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![LncRNA-MALAT1與Hsa-miR-1互作機(jī)制對大腸癌放射敏感性的影響研究.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/10/8/345c4236-9da7-49c2-8476-2817f0a6a40d/345c4236-9da7-49c2-8476-2817f0a6a40d1.gif)
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文檔簡介
1、目的:
1.篩選鑒定大腸癌放射敏感性相關(guān)LncRNA及其靶向作用microRNA。
2.初步闡明LncRNA-MALAT1與hsa-miR-1對大腸癌細(xì)胞放射敏感性的影響機(jī)制。
3.探討LncRNA-MALAT1與hsa-miR-1相互作用機(jī)制。
方法:
1.通過對7株大腸癌細(xì)胞進(jìn)行克隆形成實驗,挑選出放射抵抗與放射敏感細(xì)胞株,采用二代測序法篩選放射誘導(dǎo)過程中差異表達(dá)的LncRNA。對差
2、異表達(dá)的LncRNA進(jìn)行生物信息學(xué)分析。
2.使用實時定量 PCR技術(shù)分別檢測大腸癌細(xì)胞和大腸癌組織標(biāo)本中LncRNA-MALAT1及hsa-miR-1的表達(dá)量。
3.利用轉(zhuǎn)染技術(shù)分別下調(diào)和上調(diào)大腸癌細(xì)胞中LncRNA-MALAT1和hsa-miR-1表達(dá)并聯(lián)合照射處理后,通過MTT、生長克隆、劃痕、凋亡及Western Blot實驗分別檢測細(xì)胞活力、增殖能力、遷移能力、細(xì)胞凋亡率以及MMP-2、MMP-9、E鈣粘蛋
3、白、Bax和 Bcl-2蛋白表達(dá)。
4.通過生物信息學(xué)分析,找出LncRNA-MALAT1上hsa-miR-1結(jié)合位點,構(gòu)建包含此位點的熒光素酶報告基因,通過檢測熒光素酶報告基因的活力來驗證兩者的靶向結(jié)合能力,分別調(diào)控細(xì)胞中LncRNA-MALAT1和hsa-miR-1表達(dá)量,進(jìn)一步驗證兩者之間的相互調(diào)控作用。
結(jié)果:
1.通過克隆形成實驗,我們在7株大腸癌細(xì)胞中篩選出放射敏感性差異最大的兩株細(xì)胞株,即放射
4、抵抗的CCL244細(xì)胞和放射敏感的HCT116細(xì)胞。
2.二代測序結(jié)果顯示,照射前后兩株細(xì)胞間均差異表達(dá)的lncRNA有24條(2倍差異以上),通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),其中 LncRNA-MALAT1有極強(qiáng)的microRNA結(jié)合能力,hsa-miR-1為其靶向microRNA。
3.隨著照射劑量增加,照射后時間延長,CCL244細(xì)胞中LncRNA-MALAT1表達(dá)量升高,hsa-miR-1表達(dá)量減少,并呈照射劑量依賴
5、性和時間依賴性。
4.與癌旁正常大腸組織相比,大腸癌組織中LncRNA-MALAT1表達(dá)量升高(P<0.05),hsa-miR-1表達(dá)量降低(P<0.001)。
5. LncRNA-MALAT1下調(diào)聯(lián)合照射處理組及hsa-miR-1上調(diào)聯(lián)合照射處理組與單純照射處理組相比細(xì)胞活力、細(xì)胞增殖及遷移能力均明顯受到抑制,MMP-2、MMP-9及Bcl-2表達(dá)均降低,E鈣粘蛋白、Bax表達(dá)及細(xì)胞凋亡率均升高。
6.熒
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