G-四鏈體的穩(wěn)定性、構型競爭及在端粒酶活性檢測中的研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩76頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、G-四鏈體是由富含鳥嘌呤堿基G的DNA或RNA序列形成的一種特殊的核酸二級結構,有望形成G-四鏈體的基因序列廣泛存在于人類基因組的許多重要區(qū)域。近年來,圍繞G-四鏈體,人們開展了大量的研究工作,包括 G-四鏈體DNA酶的研究、G-四鏈體的構型研究及G-四鏈體特異性配體的研究等。圍繞G-四鏈體,本文開展了如下三方面的工作:基于G-四鏈體-hemin DNA酶的端粒酶活性檢測;分子擁擠條件下pH對單個DNA鏈中G-四鏈體與二倍體結構競爭的影

2、響研究;用于G-四鏈體熔點檢測的染料篩選實驗。
  本研究主要內容包括:⑴端粒酶是一種核糖核蛋白酶,能延伸人類染色體端粒重復序列(5′-GGGTTA-3′)。由于其與癌細胞的無限增殖密切相關,所以成為抗癌藥物設計的新靶點。直到目前端粒酶活性檢測方法的研究仍然是一個熱點。設計了一種簡單高效、不需要聚合酶鏈式反應(PCR-free)的端粒酶活性檢測方法。這種方法基于端粒酶誘導G-四鏈體-氯化血紅素(hemin)DNA酶的形成。實驗中使

3、用了一種短的、無標記的端粒酶引物。由于這個引物只包含3個連續(xù)GGG重復序列,所以不能形成穩(wěn)定的G-四鏈體。在活性端粒酶和G堿基(dGTP)的存在下,一個連續(xù)GGG重復序列可以被加到引物鏈的3′-端。被延伸的引物可以折疊成G-四鏈體,G-四鏈體可以與hemin結合成具有高效催化活性的G-四鏈體-hemin DNA酶,這種酶可以催化過氧化氫(H2O2)氧化2,2-聯(lián)氮-二(3-乙基-苯并噻唑-6-磺酸)二銨鹽(ABTS)生成綠色的 ABTS

4、·+。由于引物延伸反應生成的產物很短,端粒酶表現(xiàn)出高的周轉率,因此提高了方法的靈敏度。用這種方法能夠檢測到來自200個HeLa細胞的端粒酶活性。⑵人類基因組中存在著大量有望形成G-四鏈體的富G基因序列。但除染色體末端的單鏈端粒區(qū)域外,絕大多數(shù)富 G序列都是與其互補序列共同存在的。這就意味著這些區(qū)域內可能存在有 G-四鏈體與二倍體結構的競爭作用??紤]到基因組中二倍體結構的形成過程更接近于一個分子內的過程,且細胞內處于一個非常擁擠的環(huán)境,我

5、們將富G序列及與其互補的富C序列連接成一條DNA鏈,以40%(v/v)的聚乙二醇200(PEG200)來模擬細胞內的擁擠環(huán)境,用熒光光譜、圓二色(CD)光譜及聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)的方法,對稀釋和分子擁擠條件下,pH值對G-四鏈體與二倍體的競爭作用進行了比較研究。研究結果表明,在稀釋條件下,富G序列主要被包埋在二倍體結構當中,且pH值的變化(5.8~8.0)不會對DNA的結構造成影響。而在分子擁擠條件下,酸性環(huán)境有利于二倍體結構

6、的形成;pH值的增大促使二倍體結構向G-四鏈體結構轉化,轉化過程主要發(fā)生在pH值6.7~7.4之間。這一研究結果可以為探討某些基因序列的生理功能、闡明一些疾病的發(fā)病機理及以這些富G序列為靶進行相關藥物的研制提供必要的信息。⑶G-四鏈體的熔點(Tm)可以用來衡量G-四鏈體的熱穩(wěn)定性。很多關于G-四鏈體的研究中都會涉及到G-四鏈體熔點的測定。發(fā)展一種適合高通量測定的、免標記的G-四鏈體熔點測定方法對于大批量研究G-四鏈體具有重要的意義。某些

7、染料的熒光對G-四鏈體結構有高度的依賴性。它們自身沒有熒光或者熒光很弱,但是與G-四鏈體結合后熒光會增強。因此,我們希望找到可以用于檢測G-四鏈體熔點的熒光染料。實驗通過對熒光染料進行篩選,篩選出了SYBR Green I這種熒光染料。并將其應用于G-四鏈體的熔點測定。通過將測定結果與紫外光譜、CD光譜、分子信標熒光探針測得的結果進行比較,發(fā)現(xiàn)在高濃度鉀離子中能得到滿意的結果;在各個濃度的鈉離子中,測得的結果與紫外和CD的結果相差一個定

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論