高原鼠兔地理種群的遺傳多樣性與遺傳分化.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、高原鼠兔(Ochotonacurzoniae)是青藏高原特有的一種植食性小哺乳動(dòng)物,在青藏高原高寒草甸生態(tài)系統(tǒng)的食物鏈中起著重要作用,同時(shí)也是該地區(qū)危害最為嚴(yán)重的優(yōu)勢(shì)物種之一。本研究采用其近緣物種—北美鼠兔(Ochotonaprinceps)的七個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)分析六個(gè)高原鼠兔地理種群的遺傳多樣性與遺傳分化,探討地理距離、海拔和道路等因素對(duì)其遺傳變異和形態(tài)變異的影響。主要研究結(jié)果如下:六個(gè)高原鼠兔地理種群的體重、體長、耳長和后足長在種群間的

2、差異達(dá)到極顯著水平(p<0.01);就各個(gè)種群來看,海晏HY種群(Haiyanpopulation)與其余五個(gè)種群間的所有性狀均有極顯著差異(p<0.01);西大灘AE種群(XidatanAEpopulation)與西大灘AW種群(XidatanAWpopulation)間,西大灘BE(XidatanBE)和西大灘BW種群(XidatanBWpopulation)間的所有性狀均無顯著差異(p>0.05);昆侖KL種群(Kunlunpop

3、ulation)與西大灘BW種群間的體長、耳長和后足長性狀無顯著差異(p>0.05),與西大灘BE種群間的體長和耳長性狀無顯著差異(p>0.05),而與其余種群間的所有性狀均有差異。各形態(tài)性狀變異系數(shù)(CV)大小依次為體重>耳長>體長>后足長;各種群形態(tài)變異系數(shù)大小依次為海晏HY種群>昆侖KL種群>西大灘AE種群>西大灘AW種群>西大灘BE種群>西大灘BW種群。 高原鼠兔遺傳多樣性分析結(jié)果顯示,七個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增出的等位基因(N

4、a)為2.00~27.00個(gè),有效等位基因(Ne)為1.70~16.34個(gè)。多態(tài)信息含量(PIC)為0.3107(位點(diǎn)OCP1)~0.7958(位點(diǎn)OCP7),有兩個(gè)高度多態(tài)位點(diǎn)(位點(diǎn)OCP7、OCP8),其余為中度多態(tài)位點(diǎn);各位點(diǎn)的觀測(cè)雜合度(Ho)和期望雜合度(He)分別為0.3314~0.9645和0.4130~0.9416;Ho平均值為0.5943,He平均值為0.5712,說明高原鼠兔的遺傳多樣性處于中等水平。固定系數(shù)(F)平

5、均值為-0.0369,其中有三個(gè)位點(diǎn)(OCP1、OCP2、OCP3)的固定系數(shù)大于0,其余四個(gè)位點(diǎn)(OCP4、OCP7、OCP8、OCP9)的固定系數(shù)小于0,說明高原鼠兔自然種群中雜合子個(gè)體偏多。各位點(diǎn)的基因分化系數(shù)(Fst)分布范圍為0.0526~0.1829之間,平均為0.1001,即有約10.01%的變異存在于種群間,而89.99%的變異存在于種群內(nèi)部,說明高原鼠兔的遺傳變異主要在種群內(nèi)部產(chǎn)生。分別對(duì)七個(gè)位點(diǎn)和四個(gè)種群的Hardy

6、-Weinberg平衡檢驗(yàn)表明,位點(diǎn)OCP4、OCP7和OCP9表現(xiàn)出極顯著的不平衡(p<0.01),其余位點(diǎn)均呈遺傳平衡;西大灘AE、西大灘AW、西大灘BE和西大灘BW四個(gè)種群顯著偏離平衡(p<0.05),海晏HY和昆侖KL種群呈遺傳平衡。 對(duì)六個(gè)高原鼠兔地理種群的遺傳多樣性與遺傳分化的研究表明,海晏HY種群的多態(tài)信息含量和期望雜合度均最高,昆侖KL種群的多態(tài)信息含量、期望雜合度及觀測(cè)雜合度均最低,但非參數(shù)檢驗(yàn)結(jié)果顯示,六個(gè)種

7、群之間的遺傳多樣性水平并無顯著差異(p>0.05)。同時(shí),形態(tài)特征變異系數(shù)與遺傳多樣性參數(shù)之間無顯著相關(guān)性(p>0.05)。海晏HY種群與其余五個(gè)種群的基因分化系數(shù)(Fst)為0.0927~0.1232,平均為0.1023;基因流(Nm)為1.7792~2.4459,平均為2.2197,均達(dá)到了中度分化水平;另五個(gè)種群之間基因分化系數(shù)為0.0214~0.0587,平均為0.0403;基因流為4.0085~11.4058,平均為6.542

8、3,幾乎沒有分化。遺傳距離(GD)及UPGMA聚類分析的結(jié)果與遺傳分化系數(shù)基本一致,海晏種群與其余五個(gè)種群遺傳距離平均為0.3025,而其余五個(gè)種群間遺傳距離平均為0.0889。聚類分析的結(jié)果是六個(gè)種群分為兩大支,西大灘BW種群首先與昆侖KL種群聚類,隨后依次與西大灘AW、西大灘BE、西大灘AE種群聚類,而海晏HY種群獨(dú)自為一類。MantelTest結(jié)果顯示,地理距離與遺傳距離及基因分化系數(shù)顯著相關(guān)。 分析海拔與種群遺傳多樣性及

9、遺傳變異的關(guān)系,結(jié)果表明,海拔最低的海晏HY種群的多態(tài)信息含量和期望雜合度都是最高的,而海拔最高的昆侖KL種群的多態(tài)信息含量、期望雜合度及觀測(cè)雜合度都是最低的,西大灘AW和西大灘BW種群各項(xiàng)參數(shù)相差不大。非參數(shù)樣本分析結(jié)果顯示,四個(gè)種群的遺傳多樣性參數(shù)無顯著差異(p>0.05),說明海拔與遺傳多樣性之間沒有顯著的相關(guān)性,遺傳多樣性參數(shù)和形態(tài)變異系數(shù)之間也無顯著相關(guān)性(p>0.05)。 分析青藏公路對(duì)高原鼠兔種群遺傳多樣性與遺傳變

10、異的影響,結(jié)果表明,公路西側(cè)種群的遺傳多樣性參數(shù)高于公路東側(cè)種群,但非參數(shù)樣本檢驗(yàn)結(jié)果顯示,四個(gè)種群的遺傳多樣性參數(shù)間無顯著差異(p>0.05)。同時(shí),遺傳多樣性參數(shù)與形態(tài)變異系數(shù)間無顯著相關(guān)性(p>0.05)。公路同側(cè)種群間平均遺傳距離為0.0808,基因分化系數(shù)為0.0357,基因流為7.2170;異側(cè)種群間遺傳距離為0.1037,遺傳分化系數(shù)為0.0443,基因流為5.4235。聚類結(jié)果也是公路東側(cè)和西側(cè)的種群分別聚為一類。說明青

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