選,通過12輪篩選,經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠(PAGE)電泳發(fā)現(xiàn)目的寡核苷酸條帶丟失。用超濾離心管作為分離介質(zhì),繼續(xù)對HCG單克隆抗體進行適體篩選,經(jīng)PAGE膠電泳發(fā)現(xiàn)在第五輪篩選中的
4、第10次洗液中仍然有核酸條帶。
二、硝酸纖維膜(NC)為分離介質(zhì)的雙鏈DNA文庫法:以固定在NC膜上的HCG單克隆抗體為靶標,以隨機雙鏈DNA文庫為出發(fā)庫進行核酸適體篩選,經(jīng)1輪篩選,PAGE電泳有目的寡核苷酸條帶,但在對照用的空膜中也出現(xiàn)相同的寡核苷酸條帶。
三、變性-復性法:以硝酸纖維膜(NC)和PDFV膜為分離介質(zhì),以蛋白酶K為靶標,以硫醇探針作為跟蹤檢測,通過1輪篩選,在PAGE膠電泳中有目的核酸條帶
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