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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
本研究以sub-MIC ERY為干預(yù)因素,以臨床分離不同ERY耐藥表型的S.epidermidis菌株為研究對(duì)象,首先進(jìn)行生物膜形成能力的檢測(cè)和亞抑菌濃度ERY對(duì)其生物膜形成的影響,并進(jìn)一步分析其與細(xì)菌ERY耐藥特征的關(guān)系,同時(shí)考察菌株P(guān)IA合成、icaA基因的轉(zhuǎn)錄以及其上游調(diào)控因子sarA、ica及LuxS/AI-2群體感應(yīng)系統(tǒng)的變化情況,以明確ERY耐藥特征及PIA上游調(diào)控因子與sub-MIC ERY影響S.epi
2、dermidis菌株生物膜形成的可能關(guān)系。
方法:
第一部分 亞抑菌濃度紅霉素對(duì)臨床分離表皮葡萄球菌生物膜形成的影響及其與細(xì)菌紅霉素耐藥表型的關(guān)系研究
1.1、對(duì)臨床分離菌株最小抑菌濃度(MIC值)的測(cè)定
采用“標(biāo)準(zhǔn)瓊脂平板倍比稀釋法”,以標(biāo)準(zhǔn)菌株S.aureus ATCC29213TM作為質(zhì)控菌株,結(jié)果判讀參照“2010版實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(Clinical and Laboratory Stan
3、dards Institute,CLSI)”的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行,測(cè)定96株臨床分離S.epidermidis菌株的MIC值。
1.2、細(xì)菌生物膜形成的觀察方法
采用結(jié)晶紫染色法觀察1/4 MIC ERY對(duì)S.epidermidis菌株生物膜形成的影響并統(tǒng)計(jì)分析1/4 MIC ERY作用下S.epidermidis菌株生物膜形成能力的改變與ERY耐藥表型的相關(guān)性。
根據(jù)實(shí)驗(yàn)室前期研究結(jié)果和文獻(xiàn)報(bào)道,課題設(shè)定臨床分離S
4、.epidermidis菌株的生物膜OD值≥2倍標(biāo)準(zhǔn)菌株S.epidermidis ATCC12228TM的生物膜OD值,則認(rèn)為該菌株具有生物膜形成能力。1/4 MIC ERY對(duì)臨床分離S.epidermidis菌株生物膜形成的影響分為誘導(dǎo)、抑制或者不受影響三種類型,其區(qū)分標(biāo)準(zhǔn)如下:t檢驗(yàn)比較各菌株ERY組與TSB對(duì)照組的生物膜OD值是否存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。如果p<0.05且ERY組的OD值大于TSB組的OD值,則認(rèn)為該菌株生物膜形成發(fā)生了
5、誘導(dǎo)現(xiàn)象;如果p<0.05且ERY組的OD值小于TSB組的OD值,則認(rèn)為該菌株生物膜形成發(fā)生了抑制現(xiàn)象;如果p>0.05,則認(rèn)為該菌株生物膜形成未發(fā)生變化。
第二部分 臨床分離表皮葡萄球菌大環(huán)內(nèi)酯類耐藥基因分布及1/4最小抑菌濃度紅霉素作用下erm基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)研究
2.1、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法(PCR)鑒定臨床分離菌株大環(huán)內(nèi)酯類耐藥基因
采用PCR法檢測(cè)96株臨床分離S.epidermidis菌株中ermA,
6、ermB及ermC基因的分布情況,并對(duì)其中分布最廣的ermC基因進(jìn)行序列測(cè)定和同源性分析。
2.2、1/4最小抑菌濃度紅霉素作用下實(shí)驗(yàn)菌株ermC基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平的時(shí)間-效應(yīng)考察
采用real time RT-PCR方法,考察與1/4 MIC ERY共同孵育0.5 h、2h、6h、12h和24 h,實(shí)驗(yàn)菌株SH04和SH10的ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平受其影響的情況,分析ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平變化與1/4 MIC
7、 ERY對(duì)實(shí)驗(yàn)菌株生物膜形成影響的可能關(guān)系。
2.3、ermC基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平與生物膜形成能力的相關(guān)性分析
根據(jù)ermC基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的時(shí)間-效應(yīng)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,隨機(jī)抽取生物膜形成受1/4 MICERY抑制、誘導(dǎo)和不受其影響三種表型的菌株各8-9株,采用real time RT-PCR方法,考察與1/4 MIC ERY共同孵育2h,各菌株ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)情況,分析該因素與1/4 MIC ERY作用下S.epidermi
8、dis菌株生物膜OD值與無(wú)ERY作用下S.epidermidis菌株生物膜OD值的比率之間的可能關(guān)系。
結(jié)果:
第一部分 亞抑菌濃度紅霉素對(duì)臨床分離表皮葡萄球菌菌株生物膜形成的影響及其與細(xì)菌紅霉素耐藥表型的關(guān)系研究
1、臨床分離表皮葡萄球菌菌株的紅霉素耐藥情況
96株臨床分離S.epidermidis中,85株為ERY耐藥(MIC≥8 mg/L)菌株,耐藥率為88.5%。其中15株MIC值在8~1
9、28 mg/L范圍內(nèi),70株MIC值≥128 mg/L。
2、1/4最小抑菌濃度紅霉素對(duì)臨床分離表皮葡萄球菌生物膜形成的影響
結(jié)果顯示,96株臨床分離S.epidermidis菌株均可形成生物膜。生物膜形成受1/4 MICERY影響的菌株共27株,且都是ERY耐藥菌株。其中4株生物膜形成發(fā)生了抑制現(xiàn)象(p<0.05),23株生物膜形成發(fā)生了誘導(dǎo)現(xiàn)象(p<0.05)。生物膜誘導(dǎo)菌株中,18株的生物膜誘導(dǎo)程度在1.11-
10、2.0倍之間,5株的生物膜誘導(dǎo)程度大于2倍。其余58株ERY耐藥株及11株ERY敏感株的生物膜形成均未受1/4 MIC ERY的明顯影響。統(tǒng)計(jì)學(xué)分析發(fā)現(xiàn),1/4 MIC ERY對(duì)臨床分離S.epidermidis ERY耐藥株和敏感株生物膜形成的影響不同,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=4.861,p=0.031),提示1/4 MIC ERY作用下,臨床分離S.epidermidis菌株生物膜形成與菌株的ERY耐藥表型相關(guān)。
3、體外
11、誘導(dǎo)耐藥結(jié)果及1/4最小抑菌濃度紅霉素對(duì)誘導(dǎo)耐藥前后菌株生物膜形成的影響
11株臨床分離ERY敏感S.epidermidis菌株均被成功誘導(dǎo)成ERY耐藥菌株,誘導(dǎo)耐藥后的MIC值分布在16~256μg/ml范圍。平行考察1/4 MIC ERY作用下,11株ERY敏感S.epidermidis菌株及其誘導(dǎo)耐藥后菌株生物膜的形成情況,結(jié)果顯示:誘導(dǎo)耐藥后S.epidermidis菌株SH22、SH51和SH67的ERY組生物膜OD
12、值與其對(duì)照組比較,明顯升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05);誘導(dǎo)耐藥后S.epidermidis菌株SH40、SH46、SH52和SH77的ERY組生物膜OD值與其對(duì)照組比較,明顯降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05)。原11株ERY敏感S.epidermidis菌株ERY組生物膜OD值與其對(duì)照組比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p>0.05)。
第二部分 臨床分離表皮葡萄球菌大環(huán)內(nèi)酯類耐藥基因分布及1/4最小抑菌濃度紅霉素作用下er
13、m基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)研究
1、96株臨床分離表皮葡萄球菌ermA、ermB及ermC基因的分布情況
96株S.epidermidis菌株ermC基因的陽(yáng)性擴(kuò)增率為94.8%(91/96); ermA及ermB基因的陽(yáng)性擴(kuò)增率均為6.2%(6/96)。統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果提示,各基因的分布情況在生物膜形成不同影響類型臨床分離S.epidermidis菌株之間無(wú)差異(p>0.05)。其中ermC基因在生物膜形成發(fā)生抑制、誘導(dǎo)和不受
14、影響的S.epidermidis菌株中分布率分別為:100%、95.7%和94.2%。將各菌株擴(kuò)增出的ermC基因產(chǎn)物進(jìn)行堿基序列測(cè)定,并將測(cè)得的堿基序列在Pubmed NCBI基因庫(kù)中進(jìn)行同源序列比對(duì),結(jié)果各菌株測(cè)得的堿基序列與NCBI基因庫(kù)中的同源序列比較,同源性達(dá)99%,未發(fā)現(xiàn)有意義的突變位點(diǎn)。
2、實(shí)驗(yàn)菌株ermC基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平的時(shí)間-效應(yīng)結(jié)果
對(duì)臨床分離S.epidermidis菌株SH04和SH10 e
15、rmC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平進(jìn)行時(shí)間-效應(yīng)考察發(fā)現(xiàn):在0.5 h、2h和12 h時(shí)間點(diǎn),生物膜抑制菌株SH04的ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)發(fā)生明顯抑制(p<0.05);在6h時(shí)間點(diǎn),該菌株ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)發(fā)生明顯誘導(dǎo)(p<0.05);在24 h時(shí)間點(diǎn),該菌株ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)發(fā)生抑制,但與對(duì)照組比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p>0.05)。在0.5 h、2h和6h時(shí)間點(diǎn),生物膜誘導(dǎo)菌株SH10的ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)發(fā)生顯著誘導(dǎo)(p<0.0
16、5);在12h和24 h時(shí)間點(diǎn),該菌株ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)均發(fā)生抑制,但孵育12h,ERY組ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)與對(duì)照組比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p>0.05);而孵育24 h,ERY組ermC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)顯著低于對(duì)照組(p<0.05)。
結(jié)論:
1、1/4 MIC ERY對(duì)臨床分離ERY耐藥S.epidermidis菌株生物膜形成可產(chǎn)生誘導(dǎo)和抑制兩種相反的作用。
2、ERY耐藥表型與1/4 MIC E
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