錐栗遺傳多樣性SRAP分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、錐栗為殼斗科栗屬植物,是我國重要的木本糧食樹種。我國長江以南錐栗資源豐富,自然分布廣,類型多樣,但大多資源處于野生狀態(tài),遺傳背景復雜。為充分挖掘利用錐栗野生種質資源和科學合理評價現(xiàn)有品種資源,本文應用SRAP分子標記方法,以湖南野生錐栗資源為主,對采自湖南、浙江、四川、貴州、福建五省的17份野生錐栗居群資源及23個錐栗栽培品種進行了遺傳多樣性分析,旨在為錐栗遺傳背景分析和種質創(chuàng)新提供依據(jù)。主要研究結果如下:
  1、建立了適用于錐

2、栗的SRAP-PCR最佳反應體系:總體積20μL時,模板DNA濃度40ng,Taq酶濃度2.0U,Mg2+濃度1.8mmol/L,dNTP濃度0.28mmol/L,引物濃度0.6μmol/L。
  2、篩選出適合錐栗SRAP遺傳多樣性分析的引物。利用10個隨機挑選出的模板從100個引物組合中篩選出15個擴增條帶清晰、穩(wěn)定性好、多態(tài)性高的引物組合,即Em1-Me2、Em1-Me3、Em2-Me1、Em2-Me2、Em2-Me3、Em

3、3-Me2、Em3-Me5、Em5-Me2、Em7-Me1、Em7-Me3、Em9-Me7、Em9-Me9、Em9-Me10、Em10-Me6、Em10-Me10。
  3、17個野生錐栗居群的SRAP遺傳多樣性分析表明野生錐栗遺傳多樣性豐富,是錐栗種質創(chuàng)新的重要來源。
  本研究利用篩選出的15個引物組合,對17個野生錐栗居群的221個樣本進行擴增,共擴增出221個位點,平均多態(tài)位點數(shù)為155.06,多態(tài)百分率為70.16

4、%。總遺傳多樣性指數(shù)(Ht)、居群內遺傳多樣性指數(shù)(Hs)、Nei's基因多樣性指數(shù)、Shannon's信息指數(shù)分別為0.3636、0.2466、0.2460、0.3677,說明野生錐栗居群具有較高的遺傳多樣性和變異度。其中,衡山(HS)居群的多態(tài)率最高,為85.07%,吉首小溪村(JS)居群次之,為83.26%,表明衡山、湘西一帶為湖南省野生錐栗居群遺傳多樣性最豐富的區(qū)域。17個居群間基因分化系數(shù)(Gst)為0.3217,基因流(Nm

5、*)為1.0541,反映出種級水平上有67.83%的遺傳變異存在于居群內部,居群基因交流頻繁。
  UPGMA聚類分析表明,瀏陽溪江居群和衡山居群間的遺傳相似性最大,親緣關系最近;貴州黎平居群和岳陽月田鎮(zhèn)居群間的遺傳相似性最小,表明它們的親緣關系最遠,遺傳差異較大。
  4、23個錐栗品種的SRAP遺傳多樣性分析:
  利用篩選出的15個引物組合,對23個錐栗品種進行擴增,擴增出來的片段大小主要在150~2500bp之

6、間,共擴增出221個位點,多態(tài)位點有197個,占比89.14%,說明錐栗品種間具有較高的遺傳多樣性水平。23個錐栗品種的遺傳相似性系數(shù)在0.66~0.85之間,且在遺傳相似性系數(shù)為0.66處,大尖嘴單獨聚為一類,反映出它的遺傳基礎與其他品種具有較大的差異;在遺傳相似性系數(shù)最大處,華栗2號和鐵錐被聚為一類,表明這兩個品種親緣關系最近,遺傳差異最小。
  此外,本研究還構建了Em1-Me2、Em2-Me1、Em2-Me2和Em2-Me

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