珙桐種群遺傳多樣性與分子譜系地理學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、珙桐(Davidia involucrate Baill)系我國特有的單型屬植物,是第三紀(jì)古熱帶植物區(qū)系孑遺種,被列為國家一級保護(hù)植物,為世界著名的觀賞木本植物,在植物系統(tǒng)發(fā)育和地史變遷上具有很高的研究價(jià)值。本研究采用ISSR(Inter Simple Sequence Repeat)分子標(biāo)記和葉綠體DNA非編碼序列標(biāo)記研究珙桐天然分布區(qū)11個(gè)種群的遺傳多樣性和分子譜系地理學(xué),旨在探討珙桐遺傳多樣性水平及空間分布格局和地史變遷信息,為珙

2、桐遺傳資源保護(hù)策略的制定提供種群遺傳學(xué)基本信息。主要研究結(jié)果如下:
   (1)通過單因素試驗(yàn)和正交試驗(yàn),確定優(yōu)化的ISSR-PCR反應(yīng)體系為:25μL反應(yīng)體系,Mg2+1.8mM,DNA60ng,dNTP0.40mM,引物0.52μM,Taq酶1.25U。反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性4min,94℃變性45s,48℃~58℃退火45s,72℃延伸90s,36個(gè)循環(huán);72℃總延伸7min;4℃保存。
   (2)利用ISSR

3、分子標(biāo)記對11個(gè)天然珙桐種群240個(gè)植株進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果為:利用優(yōu)化的ISSR-PCR反應(yīng)體系和程序,從100條引物中篩選出5條能擴(kuò)增出穩(wěn)定、清晰和多態(tài)性譜帶的引物(UBC829、UBC841、UBC846、UBC848、UBC864),共擴(kuò)增出77個(gè)譜帶,74個(gè)為多態(tài)性譜帶,多態(tài)性譜帶百分率(PPB)為96.10%;各種群PPB值為37.66%~63.64%,平均為54.07%。種內(nèi)Shannon多樣性指數(shù)(HSP)為0.48

4、49,種群內(nèi)Shannon多樣性指數(shù)(HPOP)為0.1886~0.3274,平均為0.2774。這表明,珙桐物種、種群均維持較高的遺傳多樣性。分子方差(AMOVA)分析顯示,種群間與種群內(nèi)遺傳變異分別占總遺傳變異的46.22%、53.78%,種群間呈高度遺傳分化(φst=0.4170)。種群問遺傳距離(φst)與對應(yīng)的地理距離呈正相關(guān)(r=0.546,P=1.619e-05)。UPGMA(unweighted pair-group m

5、ethod with arithmetic-means)法聚類分析將11個(gè)珙桐種群分為三組,即湖南桑植、湖南永順、湖北興山、湖北長陽為一組,湖北神農(nóng)架和貴州梵凈山、松桃為一組,四川峨眉山、四川雅安和貴州織金縣為一組。
   (3)通過試驗(yàn),確定優(yōu)化的cpDNA非編碼序列PCR擴(kuò)增體系和程序?yàn)椋?5μL反應(yīng)體系,50ng DNA,10 Taq Buffer(Mg2+free),2.5mM MgCl2,0.4mM dNTPs,0.2

6、μM primer1,0.2μM primer2,1.25U Pfu DNA Polymerase。PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5min,94℃變性1min,退火45s,退火溫度和72℃延伸時(shí)間依不同的引物和產(chǎn)物而不同,共35個(gè)循環(huán),72℃總延伸7min,最后4℃保存?zhèn)溆谩?br>   (4)利用cpDNA非編碼序列標(biāo)記對11個(gè)天然種群的240個(gè)植株進(jìn)行譜系地理學(xué)分析,結(jié)果為:利用優(yōu)化的cpDNA-PCR反應(yīng)體系和程序從9對引物中篩

7、選出3對引物(trnSGCU和trnGUUC、rps16-F和rps16-R、atpB-49和rbcL-188),珙桐測序序列比對結(jié)果顯示,11個(gè)天然珙桐種群共形成2種單倍型,具有兩個(gè)變異位點(diǎn),2種單倍型將11個(gè)珙桐種群分為2支,具有明顯的地理位置特征。一支包括四川峨眉山、四川雅安、貴州織金縣,地處中國的西南部;另一支包括湖南永順、桑植、石門3個(gè)種群,湖北神農(nóng)架、興山、長陽3個(gè)種群,貴州梵凈山、松桃2個(gè)種群,共8個(gè)種群,地處中國的中南部

8、。此種系統(tǒng)分析結(jié)果與珙桐ISSR的UPGMA法聚類分析結(jié)果大體吻合。以上信息揭示11個(gè)天然珙桐種群可能起源于兩種避難所種群,具有相同單倍型的珙桐種群起源于同一個(gè)避難所,起源過程中起主要作用的是奠基者效應(yīng)(founder effect)。第四冰期后,各避難所的種群迅速擴(kuò)大,形成現(xiàn)在的單一單倍型的珙桐種群。
   (5)基于珙桐ISSR分子標(biāo)記分析和cpDNA非編碼序列標(biāo)記分析,本研究提出的珙桐資源保護(hù)策略為:盡可能地保護(hù)珙桐所有的

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