實時定量PCR檢測血中腸道菌DNA及快速藥敏試驗的方法研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究的目的是建立利用實時定量PCR(RQ-PCR)檢測血標本中腸道菌DNA的方法并對臨床標本進行初步檢測,并建立RQ-PCR快速檢測腸道菌在LB液體培養(yǎng)基和健康人全血中對抗生素敏感性的方法,以期能初步了解外科發(fā)熱患者中腸道菌菌血癥的現(xiàn)狀,并建立快速藥敏方法以便有利于指導治療。 在論文第一部分中,選擇脆弱擬桿菌谷氨酰胺合成酶基因作為靶基因設計引物和TaqMan探針,建立20μl的RQ-PCR反應體系,采用含靶基因特異性擴增片段

2、的重組質(zhì)粒建立標準曲線,并采用High Pure PCR Template Preparation Kit提取基因組DNA,建立實時定量PCR.檢測血標本中脆弱擬菌DNA的方法學,并對32份外科發(fā)熱患者的標本進行了臨床驗證。結(jié)果顯示引物和探針特異性好,檢測靈敏度為10<'0>拷貝/μl(10<'3>CFU/ml),標準曲線相關(guān)系數(shù)在0.985~0.999之間。不同濃度的脆弱擬桿菌樣本檢測的平均準確性為(107.30±2.11)%;批內(nèi)及

3、批間重復性平均變異系數(shù)(CV)分別為(18.44±1.16)%和(19.00±4.47)%。血標本中脆弱擬桿菌DNA平均提取效率為(60.13±5.66)%,提取效率平均變異系數(shù)為(15.62±2.47)%。含有同等量脆弱擬桿菌的臨床血標本存放在-20℃或-70℃ 6個月內(nèi),脆弱擬桿菌DNA拷貝數(shù)差異無顯著性(P=0.467~0.840),該方法可用于臨床標本的脆弱擬桿菌DNA檢測,并具有快速、靈敏、特異、重復性好的優(yōu)點。 論

4、文第二部分,采用此方法學對32例外科發(fā)熱患者的84份血標本進行了實時定量PCR檢測。結(jié)果顯示10個標本檢測到脆弱擬桿菌,陽性率約為11.90%,含量約1.78~9.24×10<'3>CFU/ml,所有患者的血培養(yǎng)結(jié)果均為脆弱擬桿菌陰性。 論文第三部分,在含有相同濃度大腸桿菌的LB液體培養(yǎng)基和血中,分組加入不同的抗生素,并設立生長對照,分別培養(yǎng)1、2、3、4小時后提取標本的基因組DNA,以本研究組先前建立的實時定量PCR檢測大腸

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