驅(qū)動(dòng)蛋白及其電荷分布的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、細(xì)胞內(nèi)部的上百種分子馬達(dá)在肌肉收縮、細(xì)胞內(nèi)部輸運(yùn)、遺傳物質(zhì)(DNA)的復(fù)制、以及細(xì)胞的有絲分裂過程中執(zhí)行著各種各樣的生物功能.這些分子馬達(dá)可以高效率地將儲(chǔ)存在ATP分子中的化學(xué)能轉(zhuǎn)化為機(jī)械能,產(chǎn)生協(xié)調(diào)的定向運(yùn)動(dòng)而做功.眾多的分子馬達(dá)中,驅(qū)動(dòng)蛋白由于其特有的動(dòng)力學(xué)特性引起了人們的廣泛興趣.為了理解kinesin的運(yùn)動(dòng)機(jī)制,考慮到電相互作用在生物分子之間影響的重要性,我們提出化學(xué)——電學(xué)——力學(xué)這樣一個(gè)3個(gè)過程耦合的模型,來解釋kinesi

2、n的運(yùn)動(dòng)過程.我們認(rèn)為kinesin通過各部分巧妙的配合,利用ATP結(jié)合和水解的過程中電荷分布的變化,充分利用電勢(shì)能做功從而實(shí)現(xiàn)其高效率的運(yùn)動(dòng).為了對(duì)馬達(dá)在運(yùn)動(dòng)過程中的特性進(jìn)行定量的分析,我們發(fā)展了一種特殊的方法來解決利用Gaussian03對(duì)大分子進(jìn)行計(jì)算時(shí)遇到的斷口問題,并對(duì)kinesin的頭部和微管進(jìn)行了計(jì)算,得到了Mulliken電荷分布等信息.這些結(jié)果給出了一個(gè)近似的估計(jì),即用Gaussian03計(jì)算生物大分子時(shí),用分割計(jì)算的

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