IL-2Rα基因負調(diào)控元件(NRE-NIRS)相關(guān)結(jié)合蛋白的篩選及其功能的初步研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究首先采用質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染和競爭性RT-PCR方法對本組從HTLV-I活化的人外周血T淋巴細胞MATCHMAKERcDNA文庫中篩選到的NRE結(jié)合蛋白ITF2B在Jurkat細胞、B3D5細胞及BJAB細胞中對IL-2Rα基因的啟動子活性的影響進行了研究,并應用染色質(zhì)免疫沉淀(ChromatinImmunoprecipitation,ChIP)技術(shù)對ITF2B在Jurkat細胞中與IL-2Rα基因啟動子區(qū)染色質(zhì)的結(jié)合狀態(tài)進行了研究;其次,

2、應用酵母單雜交體系從HTLV-1活化的人外周血T淋巴細胞MATCHMAKERcDNA文庫中篩選得到了四個潛在的NIRS結(jié)合蛋白。對潛在的NIRS結(jié)合蛋白,先用凝膠遷移率變更實驗(Electrophoresismobilityshiftassay,EMSA)證實了其中三個在體外能與NIRS序列特異結(jié)合,采用質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染和競爭性RT-PCR方法研究了NFκBactivatingprotein和TTF-I△N320對IL-2Rα基因的啟動子活性

3、的影響。為了更明確NRE和NIRS元件在IL-2Rα基因調(diào)控中的作用,我們還對NRE和NIRS的核心序列進行了定點突變,并構(gòu)建了帶不同IL-2Rα基因啟動子(野生型和不同突變型)的報告基因質(zhì)粒。 一、NIRS樣元件結(jié)合蛋白的篩選、同源性分析及DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域分析以合成的NIRS四聯(lián)體序列介導的報告質(zhì)粒為“誘餌”,應用酵母單雜交體系從HTLV-1活化的人外周血T淋巴細胞MATCHMAKERcDNA文庫中篩選到了四個潛在的NIRS

4、的結(jié)合蛋白。BLASTN和BLASTP分析表明,1號陽性克隆(1#)的插入片段與人transposon-derivedBusterltransposase-likeprotein基因cDNA有99%的同源性,編碼的多肽與相應的蛋白質(zhì)的一致性為96%;2號陽性克隆(2#)的插入片段與人的Ku抗原(70kD)(Homosapiensthyroidautoantigen70kDa(Kuantigen))cDNA有100%的同源性,編碼的多肽與

5、相應的蛋白質(zhì)的一致性為96%;4號陽性克隆(4#)的插入片段與人RNA聚合酶Ⅰ的轉(zhuǎn)錄終止因子(Homosapienstranscriptionterminationfactor,RNApolymeraseⅠ(TTF-Ⅰ))的cDNA有99%的同源性;編碼的多肽與相應的蛋白質(zhì)的一致性為87%;24號陽性克隆(24#)的插入片段與人一個可能的NFkB激活蛋白(HomosapiensputativeNFkBactivatingprotein)

6、cDNA有99%的同源性;編碼的多肽與相應的蛋白質(zhì)的一致性為92%。 對插入片段編碼的多肽序列可能的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域進行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn):編碼與Ku抗原C-端330個氨基酸殘基同源的克隆(2#)含有兩個保守的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域:Ku78和SAP結(jié)構(gòu)域;編碼與RNA聚合酶Ⅰ的轉(zhuǎn)錄終止因子(TTF-Ⅰ)C-端582個5氨基酸殘基同源的克隆(4#)含有兩個保守的SANT結(jié)構(gòu)域。SAP結(jié)構(gòu)域和SANT結(jié)構(gòu)域都是DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,它們的功能

7、和染色質(zhì)重塑有關(guān)。 二、NIRS結(jié)合蛋白功能的初步研究1.NIRS結(jié)合蛋白與NIRS序列的體外結(jié)合活性我們將三個陽性克隆(Ku70△N284,TTF-I△N320,NFκBAP△N342)的插入片段克隆到真核表達載體pcDNA6/Flag中構(gòu)建真核表達質(zhì)粒。Western印跡檢測的結(jié)果表明,這些真核表達質(zhì)粒轉(zhuǎn)入HeLa細胞后可表達帶Flag標簽的融合蛋白。用表達了融合蛋白的全細胞抽提物與32P標記的帶NIRS樣元件的寡核苷酸探

8、針做凝膠遷移率變更實驗,結(jié)果表明,三個陽性克隆插入片段的融合蛋白在體外均能與NIRS樣元件特異結(jié)合。 2.NIRS結(jié)合蛋白TTF-I△N320對IL-2Rα基因啟動子活性的影響TTF-I△N320為TTF-I的截短形式,其C-末端含有兩個SANT結(jié)構(gòu)域。將其真核表達質(zhì)粒與不同的IL-2Rα基因啟動子(野生型,NRE突變,NIRS突變或雙突變)驅(qū)動的報告基因質(zhì)粒及內(nèi)參照質(zhì)粒pM-CAT瞬時共轉(zhuǎn)染Jurkat細胞,然后用競爭性RT

9、-PCR方法分析IL-2Rα基因啟動子活性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),TTF-I△N320可明顯地降低野生型和NRE突變的IL-2Rα基因啟動子活性,而對NIRS突變或雙突變的IL-2Rα基因啟動子活性沒有影響。這提示TTF-I△N320對IL-2Rα基因啟動子活性的負調(diào)控作用依賴NIRS的存在。 3.NIRS結(jié)合蛋白NFκBactivatingprotein對IL-2Rα基因啟動子活性的影響將真核表達質(zhì)粒pcDNA6/Flag-NFκBAP

10、與不同的IL-2Rα基因啟動子驅(qū)動的報告基因質(zhì)粒及內(nèi)參照質(zhì)粒pM-CAT瞬時共轉(zhuǎn)染Jurkat細胞,然后應用競爭性RT-PCR方法分析IL-2Rα基因啟動子活性。結(jié)果顯示,NFκBactivatingprotein對IL-2Rα基因野生型或不同突變型啟動子組成性活性都沒有明顯的影響,而且對其PHA的誘導活性也沒有明顯的影響。這提示NFκBactivatingprotein可能對IL-2Rα基因啟動子活性沒有影響。 三、NRE結(jié)

11、合蛋白ITF2B對IL-2Rα基因啟動子活性的影響1.ITF2B在Jurkat細胞中對IL-2Rα基因啟動子活性的影響將ITF2B表達質(zhì)粒分別與受IL-2Rα基因轉(zhuǎn)錄起始點上游不同長度(4k、1.6k、0.5k、0.5kmNRE(NRE核心序列突變)和0.3k)啟動子序列驅(qū)動的報告基因質(zhì)粒(pREP4m-4k-CAT,pREP4m-1.6k-CAT,pREP4m-0.5k-CAT,pREP4m-0.5kmNRE-CAT,pREP4m-0

12、.3k-CAT)及內(nèi)參照質(zhì)粒pM-CAT瞬時共轉(zhuǎn)染Jurkat細胞,然后應用競爭性RT-PCR方法分析IL-2Rα基因啟動子活性。結(jié)果顯示,在Jurkat細胞中ITF2B蛋白可使4k,1.6k,0.5k啟動子的組成性活性降低50%,而對NRE突變或NRE刪除的IL-2Rα基因的啟動子活性沒有明顯的影響。這說明在Jurkat細胞中ITF2B可負調(diào)控IL-2Rα基因的啟動子活性,而且這種負調(diào)控作用是NRE依賴的。 2.ITF2B在

13、B3D5細胞中對IL-2Rα基因啟動子活性的影響將ITF2B表達質(zhì)粒與IL-2Rα基因不同長度啟動子序列驅(qū)動的報告基因質(zhì)粒及內(nèi)參照質(zhì)粒pM-CAT瞬時共轉(zhuǎn)染B3D5細胞,然后應用競爭性RT-PCR方法分析IL-2Rα基因啟動子活性。結(jié)果顯示,在B3D5細胞中ITF2B蛋白可使4k,1.6k,0.5k啟動子的組成性活性降低50%,而對NRE突變或NRE刪除的IL-2Rα基因的啟動子活性沒有明顯的影響。這說明在B3D5細胞中ITF2B可負調(diào)

14、控IL-2Rα基因的啟動子組成性活性,而且這種負調(diào)控作用是NRE依賴的。 3.ITF2B在BJAB細胞中對IL-2Rα基因啟動子活性的影響將ITF2B表達質(zhì)粒與受IL-2Rα基因不同長度啟動子序列驅(qū)動的報告基因質(zhì)粒和內(nèi)參照質(zhì)粒pM-CAT瞬時共轉(zhuǎn)染BJAB細胞,然后應用競爭性RT-PCR方法分析啟動子活性。結(jié)果顯示,與轉(zhuǎn)染空載體的對照組相比,ITF2B在BJAB細胞中對IL-2Rα基因啟動子活性沒有明顯影響。 在Ju

15、rkat細胞中,IL-2Rα基因呈組成性表達,而且可被很多刺激因子誘導表達;B3D5細胞為一由EB病毒轉(zhuǎn)化可表達IL-2Rα鏈的的B細胞株;BJAB細胞是不表達IL-2Rα鏈的B淋巴細胞。ITF2B在Jurkat和B3D5細胞中可以明顯地降低IL-2Rα基因啟動子的組成性活性,而在BJAB細胞中則不起作用。說明這種負調(diào)控作用具有細胞特異性,負調(diào)控作用的發(fā)揮依賴NRE的存在。 4.ITF2B在Jurkat細胞中對IL-2Rα基因

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