草果遺傳多樣性分析及其混淆品的ITS序列差異比較研究.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:草果Amomum tsaoko Crevost et Lemaire為姜科豆蔻屬多年生草本植物,果實(shí)為常用中藥材。對(duì)草果SSR分子標(biāo)記進(jìn)行研究,獲得草果SSR多態(tài)性引物和遺傳多樣性信息,為草果優(yōu)良種源的篩選奠定基礎(chǔ);探尋草果與擬草果分子鑒別方法,為草果及其混淆品的分子鑒別奠定基礎(chǔ)。
   方法:(1)利用磁珠富集法對(duì)草果基因組中的微衛(wèi)星序列進(jìn)行篩選分離,構(gòu)建草果微衛(wèi)星富集文庫(kù),得到草果微衛(wèi)星序列,運(yùn)用Primer Prim

2、er5.0軟件進(jìn)行分析設(shè)計(jì)引物,利用聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)引物多態(tài)性,最后選取多態(tài)性引物對(duì)草果進(jìn)行遺傳多樣性分析(2)利用ITS分子標(biāo)記對(duì)草果和混淆品擬草果A.paratsaokoS.Q.TongetY.M.Xia進(jìn)行ITS分析,根據(jù)測(cè)序結(jié)果用生物信息學(xué)軟件(CExpress)進(jìn)行序列比對(duì),用MEGA軟件將CExpress產(chǎn)生的比對(duì)結(jié)果以鄰近法(Neighbor Joining)模型生成系統(tǒng)樹(shù),揭示兩者遺傳結(jié)構(gòu)的差異。
   結(jié)

3、果:(1)用開(kāi)發(fā)出來(lái)的7對(duì)SSR引物對(duì)草果5個(gè)居群35個(gè)體進(jìn)行遺傳多樣性分析,在物種水平上,7對(duì)SSR多態(tài)性引物共檢測(cè)到15個(gè)等位基因,基于15個(gè)等位基因獲得的遺傳多樣性的結(jié)果顯示:觀測(cè)雜合度(Ho)的變化范圍為0.0000~0.4000,平均值為0.3020;期望雜合度的值(He)變化范圍為0.2273~0.6704,平均值為0.3936;Shannon多樣性指數(shù)變化范圍為0.3837~1.0895,平均值為0.6012,Nei遺傳多

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